New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1304086 | 82 (1.170) | coding (58/768 nt) | livG | ABC transporter ATP‑binding protein |
GGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACACCATCAGCGCACCGAACATCAG > NC_002947/1303941‑1304232 | ggCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaa < 3:292379‑M2/149‑4 (MQ=255) cTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaac > 8:330520/1‑148 (MQ=255) tGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCcaacaa < 4:288927/149‑1 (MQ=255) 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gTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGAGGCCAGatcatcaaacacac > 8:286078/1‑141 (MQ=255) gTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACAcc < 1:84974/149‑1 (MQ=255) gTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACAcc < 7:295421/149‑1 (MQ=255) aGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTACATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGat > 8:319123/1‑133 (MQ=255) aGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTACATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGat < 7:319123/133‑1 (MQ=255) ggCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACACCATCAg > 8:76363/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCGTTGACCGTcaaagaaaaacaggtggtggcattgatcggcccgaacggcgccggcaagaccaccgtgttcaactgcctgaccggcttctacaagcccagcggcggcaccatcctgctcgatggccagccgattcagggcct > 7:158208‑M2/1‑17 (MQ=255) gCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACACCATCAgc < 3:264535/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACACCATCAGCGCAcc < 2:16350/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTGATCGACGCAGCTCCATGTTTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCTGACGCGAGATCATCATGAACACCATCAGCGCACCGAACATc < 5:201534/149‑1 (MQ=255) 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GGCTGGCCATCGAGCAGGATGGTGCCGCCGCTGGGCTTGTAGAAGCCGGTCAGGCAGTTGAACACGGTGGTCTTGCCGGCGCCGTTCGGGCCGATCAATGCCACCACCTGTTTTTCTTTGACGGTCAGGGCCACGCCGTTGACCGCCAACAAGCCGCCGAA‑‑GCG‑‑CATGCTCAGGCCGCTGACTTGCAGAATTTCGCGGCTCATCGACGCAGCTCCATGTGTGGACGTTGCATAGGCAGCAGGCCTTGCGGACGCCAGATCATCATCAACACCATCAGCGCACCGAACATCAG > NC_002947/1303941‑1304232 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |