| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1304060 | 86 (1.200) | 5 (0.070) | 5/262 | NT | 5.7% | coding (84/768 nt) | livG | ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 1304086 | 82 (1.170) | coding (58/768 nt) | livG | ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGATCTGGTGGCCGGCCAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCAT > NC_002947/1303912‑1304205 | cGATCTGGTGGCCGGCCAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTG < 2:280976‑M1/149‑1 (MQ=255) gATCTGGTGGCCGGCCAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGa > 7:327336/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGGCCGGCCAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGAc < 4:413252/148‑1 (MQ=255) 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cggccAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGc > 8:48603/1‑148 (MQ=255) cggccAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGc > 2:383206/1‑148 (MQ=255) aGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGacggtcaacggcgtggc > 7:158208‑M1/1‑132 (MQ=255) ggCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCg < 1:148123/149‑1 (MQ=255) cccTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGtt < 3:65170/149‑1 (MQ=255) cccTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGtt < 1:383206/149‑1 (MQ=255) cccGGAATCGGCTGGCCAGCGAGCAGGCTGGGGCCGCCGCTGGGCTTGTAGCAGCCGGGCAGGCAGTTGCACACGGGGGTCGTGCCGGCGCCGTGCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGtt < 3:62372/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCg > 2:435373/1‑149 (MQ=255) aTCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGacggtcaacggcgtggccctgaccgt < 8:158208‑M1/149‑27 (MQ=255) ggCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaa < 3:292379‑M2/149‑4 (MQ=255) 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aGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGaa < 7:32642/149‑1 (MQ=255) gCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑g > 5:175936/1‑149 (MQ=255) ggATGGTGCCGCCGCTGTGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGTCGCCGTGCGGGCCGATCAATGCCACCACCAGTTTTTCTTTGACGGTCAGTGCCAGGCCGTTGACCGCGAACAAGCCGCCGAA‑‑gcg‑‑c < 6:413717/149‑1 (MQ=38) gATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑Ca < 7:4953/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGaa < 7:304112/143‑1 (MQ=255) 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ccaccaCCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCg < 6:414967/149‑1 (MQ=255) ccaccaCCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTAGCg > 2:95689/1‑149 (MQ=255) caccacCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCg > 4:264535/1‑148 (MQ=255) caccacCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGATCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCg > 5:211717/1‑148 (MQ=255) ccaccTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGAc < 4:48986/149‑1 (MQ=255) gcTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGTCCTTGCGGACGcc < 8:257476/148‑1 (MQ=255) cTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCa < 4:192828/149‑1 (MQ=255) gTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaaagaaaaacaggtggtggcattgatcggcccgaacggcgccggcaagaccaccgtgttcaactgcctgaccggcttctacaagcccagcggcggcaccatcctgctcgat < 7:243333‑M2/149‑113 (MQ=255) tttCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGatc < 5:188000/148‑1 (MQ=255) ttCTTTGACGGTCAGTGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGatcat > 2:99865/1‑149 (MQ=255) tCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaaagaaaaacaggtggtggcattgatcggcccgaacggcgccggcaagaccaccgtgtacaactgcctgaccggctt > 5:75017‑M2/1‑32 (MQ=255) tCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaaagaaaaacaggtggtggcattgatcggcccgaacggcgccggcaagaccaccgtgtacaactgcctgaccggctt < 6:75017‑M2/110‑79 (MQ=255) cTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCgg < 4:17528/135‑1 (MQ=255) cTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCgg > 3:17528/1‑135 (MQ=255) ttGgcggtcaacggcgtggccctgaccgtcaaagaaaaacaggtggtggcattgatcggcccgaacggcgccggcaagaccaccgtgttcaactgcctgaccggcttctacaagcccagcggcggcaccatcctgctcgatggccagcc < 3:292379‑M1/149‑147 (MQ=255) | CGATCTGGTGGCCGGCCAGGCCCTGAATCGGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCAT > NC_002947/1303912‑1304205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |