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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
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gcgcAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGcggcgg < 6:193401/148‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGt < 6:201663/149‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGt > 2:2478/1‑149 (MQ=255) cgcAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGtt < 2:17782/149‑1 (MQ=255) cAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTgg < 6:336026/149‑1 (MQ=255) ggCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggcca < 8:336540/149‑1 (MQ=255) ggCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggc > 3:218610/1‑147 (MQ=255) gTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggccaggcca < 1:104930/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGgccaggccag > 4:217107/1‑149 (MQ=255) tCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGt > 7:244999/1‑149 (MQ=255) cgccgcCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTc < 1:268547/149‑1 (MQ=255) gccgccGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGt > 1:95130/1‑147 (MQ=255) catggccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCg < 6:357512/149‑1 (MQ=255) tggccatggcgctatggtggggaggagtttcaggtagtgttgccagaaaccgatctggccggggcccagctactggctgaacgcatccgagccaacgtcgaggcgctggcgccgtttgcggatgatgcccacgccgtgaccgtgagcat > 1:324723‑M2/1‑8 (MQ=255) tggccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGt < 5:271935/149‑1 (MQ=255) gccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTg > 6:261572/1‑148 (MQ=255) gccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGC‑TACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTgg < 2:57083/148‑1 (MQ=255) ccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTgg > 6:89805/1‑148 (MQ=255) catggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTgg > 4:396675/1‑147 (MQ=255) catggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGaa < 5:89805/149‑1 (MQ=255) | GCTGGGCCCCGGCCAGATCGGTTTCTGGCAACACTACCTGAAACTCCTCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAA > NC_002947/916273‑916565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |