| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2147917 | 59 (0.820) | 5 (0.070) | 3/252 | NT | 7.9% | coding (2603/3276 nt) | rne | ribonuclease E |
| ? | NC_002947 | = 2147951 | 61 (0.910) | coding (2569/3276 nt) | rne | ribonuclease E | |||||
GACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAGCGGCGGCGCG > NC_002947/2147769‑2148064 | gACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCA < 2:155825‑M1/149‑1 (MQ=255) aCCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAg < 3:128192/149‑1 (MQ=255) aCCGGGTGGGCGGCTTCGCTGTTGGCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCGGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAg < 3:63066/149‑1 (MQ=255) ccGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGt > 4:135251/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTc < 8:297330/149‑1 (MQ=255) gTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCg > 3:246595/1‑149 (MQ=255) gggCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCa > 3:161381/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCt < 8:246802/147‑1 (MQ=255) ttgtCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTg < 8:342303/147‑1 (MQ=255) gtCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGACACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGcc < 5:87599/148‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTg < 2:290150/149‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTg < 6:181339/149‑1 (MQ=255) ggTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGt > 7:332964/1‑149 (MQ=255) tGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCtgtt > 7:95137/1‑149 (MQ=255) gCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaac > 5:399219‑M1/1‑115 (MQ=255) gCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCtgttg > 4:118875/1‑149 (MQ=255) aaCGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtg < 2:241661‑M2/149‑3 (MQ=255) aCGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtgg > 1:241661‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtggct < 4:272070‑M2/149‑6 (MQ=255) ggCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtggct < 4:272064‑M2/149‑6 (MQ=255) aGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgct < 1:116057‑M1/149‑43 (MQ=255) aGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGATGCCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtggctgc < 2:376347‑M2/148‑8 (MQ=255) aGCGACTTCGGCGGGAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgct < 1:110308‑M1/149‑43 (MQ=255) gCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAcaacagcaccaggccaccgagttgggtgccgaactggctgctg < 3:298454‑M1/149‑44 (MQ=255) gCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctg < 6:399219‑M1/149‑44 (MQ=255) cGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCg < 2:374197/122‑1 (MQ=255) cGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCg > 1:374197/1‑122 (MQ=255) cGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtgg < 4:120046‑M2/142‑4 (MQ=255) cGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtgg > 3:120046‑M2/1‑139 (MQ=255) cTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCg > 8:259157/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtgg > 2:35815‑M2/1‑135 (MQ=255) ttCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtgg < 1:35815‑M2/138‑4 (MQ=255) cggcggTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTg > 1:329603/1‑149 (MQ=255) ggTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCg > 7:68997/1‑142 (MQ=255) ggTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCg < 8:68997/142‑1 (MQ=255) cACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACATGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCcttcttc > 1:126032/1‑149 (MQ=255) cACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCcttcttct > 1:381407/1‑149 (MQ=255) aCGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCcttcttctt < 8:332964/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGcc > 5:132943/1‑149 (MQ=255) 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cagcagCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGCCGCTGGCCACGGGAgcgg > 4:276311/1‑149 (MQ=255) cagcagCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAgcgg > 7:274881/1‑149 (MQ=255) cagcagCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCCCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTAACGACGGTTGCTGAGACGAAGCTGGACACGGGAgcgg > 3:360614/1‑149 (MQ=255) cagcagCCAGTTCGGCACCCAACTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgc < 3:298454‑M2/149‑107 (MQ=255) agcagcCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctcccgccgaagtcgct < 1:110308‑M2/149‑108 (MQ=255) agcagcCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGtggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgct < 1:116057‑M2/149‑108 (MQ=255) gcagcCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcggcatcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgct < 2:376347‑M1/148‑142 (MQ=255) gcagcCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAgcggcg < 6:69719/149‑1 (MQ=255) gcagcCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAgcggcg < 3:272070/149‑1 (MQ=255) gcagcCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGGGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCGGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAgcggcg < 3:272064/149‑1 (MQ=255) agcCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgctgcc < 4:272070‑M1/149‑145 (MQ=255) agcCAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgctgcc < 4:272064‑M1/149‑145 (MQ=255) gcCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAgcggcggcg > 5:366989/1‑149 (MQ=255) ccAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgctgccgt > 1:241661‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcg < 4:120046‑M1/142‑140 (MQ=255) ccAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcg > 3:120046‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaa < 1:35815‑M1/138‑136 (MQ=255) ccAcaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaa > 2:35815‑M1/1‑3 (MQ=255) cacaacagcaccaggccaccgagctgggtgccgaactggctgctggccttgccgtgacggctgctgtcgccagcagcaacatcagctccgacgcagaagcccaggccaaccagcaggccgagcgtgctaccgccgaagtcgctgccgtt < 2:241661‑M1/149‑148 (MQ=255) | GACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACA‑GCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCGACGACGCTGGCCACGGGAGCGGCGGCGCG > NC_002947/2147769‑2148064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |