New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5648818 = | 87 (1.210) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 5.1% | coding (248/540 nt) | ygjP | metal‑dependent hydrolase |
? | NC_002947 | 5648861 = | 67 (1.010) | coding (205/540 nt) | ygjP | metal‑dependent hydrolase |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AACAATCATGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCAT > NC_002947/5648670‑5648966 | aacaaTCATGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGC‑GACTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGaa > 7:21925/1‑149 (MQ=255) caaTCATGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAAc < 7:271435/149‑1 (MQ=255) gcaagcctaccccccgcacctgcaggcgcaggtgcggcagatgatcgacagcgaccgcctgggtgaatacctgcagcgccgttaccctgaccgccatgacgtgcaaagcgacaaggcgctgtatggctatgcccaggatctgcgccaa > 5:37700‑M1/147‑148 (MQ=255) gcaagcctaccccccgcacctgcaggcgcaggtgcggcagatgatcgacagcgaccgcctgggtgaatacctgcagcgccgttaccctgaccgccatgacgtgcaaagcgacaaggcgctgtatggctatgcccaggatctgcgccaa < 6:37700‑M1/2‑1 (MQ=255) aaTCATGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGaa > 8:323153/1‑147 (MQ=255) aaTCATGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACa < 6:164340/149‑1 (MQ=255) tGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTAcc < 3:313776/149‑1 (MQ=255) cctaccccccgcacctgcaggcgcaggtgcggcagatgatcgacagcgaccgcctgggtgaatacctgcagcgccgttaccctgaccgccatgacgtgcaaagcgacaaggcgctgtatggctatgcccaggatctgcgccAACAGTAc > 4:16725‑M1/142‑149 (MQ=255) gcAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCGTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTAcc < 6:78031/146‑1 (MQ=255) gcAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTAcc > 5:78031/1‑146 (MQ=255) gcAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTg < 4:317941/149‑1 (MQ=255) aaCTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAg < 5:297456/149‑1 (MQ=255) aaCTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGAGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCCATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGATGTAGAAAACTAACTTCTCAAg > 6:303719/1‑149 (MQ=255) 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tcctTGAACAGCGAGGCGATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCg > 5:176888/1‑149 (MQ=255) tcctTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCg > 4:181490/1‑149 (MQ=255) tcctTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCg > 5:103750/1‑149 (MQ=255) tcctTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCg > 2:302011/1‑149 (MQ=255) gAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAg < 1:255834/147‑1 (MQ=255) 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ccgTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGt > 7:405282/1‑147 (MQ=255) ccgTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCa < 8:405282/149‑1 (MQ=255) gtgtTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAgg < 7:44819/149‑1 (MQ=255) tgtTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGGCAggg < 5:432747/149‑1 (MQ=255) aaGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAAc < 1:302011/148‑1 (MQ=255) cccAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGgcg > 5:295754/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGgcgc > 3:125347/1‑149 (MQ=255) gggCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGc < 4:24716/149‑1 (MQ=255) ggCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGTACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTg > 3:398083/1‑147 (MQ=255) ggCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCa < 7:206193/149‑1 (MQ=255) ccGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAgg > 3:359343/1‑148 (MQ=255) gATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACATGCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTa < 1:107514/149‑1 (MQ=255) gTCAG‑ATCGAGGCGGCTGGCGAACAGTACCTTGTCCAGGTGTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCAcc < 6:304717/149‑1 (MQ=255) tCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGTCATAGACATTGA‑GCTCTTTTTCGCTTTGAACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTAAccc < 5:303719/149‑1 (MQ=255) tCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTACCGGCGCTGCAGGTATTcccc > 8:121195/1‑148 (MQ=255) tCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGc < 6:181910/137‑1 (MQ=255) tCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGc > 5:181910/1‑137 (MQ=255) cAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCAcc > 5:186505/1‑147 (MQ=255) aTCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCAcc > 6:236245/1‑144 (MQ=255) aTCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCAcc < 5:236245/144‑1 (MQ=255) aGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTc > 8:183610/1‑149 (MQ=255) cggcTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTGTGGCGCACTGCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCGTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGGCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCt < 7:151231/149‑1 (MQ=255) tGTAGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTTGCGCACTTCGAAGGTAATGTTGGAGCAGATCCTGGGCATAGCAATACA‑GCGACTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTAACACATGCGGTAGCTTTCg > 2:250129/1‑149 (MQ=255) tCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGa < 4:125347/148‑1 (MQ=255) AACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGatcat > 4:174000‑M1/1‑149 (MQ=255) AACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACACAGGCGGTCGCTGTCGatca < 7:305604‑M1/148‑1 (MQ=255) | AACAATCATGCGCAAGAACTGTGGCGCGGCCTCCTTGAACAGCGAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCAT > NC_002947/5648670‑5648966 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |