New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4065591 | 62 (0.870) | 4 (0.060) | 4/260 | NT | 6.1% | coding (369/1491 nt) | PP_3582 | RND transporter outer membrane protein |
? | NC_002947 | = 4065640 | 62 (0.890) | coding (320/1491 nt) | PP_3582 | RND transporter outer membrane protein |
GGTTTCGCGCAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTCCC > NC_002947/4065444‑4065736 | ggTTTCGCGCAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGt > 8:358314/1‑149 (MQ=255) gTTTCGCGCAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGt < 1:303387/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGc > 2:108897/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTgg < 1:269275/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTgggg < 8:152428/149‑1 (MQ=255) ccccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGcccaggcgctggtgcg > 2:241008‑M1/1‑132 (MQ=255) ccccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAg > 8:84040/1‑149 (MQ=255) cccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAgc > 1:167950/1‑149 (MQ=255) cccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAgc > 8:262771/1‑149 (MQ=255) cacaaaGGTCGATCTCACAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATCACGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGTAG‑CTGACGGAGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTCGTCCTCAGGACCAGGCTGGGGAACAgc > 2:8421/6‑149 (MQ=255) ccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAgcg > 1:382944/1‑149 (MQ=255) acaGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGcgcc < 2:382944/149‑1 (MQ=255) tcCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGgctgct > 8:241040/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCa < 4:211420/140‑1 (MQ=255) cccAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCa > 3:211420/1‑140 (MQ=255) cccAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGctgctg > 4:294336/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGctgctg > 2:186612/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCtgctgc < 7:358314/149‑1 (MQ=255) cAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAg > 4:265619/1‑119 (MQ=255) cAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAg < 3:265619/119‑1 (MQ=255) aGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTgcgc < 1:186612/149‑1 (MQ=255) cACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGGCGCACGGCTGCTGCGCAc > 2:241163/1‑147 (MQ=255) aCGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCa < 2:170602/148‑1 (MQ=255) gCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAgcg > 7:157265/1‑149 (MQ=255) cAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCTAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcct > 3:312743/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctg > 4:20641/1‑149 (MQ=255) aCTGCGGGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACTGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctgg < 1:181471/149‑1 (MQ=255) cgcgTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGcct < 5:1261‑M2/149‑4 (MQ=255) cgcgTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGc > 6:42997‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGcctg < 6:294380‑M2/149‑5 (MQ=255) cgTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGcccaggcgctggtgcgcagcagccgtgcggcgctgttccccagcctggacctga < 1:241008‑M1/149‑55 (MQ=255) gTTGTAGGTGGTGGGAATGCCGGTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGGCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGc < 4:252067/149‑1 (MQ=255) gTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGa > 4:92494/1‑148 (MQ=255) ggTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAgc < 5:325994/130‑1 (MQ=255) ggTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACt > 6:14901/1‑149 (MQ=255) ggTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGACGAGCGGTTCATGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAgc > 6:325994/1‑130 (MQ=255) ttGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGc < 1:108897/149‑1 (MQ=255) gAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGCTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCt < 8:352998/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGGTTATTGGCCCGGCTGCCACGGGCG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTGCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACCGCGCCGCACGGCTGCCGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTCCTGAttcc < 8:157265/149‑3 (MQ=255) gctgctGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGcccaggcgctggtgcgcagcagccgtgcggcgctgttccccagcctggacc < 5:288423‑M1/124‑52 (MQ=255) gctgctGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGcccaggcgctggtgcgcagcagccgtgcggcgctgttccccagcctggacc > 6:288423‑M1/1‑73 (MQ=255) gctgctGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTgcg < 8:54222/149‑1 (MQ=255) gctgctGTTATAGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTgcg > 1:292363/1‑149 (MQ=255) ctgTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCa < 4:192821/148‑1 (MQ=255) ttATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGt > 3:291593/1‑149 (MQ=255) aTTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGTTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCATGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCt > 5:333282/1‑149 (MQ=255) aTTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCt > 2:96135/1‑149 (MQ=255) tGGACATGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTTCTCATGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACTGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTg < 1:8421/148‑1 (MQ=255) gACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACg > 1:221465/1‑141 (MQ=255) gACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACg < 2:221465/141‑1 (MQ=255) gCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCCCGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTtgctgc > 3:258690/1‑149 (MQ=255) tGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCgg > 7:136121/1‑149 (MQ=255) aCTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGGCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGa < 1:241163/149‑1 (MQ=255) aCTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGa < 7:84040/149‑1 (MQ=255) cTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAg < 5:114367/149‑1 (MQ=255) cTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAg > 7:26996/1‑149 (MQ=255) ggAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGc > 2:424711/1‑148 (MQ=255) gAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGctc > 5:358663/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGa > 2:247704/1‑97 (MQ=255) gCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCAGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGa < 1:247704/97‑1 (MQ=255) ccGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGAc < 5:62157/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGAc < 2:95060/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCa < 5:294380/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCAt > 4:37092/1‑149 (MQ=255) ccGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGt < 6:322822/114‑1 (MQ=255) ccGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGt > 5:322822/1‑114 (MQ=255) ccGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGc < 5:14901/149‑1 (MQ=255) cGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGcc > 5:40258/1‑149 (MQ=255) gAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGcc > 5:139930/1‑148 (MQ=255) aGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGcc > 5:347498/1‑147 (MQ=255) cTGGGGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTa < 1:208902/149‑1 (MQ=255) gTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGTGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGAt < 5:317385/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGAttt > 6:169745/1‑149 (MQ=255) tCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGcctgagcaccagcaagaaccgctcggcgcagggcaccggcagctccagttccagcctgtccaataacagcagcggcattcgcaacacctacaacg < 1:241008‑M2/149‑96 (MQ=255) tCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTcc > 5:196237/1‑149 (MQ=255) cAGGcccaggcgctggtgcgcagcagccgtgcggcgctgttccccagcctggacctgagcaccagcaagaaccgctcggcgcagggcaccggcagctccagttccagcctgtccaataacagcagcggcattcgcaacacctacaacgc < 6:294380‑M1/149‑146 (MQ=255) aGGcccaggcgctggtgcgcagcagccgtgcggcgctgttccccagcctggacctgagcaccagcaagaaccgctcggcgcagggcaccggcagctccagttccagcctgtccaataacagcagcggcattcgcaacacctacaacgcg < 5:1261‑M1/149‑147 (MQ=255) aGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTCTGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTcc < 1:96135/148‑1 (MQ=255) ggTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGcctgagcaccagcaagaaccgctcggcgcagggcaccggcagctccagttccagcctgtccaataacagcagc < 5:288423‑M2/124‑74 (MQ=255) ggTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGcctgagcaccagcaagaaccgctcggcgcagggcaccggcagctccagttccagcctgtccaataacagcagc > 6:288423‑M2/1‑51 (MQ=255) gcccaggcgctggtgcgcagcagccgtgcggcgctgttccccagcctggacctgagcaccagcaagaaccgctcggcgcagggcaccggcagctccagttccagcctgtccaataacagcagcggcattcgcaacacctacaacgcg > 6:42997‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTTTCGCGCAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAG‑CTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGT‑TGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTCCC > NC_002947/4065444‑4065736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |