New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3606473 = | 64 (0.890) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 6.2% | coding (289/951 nt) | PP_3181 | site‑specific recombinase |
? | NC_002947 | 3606514 = | 60 (0.870) | coding (248/951 nt) | PP_3181 | site‑specific recombinase |
AACCCAGCAACAGCAAGGCGCTGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTGGTCGGCGTG > NC_002947/3606326‑3606617 | tctcccggccaccgccgagagtatcgcccgctacctggccgatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑c < 8:334223‑M1/2‑1 (MQ=255) cggcccggccaccgccgagagtatcgcccgctacctggccgatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑c > 2:163861‑M1/148‑149 (MQ=255) cccggccaccgccgagagtatcgcccgctacctggccgatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccacgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGt < 4:108579‑M1/4‑1 (MQ=255) ccAGCAACAGCAAGGCGCTGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTc > 3:242481/1‑149 (MQ=255) ccggccaccgccgagagtatcgcccgctacctggccgatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccacggcgccattggtG‑CGt < 6:369008‑M1/4‑1 (MQ=255) ccggccaccgccgagagtatcgcccgctacctggccgatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtggcgtc < 7:126591‑M1/6‑6 (MQ=255) cagcaacagcaaGGCGCTGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCg > 4:3924/1‑149 (MQ=255) cggccaccgccgagagtatcgcccgctacctggccgatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGTCgg < 4:371701‑M1/7‑1 (MQ=255) agcaacagcaaGGCGCTGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCgg < 2:393404/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCg > 3:148722/1‑149 (MQ=255) tGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATg > 1:187056/1‑149 (MQ=255) cGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCcgcg > 7:183534/1‑149 (MQ=255) cGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCcgcg < 3:193953/149‑1 (MQ=255) gCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTa < 5:387753/149‑1 (MQ=255) gatcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCa > 3:371701‑M1/108‑149 (MQ=255) aGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCAc < 2:386135/149‑1 (MQ=255) tcacgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtGGCGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCAc > 8:126591‑M1/106‑149 (MQ=255) ggCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCAcc > 1:174703/1‑148 (MQ=255) cgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGc > 2:57921‑M1/103‑143 (MQ=255) cgccgaccagcatgcagtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGc < 1:57921‑M1/41‑1 (MQ=255) cAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCg < 5:77720/117‑1 (MQ=255) cAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCg > 6:77720/1‑117 (MQ=255) cAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGgcg > 5:369008/1‑149 (MQ=255) cAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGgcg > 8:216761/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCTGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGt > 3:310238/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTc < 4:148722/148‑1 (MQ=255) gtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGTc > 4:310809‑M1/87‑91 (MQ=255) gtcagtaccctgcgccaacgcctggccgcgctcagccagtggcacgtcgcccaaggcttccccgatccgaccaaggcgccattggtG‑CGTc < 3:310809‑M1/5‑1 (MQ=255) gcgGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGt < 4:179862/99‑1 (MQ=255) gggCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCggg > 6:377485/1‑148 (MQ=255) ggCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTTCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGT‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGa < 4:330840/149‑1 (MQ=255) ggCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGa < 2:390535/149‑1 (MQ=255) ttGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGAACCTGACGCACCAATGGGGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGc > 5:358704/1‑149 (MQ=255) gTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCAc < 3:94874/118‑1 (MQ=255) gTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCAc > 4:94874/1‑118 (MQ=255) gTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCt > 2:179835/1‑149 (MQ=255) ggCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCATTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTggg > 4:15324/1‑149 (MQ=255) gCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGc > 2:180592/1‑149 (MQ=255) cttcttcGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGAc < 8:183534/148‑1 (MQ=255) ttcGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGc > 4:87783/1‑148 (MQ=255) ttcGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGc > 8:3055/1‑148 (MQ=255) tcGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCa > 5:183988/1‑149 (MQ=255) cGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACATGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCAc > 3:226294/1‑149 (MQ=255) cGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGACCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCAc > 3:412648/1‑149 (MQ=255) gAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACt < 3:3924/149‑1 (MQ=255) aaCACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTgg < 1:179835/149‑1 (MQ=255) gTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAg > 2:207908/1‑149 (MQ=255) gTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAg > 2:69025/1‑149 (MQ=255) tCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAgc > 3:108579/1‑149 (MQ=255) tCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCGTGGTCGGAACGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAgc > 2:148531/1‑149 (MQ=255) aGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAgc < 5:424753/145‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAgc > 6:424753/1‑145 (MQ=255) aGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCgg > 5:61713/1‑149 (MQ=255) gTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAg > 7:334223/1‑149 (MQ=255) gCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGt > 2:106074/1‑149 (MQ=255) cAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGtt < 1:207908/149‑1 (MQ=255) aGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTg < 6:183988/149‑1 (MQ=255) cagcaACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTg > 2:386319/1‑141 (MQ=255) cagcaACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTg < 1:386319/141‑1 (MQ=255) cagcaACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAggg > 2:416419/1‑149 (MQ=255) agcaACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAggg < 4:1976/148‑1 (MQ=255) caACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTac > 7:231445/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTactga < 2:187056/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTactga > 5:273406/1‑149 (MQ=255) aGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGA‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCGGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGc > 7:345263/1‑115 (MQ=255) aGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGA‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGc < 8:345263/115‑1 (MQ=255) gCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTactgact < 5:377485/149‑1 (MQ=255) ggggCGACCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGc < 4:412648/149‑1 (MQ=255) ggcggcCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCAt < 3:15324/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATg < 1:416419/149‑1 (MQ=255) gcCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAg > 6:52516/1‑119 (MQ=255) gcCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAg < 5:52516/119‑1 (MQ=255) gcCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTg < 1:106074/149‑1 (MQ=255) gcCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTg > 6:396479/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTGGt > 1:77657/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCGTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGGACTGACAGCATGCTGGt > 6:147558/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTACAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACCCACCAATGGCGCCTTGGTAGGATAGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCCCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTGGt > 6:425048/1‑149 (MQ=255) ggTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTGGTCGGCGTg < 5:396479/149‑1 (MQ=255) | AACCCAGCAACAGCAAGGCGCTGTCACGGCGAGCCCGGCGCAGGGCTGCCAAATCATGGTGCTCGCGGGCTTGTCGGGCTTCTTCTTCGAAACACGTCACAGCGGTTTGCAGGTGTTGCAGCAACAGCGGGGCGGCCTGTTTGGGTGG‑CGTCGGGTGCAGGGTGCGGATGCCGCGTAGCACCTGACGCACCAATGGCGCCTTGGTCGGATCGGGGAAGCCTTGGGCGACGTGCCACTGGCTGAGCGCGGCCAGGCGTTGGCGCAGGGTACTGACTGCATGCTGGTCGGCGTG > NC_002947/3606326‑3606617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |