New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4700127 = | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 5.3% | coding (561/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
? | NC_002947 | 4700178 = | 74 (1.120) | coding (510/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
ACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCG > NC_002947/4699980‑4700275 | aCGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGc < 7:338312/149‑1 (MQ=255) cGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCg > 3:151626/1‑149 (MQ=255) aggatgtgcaagaactcttggccgcgggcatcgacgtgtacaccacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGCGTTc < 4:289207‑M1/6‑1 (MQ=255) ggatgtgcaagaactcttggccgcgggcatcgacgtgtacaccacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGCGTTCg > 4:341940‑M1/143‑149 (MQ=255) ccGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGag < 1:188515/149‑1 (MQ=255) atgtgcaagaactcttggccgcgggcatcgacgtgtacaccacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGCGTTCGag > 6:371104‑M1/141‑149 (MQ=255) tgtgcaagaactcttggccgcgggcatcgacgtgtacaccacggtcaacgtccagcacctggaaagcctcaacgacaaggtccgcgacattaccggcgtgcaagtgcgcgagaccctgccggactgggtgctgcaggaaGCGTTCGagc > 3:195980‑M1/140‑149 (MQ=255) ggCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGagcagc < 4:211792/148‑1 (MQ=255) ccAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGctct < 7:356728/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGctct > 3:84367/1‑149 (MQ=255) aGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTcg < 7:17089/149‑1 (MQ=255) cgccATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGAGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCCTCGATGGCCGCCCATGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTcgcg > 6:342794/4‑147 (MQ=255) ggCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGa < 7:102621/148‑1 (MQ=255) 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cATGACCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCa > 7:319266/1‑134 (MQ=255) gCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTc > 8:310244/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTAGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATCGCCGCCCTTGCCTGCTCGGCCACCTACACCTAGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTc > 8:218037/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTcc > 1:325306/1‑149 (MQ=255) catcTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGGTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCt < 8:407387/146‑1 (MQ=255) 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ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 8:87046/149‑1 (MQ=255) ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 5:292875/149‑1 (MQ=255) gttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAggg > 4:317585/1‑149 (MQ=255) ttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGt < 5:276594/149‑1 (MQ=255) ttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGt < 5:270312/149‑1 (MQ=255) 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acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCCGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg > 5:95124/1‑149 (MQ=255) acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg < 4:309088/149‑1 (MQ=255) acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg > 2:248212/1‑149 (MQ=255) acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg < 6:42100/149‑1 (MQ=255) acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg > 7:88973/1‑149 (MQ=255) acCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAg > 4:128497/1‑149 (MQ=255) cTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGt > 8:332956/1‑149 (MQ=255) ccTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGTAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCt < 7:233481/148‑1 (MQ=255) ccTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCt < 4:2235/148‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCGGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACtt < 3:3916/99‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCGGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACtt > 4:3916/1‑99 (MQ=255) cACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGa < 3:128497/147‑1 (MQ=255) cGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGtt > 2:364565/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGtt > 1:9539/1‑148 (MQ=255) gCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAACACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGtt > 5:117877/1‑148 (MQ=255) cAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAGCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGa < 7:218037/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCa > 7:11186/1‑77 (MQ=255) cAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCa < 8:11186/77‑1 (MQ=255) ggCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGAcc < 7:209022/149‑1 (MQ=255) GCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCg > 5:105096‑M1/1‑149 (MQ=255) | ACGATAGCCGTGGGCCAGGTCGGCATCGACCTGAGCAGCGGCGGTCTGCATGGCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCG > NC_002947/4699980‑4700275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |