| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 664568 | 85 (1.190) | 5 (0.070) | 5/256 | NT | 6.1% | coding (1434/4902 nt) | yfhM | lipoprotein |
| ? | NC_002947 | = 664591 | 73 (1.070) | coding (1457/4902 nt) | yfhM | lipoprotein | |||||
ATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCTGGC > NC_002947/664444‑664739 | aTGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAg > 7:88345‑M2/1‑148 (MQ=255) tGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgg < 2:246013‑M2/149‑3 (MQ=255) gCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAggg > 4:130838‑M2/1‑145 (MQ=255) gCTAGTACCAAAACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggc > 6:117509‑M2/1‑145 (MQ=255) cTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggca > 5:373035‑M2/1‑144 (MQ=255) gTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGgcagc < 2:265203/148‑1 (MQ=255) tACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGgcagca < 1:364868/148‑1 (MQ=255) tACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACAcc > 5:216056/1‑149 (MQ=255) ttGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGAGTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTc < 5:4896/149‑1 (MQ=255) ttGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTACTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTc > 3:201762/1‑149 (MQ=255) gCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGc > 6:213178/1‑149 (MQ=255) cAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGcc < 6:285852/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCgg < 7:134447/149‑1 (MQ=255) tGGCCACCGAGGCCCCGACTGCCCGTTGGCAGTTGATGCTCGACCTGGGTGGCGGCCGCAAGCAGGTCTATGAAATCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCCCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGAt > 8:81665/1‑149 (MQ=255) gAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATgc < 3:110762/149‑1 (MQ=255) ggCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGGGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATgcgc < 8:245604/149‑1 (MQ=255) ggCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTACTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATgcgc < 4:201762/149‑1 (MQ=255) cccGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGgcagc < 5:75416/115‑1 (MQ=255) cccGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGgcagc > 6:75416/1‑115 (MQ=255) 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gCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGcc < 2:182467/149‑1 (MQ=255) tgctgcTCGACCTGGGGGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTAc < 4:318633/149‑1 (MQ=255) ctgctCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACct > 2:40482/1‑149 (MQ=255) ctgctCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGGCAATGGCCGTTAcc > 3:305748/1‑148 (MQ=255) tgctCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACctc > 4:344068/1‑149 (MQ=255) tgctCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACctc > 1:60520/1‑149 (MQ=255) gctCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACctc > 4:188549/1‑148 (MQ=255) gACCTGGGTGGCGGTCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGACGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATgg > 5:413922/1‑149 (MQ=255) gACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTAt < 8:395809/147‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATgcgc > 8:249122/1‑117 (MQ=255) aCCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATgcgc < 7:249122/117‑1 (MQ=255) ccTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTg < 6:225337/149‑1 (MQ=255) gtGGGGGGCGTGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGACTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCTCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTgc < 8:190129/148‑1 (MQ=255) gggTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTgcgc > 3:145051/1‑149 (MQ=255) gggTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTgcgc > 6:135404/1‑149 (MQ=255) gcgggcgCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCGGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGcgccggc < 4:393239/148‑1 (MQ=255) 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aGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTAc > 8:52005/1‑149 (MQ=255) gACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattg < 5:412227‑M2/149‑115 (MQ=255) cTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattgg < 3:27864‑M2/148‑116 (MQ=255) ttCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAgggcaggaagtcttcaacgaggaattcatagacctgcttgcgcccgccacccaggtcgagcagcaactgccaacggccagtcggggcctcggtggccagttgcaactggtattggta < 2:142537‑M2/149‑118 (MQ=255) cccGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTgcg > 3:398724/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAgg < 4:145051/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGc < 2:27972/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGAGCTCAAGAGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCg > 5:401067/1‑148 (MQ=255) gAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGtt > 1:416125/1‑149 (MQ=255) gCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGc < 4:305748/149‑1 (MQ=255) aaGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGGCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCt < 1:233986/147‑1 (MQ=255) aaGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCt < 5:135404/147‑1 (MQ=255) aaGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCTgg < 6:173817/149‑1 (MQ=255) aaGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCTgg < 2:132599/149‑1 (MQ=255) aaGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCTg < 2:369361/148‑1 (MQ=255) aaGGGCAGCAGCACACCGCGTTCGCCGGCGGCAGCTGCGCGTAGCCAGGTCCCTGGCCGTTCCCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTGGCCTgg < 5:232949/149‑1 (MQ=255) aGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCTGGc < 3:234888/149‑1 (MQ=255) | ATGGCTTGTACCAATACCAGTTGCAACTGGCCACCGAGGCCCCGACTGGCCGTTGGCAGTTGCTGCTCGACCTGGGTGGCGGGCGCAAGCAGGTCTATGAATTCCTCGTTGAAGACTTCCTGCCCGAGCGCCTGGCGCTGGAGCTCAAGGGCAGCAGCACACCGCTTTCGCCGGATGAAGATGCGCGTATCCAGGTCAATGGCCGTTACCTCTATGGTGCGCCGGCCGCCGGCAACCGCCTGAGCGGTCAGGCCTATGTACGCCCGCTGCGCGAGGCCGTACCGGCGTTGCCTGGC > NC_002947/664444‑664739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |