New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 916334 | 99 (1.380) | 6 (0.090) | 6/258 | NT | 5.8% | coding (1233/1491 nt) | PP_0798 | GGDEF domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 916420 | 99 (1.440) | coding (1147/1491 nt) | PP_0798 | GGDEF domain‑containing protein |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGC > NC_002947/916188‑916482 | ataccgatGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAgcgcgc < 2:301296/149‑1 (MQ=255) ccgatGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGc < 7:262519/149‑1 (MQ=255) atGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCcatggcca > 1:324723‑M1/1‑141 (MQ=255) atGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAg < 2:161945/149‑1 (MQ=255) atGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAg < 5:92938/149‑1 (MQ=255) atGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAg < 1:163697/149‑1 (MQ=255) tGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAgg < 4:73147/149‑1 (MQ=255) tGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAgg > 2:261648/1‑149 (MQ=255) cTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTc < 1:268328/149‑1 (MQ=255) cTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTc < 3:155336/149‑1 (MQ=255) tcacggtcacggCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTcc > 1:401172/1‑149 (MQ=255) tcacggtcacggCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTcc > 6:258499/1‑149 (MQ=255) tcacggtcacggCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTcc > 2:245450/1‑149 (MQ=255) 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atcatcCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAatgcatg > 5:67914/1‑149 (MQ=255) catcCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAatgcatgc > 8:172958/1‑148 (MQ=255) atcCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCt < 7:101658/149‑1 (MQ=255) atcCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCt > 7:18818/1‑149 (MQ=255) tcCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCcatggccatgccggcggcgaccatgccttgcgc > 6:16947‑M1/1‑114 (MQ=255) tcCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTc > 1:203849/1‑149 (MQ=255) cGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCg < 4:275978/148‑1 (MQ=255) cGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCACAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCt > 7:289315/1‑146 (MQ=255) cGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCACAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCt < 8:289315/146‑1 (MQ=255) gCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGAt > 6:309183/1‑149 (MQ=255) 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cacTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGaa < 3:40508/138‑1 (MQ=255) cacTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGaa > 4:40508/1‑138 (MQ=255) ccTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTccacc < 2:99319/149‑1 (MQ=255) ccTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTccacc < 6:67914/149‑1 (MQ=255) ccTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGCTTGAATGCCTTGAAGTGgtccacgtcca < 1:245450/147‑1 (MQ=255) cTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGgcg < 7:353244‑M2/114‑4 (MQ=255) cTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTccacca > 7:237223/1‑149 (MQ=255) aaaCTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCa < 5:192136/149‑1 (MQ=255) ctcctcCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTa < 6:66258/149‑1 (MQ=255) tccCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGc > 2:144670/1‑149 (MQ=255) tccCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGc > 7:336540/1‑149 (MQ=255) tccCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGc > 7:391309/1‑149 (MQ=255) cccACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGc > 1:17782/1‑147 (MQ=255) cccACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGc < 5:431706/147‑1 (MQ=255) caccaTAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGgcgctatggtggggaggagtttcaggtagtgttgccagaaaccgatctggcc < 5:16947‑M2/149‑53 (MQ=255) caTAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGgcgctatggtggggaggagtttcaggtagtgttgccagaaaccgatctggccggg < 5:379403‑M2/149‑56 (MQ=255) aTAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCt < 1:54778/149‑1 (MQ=255) tAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCa < 7:147660/133‑1 (MQ=255) tAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCa > 8:147660/1‑133 (MQ=255) aGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTa > 4:186438/1‑149 (MQ=255) gcgccatggccatgccggcggcgaccatgccttgcgcgaggtggccaaggccatcgaggcatgcattcgtcgccctgcggacctggctgcgcgctatggtggggaggagtttcaggtagtgttgccagaaaccgatctggccggggcc > 8:94187‑M1/1‑4 (MQ=255) cgcgcAGCCAGGTCCGCAGGGCGAGGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACg < 2:182457/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACg < 5:171526/149‑1 (MQ=255) cgccatggccatgccggcggcgaccatgccttgcgcgaggtggccaaggccatcgaggcatgcattcgtcgccctgcggacctggctgcgcgctatggtggggaggagtttcag > 8:353244‑M1/1‑3 (MQ=255) cgcAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCACGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGc > 2:393453/1‑149 (MQ=255) ccatggccatgccggcggcgaccatgccttgcgcgaggtggccaaggccatcgaggcatgcattcgtcgccctgcggacctggctgcgcgctatggtggggaggagtttcaggtagtgttgccagaaaccgatctggccggggcccagc < 1:99319‑M1/149‑149 (MQ=255) | ATACCGATGCTCACGGTCACGGCGTGGGCATCATCCGCAAACGGCGCCAGCGCCTCGACGTTGGCTCGGATGCGTTCAGCCAGTAGCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGC > NC_002947/916188‑916482 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |