New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GTTCGTCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCG > NC_002947/664421‑664716 | gTTCGTCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCC > 3:393239‑M1/1‑148 (MQ=255) tCGTCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTCATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCg < 1:259841/148‑1 (MQ=255) tCGTCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACAAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAg > 2:304636/1‑149 (MQ=255) tCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACATCCTGCCCGAgcgc > 1:369361/1‑149 (MQ=255) tCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACT‑GCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGcc > 3:250702/1‑149 (MQ=255) gggAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCg > 2:390302/1‑141 (MQ=255) gggAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCg < 1:390302/141‑1 (MQ=255) gAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCATGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGgc > 4:325366/1‑149 (MQ=255) aGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGgcgc > 1:282004/1‑149 (MQ=255) ccGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCACCTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTg < 4:240646/149‑1 (MQ=255) ccGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTg < 2:282004/149‑1 (MQ=255) ccGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTg < 4:364966/149‑1 (MQ=255) gACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCCCCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGCCCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTACTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTg > 7:190129/1‑147 (MQ=255) gACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTg > 8:134447/1‑147 (MQ=255) aCAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAg < 6:95938/149‑1 (MQ=255) aCAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAg > 1:265203/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTc > 2:345130/1‑147 (MQ=255) aTGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAg > 7:88345‑M2/1‑148 (MQ=255) 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tACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACAcc > 5:216056/1‑149 (MQ=255) gTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaacga < 7:92690‑M1/149‑44 (MQ=255) gTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaac > 8:92690‑M1/1‑106 (MQ=255) ttGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGAGTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTc < 5:4896/149‑1 (MQ=255) ttGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTACTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTc > 3:201762/1‑149 (MQ=255) 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gAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCgg > 4:226534/1‑149 (MQ=255) aTTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCg < 1:352857/146‑1 (MQ=255) aTTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCg > 2:352857/1‑146 (MQ=255) aTTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTc < 3:351963/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGt > 3:336974/1‑147 (MQ=255) ccTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAgg > 1:27972/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAg < 7:81665/148‑1 (MQ=255) tCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaac < 7:92690‑M2/149‑107 (MQ=255) tCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGACTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTAGCAGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGAACCCGCCTGAGCGGTCAGGcc > 6:232949/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCt < 2:60520/148‑1 (MQ=255) gAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGGCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATg > 2:233986/1‑148 (MQ=255) gAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATg > 3:369850/1‑148 (MQ=255) aaGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGt < 7:131908/148‑1 (MQ=255) aGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTAc > 8:52005/1‑149 (MQ=255) gACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattg < 5:412227‑M2/149‑115 (MQ=255) cTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattgg < 3:27864‑M2/148‑116 (MQ=255) ttCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattggta < 2:142537‑M2/149‑118 (MQ=255) tGCCCttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattggtacaag > 5:373035‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCCttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggttttggtactagc > 6:117509‑M1/1‑4 (MQ=255) cccttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattggtacaagc > 4:130838‑M1/1‑3 (MQ=255) cccGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTgcg > 3:398724/1‑149 (MQ=255) ccttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattggtacaagcca < 2:246013‑M1/149‑148 (MQ=255) cttgagctccagcgccaggcgctcgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattggtacaagccat > 7:88345‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTTCGTCTGGGAAGCCGACAGCAATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCT‑ATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCG > NC_002947/664421‑664716 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |