New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295775 = | 51 (0.710) | 10 (0.170) | 9/220 | NT | 24.2% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295860 = | 21 (0.360) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
CGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295712‑2296004 | cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCacac > 4:67999/1‑149 (MQ=255) gcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACg > 1:86493/1‑149 (MQ=255) agctgttcaaggaaatcatggtccgatgattaaacatcgggctgcacttgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAccc > 8:178240‑M1/57‑148 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgtg < 2:86493/149‑1 (MQ=255) cccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTAGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAAGTGCAGccc > 8:38557/1‑149 (MQ=255) aGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 2:106152/147‑1 (MQ=255) cAAGCACCACCACTGATCTGGCTGGTGTGAGGTCCTGGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAAt < 7:38557/149‑1 (MQ=255) aaGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGCTGCCCCCTTCGCCGGCAAGCCCGCTCCCACCCGGACCCAAGTGCCGCCCGCAGATTAAt > 8:193047/1‑148 (MQ=25) ccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGACCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACAGCGGTGCCCGCTTCGCCGGCCTGCCAGCTCCCACACGGCCCCATGTGCAGGCCGATGTTTAATCAGCGGAc > 5:444993/1‑148 (MQ=37) gCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCCGCGGTGCCCGCATCCCCGGCATGCCCGCGCCCCCACGGCCCCATTTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGCCCATGCTTGccgt > 7:90688/1‑147 (MQ=25) gCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc < 8:107284/147‑1 (MQ=255) cTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTg < 5:267617/149‑1 (MQ=255) tgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGCCCATGATTTCCTTGAAAAg > 4:84497/1‑148 (MQ=255) gggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttagcgggcatgcccgctcccacaAGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATCATCGGACCATGATTTCCTTGAACAGCt > 8:178240‑M2/93‑148 (MQ=255) aGGCCCTTGGGGTAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTc < 7:193047/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCTGGAACTCCGGCAGTGCGGGTGCCTTCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCGGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa < 6:444993/148‑1 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATTCCCGCTCCCACACGGACACATGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCAcc < 6:82077‑M1/149‑1 (MQ=255) ggcatgccggcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCt < 7:178240‑M2/74‑1 (MQ=255) GGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACACGGCCCCATGTGCAGGCCGATGGTTTATCAGCGGGCCATGATTGGCTTGAACAGCTCCGCAGCCA‑‑GCCACCCCt < 5:31539‑M1/149‑1 (MQ=255) gcatgcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTc > 1:117028‑M2/75‑149 (MQ=255) atgcccgagaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTc > 8:311410‑M2/73‑147 (MQ=255) gcccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttagcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGTGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTccagc > 5:162869‑M2/71‑149 (MQ=255) cccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGcc > 2:69810‑M2/70‑86 (MQ=255) cccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGcc < 1:69810‑M2/17‑1 (MQ=255) CCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGTTGCCCGCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTccagcc > 1:177157‑M1/1‑149 (MQ=255) ccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCctccagcaa > 2:353113‑M2/69‑147 (MQ=255) ccgcgaagcgggcaccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTccagcca > 4:121668‑M2/69‑149 (MQ=255) cacCGGCTCTGCCGGTGTCATCCACCGCGGTGCCCGCTTAGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTTCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCACCGAAGCCA‑‑GCCACCCCACCAGCCCGCTACg > 4:336332/1‑148 (MQ=255) ccgcggtggatggcaccggctctgccggtgttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGTGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgcg < 6:162869‑M2/95‑1 (MQ=255) gagCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCgg < 4:297406/149‑1 (MQ=255) gtgcccAACCCCCGCGGGGCCGGCTTCGGGGGATTGCCGGCCCCAACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAg < 2:197558/145‑1 (MQ=255) tGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgcc < 3:67999/149‑1 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGCCCGCTTAGCGGGCCTGCCCGCTCCCACCCGGACCCATGTGCAGCCCGCTGTTTTATAAGCGGACCATGATTGCCATGAAAAGCTCCCAAGCCC‑‑GCCCCCCCACCAGCCAACACCGCCCCCCCGGCTAAaccccca > 6:265936/1‑148 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCGCCCACACCGACCCAAGTGCAGCCCGCTGTTTAATCAGCGGACCATGATTGGCTTGAAAAGCACCGAAGCCA‑‑GCCACCCCGCCCGCCACCACCCCACACCCGGAAAAgccgcca > 8:357944/1‑148 (MQ=255) cACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCgg < 5:265936/149‑1 (MQ=255) ccGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCg < 7:174643/149‑1 (MQ=255) gCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACt > 3:425019/1‑149 (MQ=255) cccGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGGGCAGCCCGAGGGTTAAGCCGCGGACCAGGATGGCCGTGCACAGCTCCGCCGCCA‑‑GCCCCCCCTCCCGCCCGCTCCGCCCACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCCCTg > 5:208864/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGc < 3:14697/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGGCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGAGAACCCGCGTCGGCGAACCACTGCg > 2:368495/1‑149 (MQ=255) gcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGa > 1:217354‑M2/22‑149 (MQ=255) ggcatgcccgctcccaccCGGACCCCTGTGCAGCCCGATGTTTCATCAGCGGACCATGCTTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCCCCCCTCCCGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAccc < 6:208864‑M2/131‑1 (MQ=255) ggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAccc < 3:336332‑M2/131‑1 (MQ=255) catgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCg < 3:121668‑M2/133‑1 (MQ=255) catgcccgctcccacaAGGACCTATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCg < 7:311410‑M2/133‑1 (MQ=255) tgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCATCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAATACACTTCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCg < 1:353113‑M2/135‑1 (MQ=255) ccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg < 7:379527‑M2/120‑1 (MQ=255) ccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg > 8:379527‑M2/12‑131 (MQ=255) ccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCaaa < 4:425019‑M2/138‑1 (MQ=255) gctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACt > 1:298745‑M2/10‑149 (MQ=255) gctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTACGAAGCCA‑‑GCCACACATCCAGCCAGCTCCGCACACGAGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACt > 2:144281‑M2/10‑149 (MQ=255) ctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCg > 3:240029‑M2/9‑141 (MQ=255) ctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCg < 4:240029‑M2/133‑1 (MQ=255) ccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgcg > 7:307659‑M2/6‑149 (MQ=255) caacacTGACCCATGTGCAGCCCGATGTATAAACAGCGGACCATGAATACATTGAACAGCTCCCAAACCA‑‑GCCACCACTCCAGCCAGCTCCGCACACCCGCATAAGCCGCCTCGCCGAACAACTCCGGTTCGACCCCGGCAAACttccg > 8:397967/3‑145 (MQ=255) cacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGgcgc < 5:269388‑M2/145‑1 (MQ=255) | CGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCA‑‑GCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > NC_002947/2295712‑2296004 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |