New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 4820219 | 63 (0.880) | 4 (0.060) | 4/260 | NT | 5.9% | coding (10971/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
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CGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGCTGGCGTTCAGGTGCTGG > NC_002947/4820071‑4820366 | cgATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCG < 8:350919‑M1/149‑1 (MQ=255) cgATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCG < 1:405580‑M1/149‑1 (MQ=255) gATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCgg > 1:198966/1‑149 (MQ=255) gATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCgg < 2:328964/149‑1 (MQ=255) gATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCgg > 7:51327/1‑149 (MQ=255) aGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCcag > 3:294728/1‑148 (MQ=255) tctGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCgg > 4:18662/1‑141 (MQ=255) tctGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCgg < 3:18662/141‑1 (MQ=255) tGCTCCAGCGGATAAACCCACTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAgg < 8:235761/147‑1 (MQ=255) gCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGgcgc > 1:394514/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGcc > 5:102954/1‑139 (MQ=255) cTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGcc < 6:102954/139‑1 (MQ=255) cAGCGGTTAAAGCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGa < 4:149297/149‑1 (MQ=255) 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ctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGGTCTGCAGCGTTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTGAAAACGTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGaccagcgctacttcgactacccgaccgtcgagcgcctgctggccgaatt < 2:132314‑M1/149‑50 (MQ=255) ctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAAc > 5:400710/1‑148 (MQ=255) tccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGa > 4:172285/1‑149 (MQ=255) agcagGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAg < 4:294728/149‑1 (MQ=255) gcagGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCC‑CTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCAAACCACAg > 5:256149/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |