| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATTGCGTGCCGCCTCGGCTTCGCCACCGTGCCACAGCACGGCCTCAAGCAGGTTGCGGGCGCGGCCGTCATGCAGGAACTGGCTATGGCCACTGACCGTTTCGCTCAGGCCGATGCCCCACAGTGGCGGCGTACGCCAGTCCTGGCCGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCTTGG > NC_002947/1052002‑1052296 | aTTGCGTGCCGCCTCGGCTTCGCCACCGTGCCACAGCACGGCCTCAAGCAGGTTGCGGGCGCGGCCGTCATGCAGGAACTGGCTATGGCCACTGACCGTTTCGCTCAGGCCGATGCCCCACAGTGGCGGCGTACGCCAGTCCTGGCCGt > 8:14459/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCTCGGCTTCGCCACCGTGCCACAGCACGGCCTCAAGCAGGTTGCGGGCGCGGCCGTCATGCAGGAACTGGCTATGGCCACTGACCGTTTCGCTCAGGCCGATGCCCCACAGTGGCGGCGTACGCCAGTCCTGGCCGTTggcgg < 6:205298/149‑1 (MQ=255) ccgccTCGGCTTCGCCACCGTGCCACAGCACGGCCTCAAGCAGGTTGCGGGCGCGGCCGTCATGCAGGAACTGGCTATGGCCACTGACCGTTTCGCTCAGGCCGATGCCCCACAGTGGCGGCGTACGCCAGTCCTGGCCGTTggcggc < 7:25625/148‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCACCGTGCCACAGCACGGCCTCAAGCAGGTTGCGGGCGCGGCCGTCATGCAGGAACTGGCTATGGCCACTGACCGTTTCGCTCAGGCCGATGCCCCACAGTGGCGGCGTACGCCAGTCCTGGCCGTTGGCGGCGAATTCg 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1:242369‑M2/1‑32 (MQ=255) tGGCCGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCCACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCggt > 6:106531/1‑125 (MQ=255) tGGCCGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCggt < 5:106531/125‑1 (MQ=255) gCCGacgagcgcaccgaattcgccgccaacggccaggactggcgtacgccgccactgtggggcatcggcctgagcgatacggtcagtggccatagccagttcctgcatgacggccgcgcccgcaacctgcttgaggccgtgctgtggca > 7:250140‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGacgagcgcaccgaattcgccgccaacggccaggactggcgtacgccgccactgtggggcatcggcctgagcgaaacggtcagtggccatagccagttcctgcatgacggccgcgcccgcaacctgcttgaggccgtgctgtggca > 4:146664‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGacgagcgcaccgaattcgccgccaacggccaggactggcgtacgccgccactgtggggcatcggcctgagcgaaacggtcagtggccatagccagttcctgcatgacggccgcgcccgcaacctgcttgaggccgtgctgtggca > 2:282060‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGacgagcgcaccgaattcgccgccaacggccaggactggcgtacgccgccactgtggggcatcggcctgagcgaaacggtcagtggccatagccagttcctgcatgacggccgcgcccgcaacctgcttgaggccgtgctgtgg < 5:48617‑M1/147‑144 (MQ=255) gCCGacgagcgcaccgaattcgccgccaaccgacaggactggcgtacgccgccactgtgcggcatcggcctgagcgaaacggtcagtggccatagccagatcctgcatgacggccgagcccgcaacctccttcaggccgtgctgtggca > 2:182103‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTcggccaggactggcgtacgccgccactgtggggcatcggcctgagcgaaacggtcagtggccatagccagttcctgcatgacggccgcgcccgcaacctgcttgaggccgtgctgtggca < 2:250166‑M2/149‑121 (MQ=255) gCCGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCtt > 2:25106/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCTTg < 1:331998/149‑1 (MQ=255) cgacgagcgcaccgaattcgccgccaacggccaggactggcgtacgccgccactgtggggcatcggcctgagcgaaacggtcagtggccatagccagttcctgcatgacggccgcgcccgcaacctgcttgaggccgtgctgtggcacg > 2:330266‑M1/1‑2 (MQ=255) cGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCTTgg > 5:263334/1‑149 (MQ=255) cGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCTTg < 6:24939/148‑1 (MQ=255) cGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCTTg > 5:24939/1‑148 (MQ=255) | ATTGCGTGCCGCCTCGGCTTCGCCACCGTGCCACAGCACGGCCTCAAGCAGGTTGCGGGCGCGGCCGTCATGCAGGAACTGGCTATGGCCACTGACCGTTTCGCTCAGGCCGATGCCCCACAGTGGCGGCGTACGCCAGTCCTGGCCGTTGGCGGCGAATTCGGTGCGCTCGTCGGCCAGCCCCGGGCCCATGTCATGCAGCAGCAGGTCGCTGTAGGGGCGGATAACCTGATTGGCCAACGCGGGTTCGGTGGCGTCGGCGGCGGTGGTGAACTGCGGTGTGTGGCAACCTTGG > NC_002947/1052002‑1052296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |