New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295775 = | 51 (0.710) | 10 (0.170) | 9/220 | NT | 24.2% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295860 = | 21 (0.360) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
GTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAA > NC_002947/2295632‑2295920 | gcgccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtg < 5:269388‑M1/4‑1 (MQ=255) gTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTgg < 6:406828/148‑1 (MQ=255) cgccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTgg > 7:307659‑M1/145‑149 (MQ=255) aCTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCAGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAg > 1:400532/1‑149 (MQ=255) agtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatcctcgtgtgcggagctggctggatgtgtggctggcttcgtagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGc > 2:144281‑M1/141‑149 (MQ=255) agtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGc > 1:298745‑M1/141‑149 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCggg > 1:290683/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCggg < 7:252637/149‑1 (MQ=255) tttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCgg < 4:425019‑M1/11‑1 (MQ=255) gcgcATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAt < 6:160183/149‑1 (MQ=255) cggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggaagtgtattcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggatgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCa < 1:353113‑M1/14‑1 (MQ=255) cggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAg < 4:240029‑M1/8‑1 (MQ=255) cggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAg > 3:240029‑M1/134‑141 (MQ=255) cggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATg < 3:121668‑M1/16‑1 (MQ=255) cggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacataggtcctTGTGGGAGCGGGCATg < 7:311410‑M1/16‑1 (MQ=255) gggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGcc < 3:336332‑M1/18‑1 (MQ=255) gggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggcgggagggggggctggcttcggagctgttcaaggcaagcatggtccgctgatgaaacatcgggctgcacaggggtccgGGTGGGAGCGGGCATGcc < 6:208864‑M1/18‑1 (MQ=255) tcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCcgc > 1:217354‑M1/129‑149 (MQ=255) cGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGTAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCg < 6:123457/149‑1 (MQ=255) cagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCgg < 7:379527‑M1/11‑1 (MQ=255) cagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCgg > 8:379527‑M1/121‑131 (MQ=255) aCAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGc < 1:405550/149‑1 (MQ=255) aCAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCAGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGc < 2:400532/149‑1 (MQ=255) cagcaaCAATGCTTCTGCCAACCACTTCTACACCGAGTATTTCACCCCAGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGTCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGTGCATGCCCGCGAACACCgg < 1:364073/149‑1 (MQ=255) gcagcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCaga < 4:43330/149‑1 (MQ=255) cagcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCagag > 3:212890/1‑149 (MQ=255) cagcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCagag > 7:89580/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCgg < 4:212890/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGTGGTCCTTGTGGTAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGt < 4:308642/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGt < 4:246616/149‑1 (MQ=255) gctggttccacccacAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTg < 8:373915/141‑1 (MQ=255) ccacccacAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCcgctccc < 8:288906/125‑5 (MQ=255) ccacccacAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCcgctccc > 7:288906/1‑121 (MQ=255) cacccacAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCAcc > 1:106152/1‑149 (MQ=255) acccacAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACcg > 6:267617/1‑149 (MQ=255) ccacAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGCCAGAGCCGGTGCCATCCACcgcg > 5:20097/1‑149 (MQ=255) cgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccactgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCgg < 6:162869‑M1/54‑1 (MQ=255) acacCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCcgc < 6:329709/109‑1 (MQ=255) acacCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCcgc > 5:329709/1‑109 (MQ=255) gAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTcgc > 7:107284/1‑149 (MQ=255) gAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCACGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGGCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTcgc < 7:172410/149‑1 (MQ=255) gCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg < 4:93496/149‑1 (MQ=255) gCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAAATTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAACCACCACCACTGATCTGGCTTGTGGGAGGTCCTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg < 1:27020/149‑1 (MQ=255) cAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg < 7:402360/149‑1 (MQ=255) cAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg > 3:297406/1‑149 (MQ=255) ttgctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 2:353113‑M1/82‑149 (MQ=255) tggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 4:121668‑M1/82‑149 (MQ=255) aGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGc < 2:290683/149‑1 (MQ=255) gctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccactgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGc > 5:162869‑M1/80‑149 (MQ=255) gtcccTGCGCCAGAGGTCCAATTTCCTTGCGGCCCTGAGTGGCACGCACCACCACTGAGCTGGCGTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGAAGCGGGCa < 7:96769/146‑1 (MQ=37) aCCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACcgc < 5:3839/128‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACcgc > 6:3839/1‑128 (MQ=255) gaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc > 1:117028‑M1/76‑149 (MQ=255) gaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacataggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCTCGGGCAt > 8:311410‑M1/76‑147 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATg < 8:89580/148‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGACATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc < 2:433739/149‑1 (MQ=255) aggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCCGGCATGcc < 7:178240‑M1/75‑1 (MQ=255) ccAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 4:14697/1‑149 (MQ=255) agCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcac < 6:20097/149‑1 (MQ=255) cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCacac > 4:67999/1‑149 (MQ=255) gcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACg > 1:86493/1‑149 (MQ=255) agctgttcaaggaaatcatggtccgatgattaaacatcgggctgcacttgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAccc > 8:178240‑M1/57‑148 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 2:86493/149‑1 (MQ=255) cccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTAGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAAGTGCAGccc > 8:38557/1‑149 (MQ=255) aGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 2:106152/147‑1 (MQ=255) cAAGCACCACCACTGATCTGGCTGGTGTGAGGTCCTGGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAAt < 7:38557/149‑1 (MQ=255) aaGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGCTGCCCCCTTCGCCGGCAAGCCCGCTCCCACCCGGACCCAAGTGCCGCCCGCAGATTAAt > 8:193047/1‑148 (MQ=25) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 3:280314/110‑1 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 4:280314/1‑110 (MQ=255) ccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGACCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACAGCGGTGCCCGCTTCGCCGGCCTGCCAGCTCCCACACGGCCCCATGTGCAGGCCGATGTTTAATCAGCGGAc > 5:444993/1‑148 (MQ=37) ggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg > 2:69810‑M1/18‑86 (MQ=255) ggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg < 1:69810‑M1/69‑1 (MQ=255) gCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCCGCGGTGCCCGCATCCCCGGCATGCCCGCGCCCCCACGGCCCCATTTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGCCCATGCTTGccgt > 7:90688/1‑147 (MQ=25) gCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc < 8:107284/147‑1 (MQ=255) cTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTg < 5:267617/149‑1 (MQ=255) tgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGCCCATGATTTCCTTGAAAAg > 4:84497/1‑148 (MQ=255) aGGCCCTTGGGGTAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTc < 7:193047/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCTGGAACTCCGGCAGTGCGGGTGCCTTCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCGGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa < 6:444993/148‑1 (MQ=255) | GTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGT‑‑ACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAA > NC_002947/2295632‑2295920 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |