New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 659912 = | 87 (1.210) | 6 (0.090) | 5/250 | NT | 7.2% | coding (958/1914 nt) | speA | biosynthetic arginine decarboxylase |
? | NC_002947 | 660014 = | 74 (1.110) | coding (1060/1914 nt) | speA | biosynthetic arginine decarboxylase |
AAGGAAGCCATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAACACAACGACGA > NC_002947/659765‑660057 | aaGGAAGCCATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGTCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCgg > 8:184033/1‑149 (MQ=255) ggAAGCCATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCg > 6:277490/1‑149 (MQ=255) agtaggtctcggtgaccatctcgatgtcggtcgggccaagcaggtcgaccagccactgcacggtctcgggcagggcttccttgttctcgatggtcggtacgtcgtcgttgtgtttctcgacgtcggtcacctggatcaccagcatGGCg > 7:345580‑M1/146‑149 (MQ=255) gtaggtctcggtgaccatctcgatgtcggtcgggccaagcaggtcgaccagccactgcacggtctcgggcagggcttccttgttctcgatggtcggtacgtcgtcgttgtgtttctcgacgtcggtcacctggatcaccagcatGGCgt < 2:331597‑M1/5‑1 (MQ=255) aggtctcggtgaccatctcgatgtcggtcgggccaagcaggtcgaccagccactgcacggtctcgggcagggcttccttgttctcgatggtcggtacgtcgtcgttgtgtttctcgacgtcggtcacctggatcaccagcatGGCgtgg < 2:388443‑M1/7‑1 (MQ=255) ggtctcggtgaccatctcgatgtcggtcgggccaagcaggtcgaccagccactgcacggtctcgggcagggcttccttgttctcgatggtcggtacgtcgtcgttgtgtttctcgacgtcggtcacctggatcaccagcatGGTgtgg > 1:116064‑M1/142‑148 (MQ=255) gCCATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtggt < 5:228211/149‑1 (MQ=255) gCCATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtggt < 8:295759/149‑1 (MQ=255) ccATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtggtg > 1:62111/1‑149 (MQ=255) aTCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtggtggt > 3:329676/1‑149 (MQ=255) aTCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtggtggt > 6:185807/1‑149 (MQ=255) aTCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtg < 3:138283/144‑1 (MQ=255) aTCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCgtg > 4:138283/1‑144 (MQ=255) cGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACCTGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTggg < 6:101765/149‑1 (MQ=255) cGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTggg < 4:368621/149‑1 (MQ=255) cGTTATTACGGCGAAATGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGtggtggtgg < 6:351751/148‑1 (MQ=255) gTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTggg > 7:100797/1‑148 (MQ=255) attaCGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATg > 5:408988/1‑149 (MQ=255) 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< 6:164434/125‑1 (MQ=255) tACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACAtctt > 5:164434/1‑125 (MQ=255) cgacgGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGAcc < 8:5630/148‑1 (MQ=255) ctgCACACACTAGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTAAGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGCGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCgcgc < 4:23464/147‑1 (MQ=255) aCTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGcc < 1:44761/149‑1 (MQ=255) cgtcgtcgttgtgtttctcgacgtcggtcacctggatcaccagcatGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGcc > 4:61504‑M1/47‑148 (MQ=255) 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ccAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATc > 4:27729/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCCCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATc > 3:138921/1‑148 (MQ=255) gCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAg < 6:399170/149‑1 (MQ=255) gATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGt < 2:62111/147‑1 (MQ=255) gATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGa > 2:48526/1‑149 (MQ=255) tCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAgg > 4:265213/1‑144 (MQ=255) tCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAgg < 3:265213/144‑1 (MQ=255) aCTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAg > 3:298016/1‑140 (MQ=255) aCTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAg < 4:298016/140‑1 (MQ=255) aCTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGAc > 1:350099/1‑149 (MQ=255) cGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTc > 1:138813/1‑148 (MQ=255) cGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTc > 1:133512/1‑148 (MQ=255) cGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTc < 2:133351/148‑1 (MQ=255) cATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCgaga < 4:384750/149‑1 (MQ=255) cATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCgag > 7:365745/1‑148 (MQ=255) cATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCgag > 3:356350/1‑148 (MQ=255) aTGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAg < 6:349514/132‑1 (MQ=255) aTGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAg > 5:349514/1‑132 (MQ=255) aTGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGaa < 2:133512/149‑1 (MQ=255) aTGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGaa < 2:138813/149‑1 (MQ=255) gacgacTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAaca < 2:350099/149‑1 (MQ=255) gacgacTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAac < 3:27729/148‑1 (MQ=255) acgacTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAaca > 2:75607/1‑148 (MQ=255) gacTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAACACaa > 8:209543/1‑149 (MQ=255) acTACGCCGGCGTGGTGGTGGACATGCTCGAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAACACAac < 2:170243/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAACACAacgacga < 1:48526/149‑1 (MQ=255) | AAGGAAGCCATCCGTTATTACGGCGAACTGCGTGCGCTGGGCCTGCCGGTCGACCACATCGACGTGGGTGGCGGCCTGGGTGTGGACTACGACGGCACCCACTCGCGCAATGCCAGCTCGATCAACTACGACATGGACGACTACGCCGGCGTGGTGGTGGGCATGCTCAAGGAGTTCTGCGACGCGCAGGGCTTGCCGCACCCGCACATCTTCTCCGAGAGTGGCCGTTCGCTGACCGCGCACCACGCCATGCTGGTGATCCAGGTGACCGACGTCGAGAAACACAACGACGA > NC_002947/659765‑660057 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |