New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3975755 | 57 (0.800) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 6.1% | coding (22/591 nt) | PP_3505 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3975786 | 68 (0.990) | intergenic (‑10/+68) | PP_3505/PP_3506 | hypothetical protein/magnesium chelatase subunit ChII |
GCGCCAGCGCCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGCGCCGCTGGCTA > NC_002947/3975608‑3975903 | gcgcCAGCGCCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGAAGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACccgg > 2:271996/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACccggccgg > 3:148869/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACccggccgg > 3:142664/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCcggccggc > 4:48948/1‑149 (MQ=255) cgcCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGgccggccg < 5:8825/149‑1 (MQ=255) gcCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGgccgc < 6:181093/149‑1 (MQ=255) cgcCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGGCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCg < 3:236419/149‑1 (MQ=255) ttGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCATGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAgg > 1:363496/1‑149 (MQ=255) aaGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCa > 3:143166/1‑149 (MQ=255) aGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGccgtggcctcgtgcgaaatgcggcggccg > 3:122303‑M1/1‑120 (MQ=255) cGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGc < 6:70662‑M2/149‑2 (MQ=255) gAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGcg < 5:365470‑M2/149‑3 (MQ=255) cATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGccgtggcctcgtgcgaaatgcggcggccggccgggta < 8:185472‑M1/149‑38 (MQ=255) aTCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCCAGGGCGGCAGCCAGGCTACCCGccgtggcctcgtccgaaatgcggcggccggccgggtag < 3:250233‑M1/149‑39 (MQ=255) aTCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTAc > 2:356146/1‑149 (MQ=255) cgacgaTCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGGCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGccgtggcctcgtgcgaaatgcggcggccggccggggagcc < 4:122303‑M1/149‑41 (MQ=255) gacgaTCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCg < 4:142664/148‑1 (MQ=255) gacgaTCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCg < 4:148869/148‑1 (MQ=255) acgaTCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGtt > 3:24599/1‑149 (MQ=255) gaTCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCATGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCt > 5:17832/1‑149 (MQ=255) aTCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTg < 6:340284/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCtt < 4:143166/149‑1 (MQ=255) ccAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTg > 1:323670/1‑149 (MQ=255) cAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGc < 1:122183/149‑1 (MQ=255) cAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGAAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGc > 7:89331/1‑149 (MQ=255) agcagGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGct < 6:249121/148‑1 (MQ=255) ctagGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGctct < 1:157393/147‑1 (MQ=255) cagGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCAGAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGGCGGCAGCCAGGCTTCCCGGCCGGCCGCGGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTg < 1:20976/149‑1 (MQ=255) cagGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTg < 7:299343/149‑1 (MQ=255) cagGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTg < 3:48948/149‑1 (MQ=255) cagGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTg > 3:401203/1‑149 (MQ=255) ctgcctTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATc < 8:392899/149‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGcccc > 3:190306/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGcccc < 2:363496/148‑1 (MQ=255) cgcTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCttt < 4:401203/149‑1 (MQ=255) cAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTtggctggtgg < 5:70662/149‑1 (MQ=255) caGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTggg < 1:271996/149‑1 (MQ=255) caGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTggg < 2:323670/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATg > 1:144908/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGc > 1:197378/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAg < 3:173991/148‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTgggg > 3:365033/1‑138 (MQ=255) cTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTgggg < 4:365033/138‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAggg < 6:423006/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACAGTTCTGCTTGCCTATGCCAGCTCTGGCATCTGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGTATGCTCAggg > 6:64301/1‑149 (MQ=255) cGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCttt < 1:327428/149‑1 (MQ=255) tGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCttttt < 4:24599/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTg < 6:17832/149‑1 (MQ=255) cGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGcc < 2:249835/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCa < 5:216352/128‑1 (MQ=255) gAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCa > 6:216352/1‑128 (MQ=255) aGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGc > 4:215216/1‑139 (MQ=255) aGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGc < 3:215216/139‑1 (MQ=255) aGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCgg < 6:365470/148‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCa > 3:355243/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCa > 1:51231/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCAc > 3:228884/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCAc > 1:156376/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAg > 3:17513/1‑125 (MQ=255) aaGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAg < 4:17513/125‑1 (MQ=255) aGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCt > 5:6210/1‑149 (MQ=255) gCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCgcggc > 7:222952/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCCTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGcggcgg < 1:356146/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTc > 1:61426/1‑132 (MQ=255) ccAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTc < 2:61426/132‑1 (MQ=255) aGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCTTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGgcgc > 8:214312/1‑149 (MQ=255) ggCTCCCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGcgggtagcctggctgccgaccttgctcaaaggacggccacgccagcgacaggccctgtgctggcagcagcgccaaggcaggcctgctgagttgtggctggtgatcgtcg < 4:122303‑M2/149‑110 (MQ=255) cTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGGACGAGGCCACGGcgggtagcctggctgccgccctggctcaaaggacggccacgccagcgacaggacctgtgctggcagcagcgccaaggcaggcctgctgagttgtggctggtgatcgtcgat < 3:250233‑M2/149‑112 (MQ=255) tACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGcgggtagcctggctgccgaccttgctcaaaggacggccacgccagcgacaggacctgtgctggcagcagcgccaaggcaggcctgctgagttgtggctggtgatcgtcgatg < 8:185472‑M2/149‑113 (MQ=255) cgccgtggcctcgtgcgaaatgcggcggccggccgggtagcctggctgccgaccttgctcaaaggacggccacgccagcgacaggacctgtgctggcagcagcgccaaggcaggcctgctgagttgtggctggtgatcgtcgatgcctc < 5:365470‑M1/149‑148 (MQ=255) gccgtggcctcgtgcgaaatgcggcggccggccgggtagcctggctgccgaccttgctcaaaggacggccacgccagcgacaggacctgtgctggcagcagcgccaaggcaggcctgctgagttgtggctggtgatcgtcgatgcctcg < 6:70662‑M1/149‑149 (MQ=255) | GCGCCAGCGCCTGATGGCGCCGGGTTGAAGCCGAGGCATCGACGATCACCAGCCACAACTCAGCAGGCCTGCCTTGGCGCTGCTGCCAGCACAGGTCCTGTCGCTGGCGTGGCCGTCCTTTGAGCAAGGTCGGCAGCCAGGCTACCCGGCCGGCCGCCGCATTTCGCACGAGGCCACGGCGGGTACCGTTCTGCTTGCCTATGCCCGCTCTGGCATCCGCCCCTTTGGCTGGTGGCTGGGGGATGCTCAGGGCTTTTTTGCCCAGTTCGGCACCTCGCGGCGGGCGCCGCTGGCTA > NC_002947/3975608‑3975903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |