New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1098363 | 77 (1.070) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.3% | coding (216/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
? | NC_002947 | = 1098419 | 68 (0.990) | coding (160/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
CCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGT > NC_002947/1098216‑1098509 | ccGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGccc < 8:31731/149‑1 (MQ=255) ccGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCGTGGTAGAGGTGCGGGATCCCTAGGGTCCTGGccc > 6:276921/1‑149 (MQ=255) cGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCg < 2:432151/149‑1 (MQ=255) gCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCTTAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGCTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGc < 1:244375/149‑1 (MQ=255) gCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAAATTCTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGc < 1:332384/149‑1 (MQ=255) gAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGt > 1:57474/1‑149 (MQ=255) aaTCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGtt > 2:295433/1‑149 (MQ=255) aTCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTc < 1:288556/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCa > 3:201667/1‑149 (MQ=255) gcaggtcgggcaggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACg > 4:251269/1‑149 (MQ=255) gtcgggcaggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACggggg > 3:191329/1‑149 (MQ=255) gtcgggcaggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACggggg > 8:32064/1‑149 (MQ=255) ggcaggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCtt < 8:155819/149‑1 (MQ=255) gcaggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTGGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTg > 6:298482/1‑149 (MQ=255) aggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGAAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCATCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTgag > 1:153903/1‑147 (MQ=255) ggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTgcgc < 4:295026/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTgcgc < 4:300653/148‑1 (MQ=255) ggcgtcgCCCCGGTAAGCCACTTGAGCATCGCGTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGcc < 1:286540/147‑1 (MQ=255) 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aGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCg > 5:371124/1‑141 (MQ=255) aGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCg < 6:371124/141‑1 (MQ=255) aaGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATcgcg > 3:422298/1‑149 (MQ=255) aGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATcgcg < 7:20206/148‑1 (MQ=255) aGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCgg < 3:251269/149‑1 (MQ=255) aGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCgg > 4:339942/1‑149 (MQ=255) ccACTTGATCATAGCTTGGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtg < 5:298482/149‑1 (MQ=255) ccACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtg > 8:206454‑M1/1‑104 (MQ=255) ccACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtg < 5:174384/149‑1 (MQ=255) ccACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtg > 4:208182/1‑149 (MQ=255) cACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtgg < 1:98804/149‑1 (MQ=255) aCTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtggt < 3:339942/149‑1 (MQ=255) tCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacg > 8:186346‑M1/1‑96 (MQ=255) tCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGcc > 6:73948/1‑149 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg > 6:337212‑M2/1‑147 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg > 4:422298‑M2/1‑147 (MQ=255) cTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGAAGATCGCGGTGCTCACGCCCGAggc < 5:332994‑M2/149‑4 (MQ=255) ggCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccag < 7:206454‑M1/148‑63 (MQ=255) gCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCAt > 6:47399/1‑147 (MQ=255) ccAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaac < 7:186346‑M1/149‑67 (MQ=255) 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aGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAg > 4:262140/1‑149 (MQ=255) gCACCACCAATTTGTCCTCACGTCCTTGGTAGTGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTATTGCGCCCGCTTATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGAATCTTGATGCCCTAGCCTTCGAgg < 2:153903/149‑1 (MQ=255) caccacCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAggg < 1:92725/149‑1 (MQ=255) ccaccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTa < 4:43514/149‑1 (MQ=255) ccaccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTa < 3:24204/149‑1 (MQ=255) caccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTAt > 5:316185/1‑149 (MQ=255) accaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTAtt < 6:67490/149‑1 (MQ=255) tcctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt > 7:195156/1‑149 (MQ=255) tcctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt > 8:76196/1‑149 (MQ=255) tcctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt < 3:118571/149‑1 (MQ=255) ctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTg > 4:309348/1‑148 (MQ=255) ctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTg > 7:151286/1‑148 (MQ=255) ctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGa < 7:269342/149‑1 (MQ=255) tccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGaa > 8:301641/1‑149 (MQ=255) tccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGaa > 6:241406/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTc < 3:378419/139‑1 (MQ=255) gCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTc > 4:378419/1‑139 (MQ=255) ccTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCt < 5:241406/149‑1 (MQ=255) gTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCAt > 6:186525/1‑149 (MQ=255) gagGTGCGGGATACCGAGTTTCCTTGCCCGGCGTTCT‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCAGGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATTCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATcc < 6:332994/148‑1 (MQ=255) gagGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATcc < 1:256395/148‑1 (MQ=255) gagGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCt > 4:401601/1‑149 (MQ=255) ggTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTc < 6:117797/148‑1 (MQ=255) ggTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCg < 3:262140/149‑1 (MQ=255) ttGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGa < 4:116268/148‑1 (MQ=255) gTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTc > 3:50393/1‑147 (MQ=255) cGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGAACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGCGCATCTTGATGCCCTGGCCGGCGAGGGTATTGAACGGCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAg > 1:46115/1‑148 (MQ=255) cGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAgg < 2:149622/148‑1 (MQ=255) gggATACCGAGGTTCGTGGCGCGGCGTTCG‑ACCACGGTGTTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTTGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGaa < 7:384904/149‑1 (MQ=255) aTACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTa < 7:301641/149‑1 (MQ=255) tACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTAc < 5:73948/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAg < 3:309348/149‑1 (MQ=255) cGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAgg > 7:377937/1‑149 (MQ=255) gTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgg < 7:186346‑M2/149‑84 (MQ=255) ccTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGa > 4:167347/1‑131 (MQ=255) ccTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGa < 3:167347/131‑1 (MQ=255) cTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcc < 7:206454‑M2/148‑87 (MQ=255) gCCtcgggcgtgagcaccgcgatcttcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaag < 5:332994‑M1/149‑147 (MQ=255) gCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGt < 2:55736/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGt < 8:195156/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTTGG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCTCGGTGGTCACCCACGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCAGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTAGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGt > 6:316728/1‑148 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc > 6:337212‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc > 4:422298‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCG‑ACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGT > NC_002947/1098216‑1098509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |