| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4700127 = | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 5.3% | coding (561/2655 nt) | kdpD | sensor protein |
| ? | NC_002947 | 4700178 = | 74 (1.120) | coding (510/2655 nt) | kdpD | sensor protein | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATCCT > NC_002947/4700032‑4700320 | gCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTc > 8:310244/1‑149 (MQ=255)gCCAGCTAGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATCGCCGCCCTTGCCTGCTCGGCCACCTACACCTAGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTc > 8:218037/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTcc > 1:325306/1‑149 (MQ=255) catcTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGGTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCt < 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gcgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTgcagca > 2:336657/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAc < 6:439760/149‑1 (MQ=255) gcAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCAcc < 7:310244/149‑1 (MQ=255) aGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCa < 8:225696/149‑1 (MQ=255) cGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTcc > 5:218535/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCg > 2:246026/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCg > 6:292875/1‑149 (MQ=255) gTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCgg < 4:84367/149‑1 (MQ=255) gTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCCAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCgg < 7:75743/149‑1 (MQ=255) ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 8:87046/149‑1 (MQ=255) ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 5:292875/149‑1 (MQ=255) ggttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAgg < 1:352542/149‑1 (MQ=255) gttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAggg > 4:317585/1‑149 (MQ=255) ttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGt < 5:276594/149‑1 (MQ=255) ttggttTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGt < 5:270312/149‑1 (MQ=255) 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gAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGccc < 2:331759/149‑1 (MQ=255) aGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTacac > 3:78998/1‑134 (MQ=255) aGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTacac < 4:78998/134‑1 (MQ=255) aGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGc < 5:235766/149‑1 (MQ=255) gTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtg > 4:100187/1‑124 (MQ=255) gTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCgtg < 3:100187/124‑1 (MQ=255) 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tCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGt > 4:106319/1‑149 (MQ=255) aGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGtt < 7:332956/148‑1 (MQ=255) aGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGtt < 1:246026/148‑1 (MQ=255) cACCAGGTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCTCGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGGTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCtt < 3:19635/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGc < 2:80889/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGca > 5:284851/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGc > 3:398390/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGc > 3:50578/1‑148 (MQ=255) gctcgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGcaca > 3:195980‑M2/11‑149 (MQ=255) ctcgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACAt > 6:371104‑M2/10‑149 (MQ=255) cgaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATcc > 4:341940‑M2/8‑149 (MQ=255) gaacgcTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATCCt < 4:289207‑M2/143‑1 (MQ=255) | GCCAGCTCGCGCAGGGCGGTGAGGTTGGTTTGCGAAAAATACGCATCGATGGCCGCCCTTGCCTGCTCGGGCACGTACACCTTGCCTTCACGCAGGCGTTCGAGCAGCTCTCGCGGAGGCAGGTCGATCAGCACCAGCTCGAACGCTTCCTGCAGCACCCAGTCCGGCAGGGTCTCGCGCACTTGCACGCCGGTAATGTCGCGGACCTTGTCGTTGAGGCTTTCCAGGTGCTGGACGTTGACCGTGGTGTACACGTCGATGCCCGCGGCCAAGAGTTCTTGCACATCCT > NC_002947/4700032‑4700320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |