New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2995914 = | 38 (0.530) | 3 (0.040) | 3/256 | NT | 8.1% | coding (930/1017 nt) | PP_2620 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2995963 = | 32 (0.470) | coding (881/1017 nt) | PP_2620 | hypothetical protein |
TGCCGAGCAGTAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTGGGCAGCAAGTCCCGCAGCTGCGTCT > NC_002947/2995766‑2996062 | tGCCGAGCAGTAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTgg > 7:360510/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGc < 4:12874/149‑1 (MQ=255) tAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCTGTGc > 6:384717/1‑148 (MQ=255) tAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGc > 6:243446/1‑148 (MQ=255) tAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCACTGGCTGCGGTGc > 7:278244/1‑148 (MQ=255) aCGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCaa < 7:311858/148‑1 (MQ=255) cGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAg > 8:89413/1‑148 (MQ=255) cAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGt < 1:383201/147‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAAcgcg < 1:82112/149‑1 (MQ=255) aTGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAgg > 4:255567/1‑149 (MQ=255) gCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGgcg > 2:246515/1‑149 (MQ=255) tCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGgcg > 3:163227/1‑147 (MQ=255) aaGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAg < 4:307573/148‑1 (MQ=255) ggTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTc > 2:340474/1‑149 (MQ=255) gcagctgcgggacttgctgcccagcggcatcaacttcggccgtttgcgtgcactgatcgactttctgctgcgtgacgggctggcctatgacctggaGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCa > 6:162671‑M1/97‑149 (MQ=255) tgtgTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGt > 2:223282/1‑148 (MQ=255) gtgtTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTTGCCATTCCGGTCCTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGAAGAAGGTTGACAACTCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCa < 4:314287/149‑1 (MQ=25) gggacttgctgcccagcggcatcaacttcggccgtttgcgtgcactgatcgactttctgctgcgtgacgggctggcctatgacctggag > 3:241520‑M1/89‑89 (MQ=255) gggacttgctgcccagaggcatcaacttcggccgtttgcgtgcactgatcgactttctgctgcgtgacgggctggcctatgacctggag < 4:241520‑M1/1‑1 (MQ=255) tCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCGGCTCCAGGTCATAgg > 8:402215/1‑149 (MQ=255) cATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAgt < 8:360510/148‑2 (MQ=255) tGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGc > 5:300896/1‑147 (MQ=255) gctgcccagcggcatcaacttcggccgtttgcgtgcactgatcgactttctgctgcgtgacgggctggcctatgacctggaGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGt < 6:27130‑M1/56‑1 (MQ=255) gctgcccagcggcatcaacttcggccgtttgcgtgcactgatcgactttctgctgcgtgacgggctggcctatgacctggaGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGt > 5:27130‑M1/82‑137 (MQ=255) cccccGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGt < 7:89413/149‑1 (MQ=255) aaCCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGt > 3:79472/1‑149 (MQ=255) aaCCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCACAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGt > 4:427023/1‑149 (MQ=255) gggCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAg < 1:198370/107‑1 (MQ=255) gggCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAg > 2:198370/1‑107 (MQ=255) gggCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGAt < 1:340474/149‑1 (MQ=255) ggCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATc < 3:255567/149‑1 (MQ=255) gCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCa < 1:246515/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCa > 6:306917/1‑149 (MQ=255) gCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCATCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACg < 8:1515/147‑1 (MQ=255) aTGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAAc > 7:192782/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAAc > 3:174924/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACg > 3:296298/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACg > 8:183087/1‑149 (MQ=255) tcgACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGAAAACGCTCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGtt < 7:402215/149‑1 (MQ=255) gacgaAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGa > 1:57210/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGc > 5:35969/1‑149 (MQ=255) ggTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTgg > 3:263990/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTGGgcagc < 6:35969/149‑1 (MQ=255) tGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCACAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTGGGCAGCAAGTCCCGCa < 3:427023/149‑1 (MQ=255) gcCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTGGGCAGCAAGTCCCGCAGCt > 8:342835/1‑149 (MQ=255) GCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTGGGCAGCAAGTCCCGCAGCTGCGTCt > 5:306917‑M1/1‑149 (MQ=255) | TGCCGAGCAGTAACGCCGTGCTGCAGTTGGTCGAGGTTGGTGATGCTCAAGGTGACTGTGTTCATGAGCGCCCCCGGATGCGTACAACCGGGCTGATCTGGCCATGCCGGTCGTCGACGAAGCTGGTCCAGCCCAGGTATGCGCCCTGGCTGCGGTGCAAGCAGAAGGGTGACAACGCGCTCTGCTTGAGGCGCAGCTCCAGGTCATAGGCCAGCCCGTCACGCAGCAGAAAGTCGATCAGTGCACGCAAACGGCCGAAGTTGATGCCGCTGGGCAGCAAGTCCCGCAGCTGCGTCT > NC_002947/2995766‑2996062 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |