| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5648818 = | 87 (1.210) | 4 (0.060) | 4/248 | NT | 5.1% | coding (248/540 nt) | ygjP | metal‑dependent hydrolase |
| ? | NC_002947 | 5648861 = | 67 (1.010) | coding (205/540 nt) | ygjP | metal‑dependent hydrolase | |||||
GAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAA > NC_002947/5648713‑5649008 | gAGGCAATGC‑GACTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTgg < 8:21925/149‑1 (MQ=255) tgatcgacagcgaccgcctgggtgaatacctgcagcgccgttaccctgaccgccatgacgtgcaaagcgacaaggcgctgtatggctatgcccaggatctgcgccAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTg > 2:393929‑M1/106‑149 (MQ=255) aGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTgg < 7:16670/149‑1 (MQ=255) ggCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGgc > 3:23999/1‑149 (MQ=255) ggCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGgc < 8:42253/149‑1 (MQ=255) ggCAATGCGGATCTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCACGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGgc < 4:301871/149‑1 (MQ=255) gCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGgc > 8:206193/1‑148 (MQ=255) atcgacagcgaccgcctgggtgaatacctgcagcgccgttaccctgaccgccatgacgtgcaaagcgacaaggcgctgtatggctatgcccaggatctgcgccAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTgg > 4:197579‑M1/104‑148 (MQ=255) cGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAGTCACGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGa < 1:349116/148‑1 (MQ=255) cGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATc < 7:111007/149‑1 (MQ=255) ggATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATca > 8:304518/1‑148 (MQ=255) tttCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTgg < 2:39206/149‑1 (MQ=255) cttcttCGCCTTGCGCTTGACACCCTGCCCCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGGCAG‑AGCGAGGCGGCTGTCGACCCGTCCCTTGACCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGTTACTGTTGGCGCAGCTCCAGGGCa > 8:151231/1‑148 (MQ=255) ttcttcGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCa > 2:150477/1‑147 (MQ=255) cttcGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATa < 6:283611/147‑1 (MQ=255) cttcGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAg < 6:369109/148‑1 (MQ=255) cttcGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGc > 6:392091/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CAt < 5:392091/148‑1 (MQ=255) 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aCCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGTTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATACC‑CATACC‑GCGCCTTGTCGCTTTGCAc > 8:350701/1‑149 (MQ=255) aCCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCAc < 5:433425/149‑1 (MQ=255) cccGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACg < 1:219984/149‑1 (MQ=255) gcgACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGAATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCa > 8:216773/1‑149 (MQ=255) acCGCGGTGTTCAATCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGGCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCg < 8:406220/149‑1 (MQ=255) 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aGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATGCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGGCTTGTCGCTTTGCACGTCTTGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTgggg < 8:16683/149‑4 (MQ=255) aGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGTCATAGA‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTAACCCAGGAGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTgcgc > 1:164694/1‑149 (MQ=255) aGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTgcgc < 4:359343/149‑1 (MQ=255) aGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTgcgc < 6:176888/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCGCACTTCGCATGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCt < 4:314443/149‑1 (MQ=255) gcgcACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGcc > 2:78099/1‑132 (MQ=255) gcgcACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGcc < 1:78099/132‑1 (MQ=255) gcgcACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAgg < 6:186505/149‑1 (MQ=255) cACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGTACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGc < 4:398083/149‑1 (MQ=255) ttCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGCGCATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCgg > 1:291143/1‑149 (MQ=255) ttCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTTCggg > 7:270752/1‑149 (MQ=255) ttCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCggg < 7:216773/149‑1 (MQ=255) gCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTTCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCgggggg > 3:39258/1‑149 (MQ=255) gCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGGCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCggggg < 7:183610/148‑1 (MQ=255) gtactgttGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAgg > 4:16725‑M2/9‑149 (MQ=255) ttGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGc > 5:37700‑M2/3‑148 (MQ=255) ttGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGc < 6:37700‑M2/146‑1 (MQ=255) ggCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCaa < 4:69822/148‑1 (MQ=255) | GAGGCAATGCGGATTTCCTTCTTCGCCTTGAGCTTGCCACCCTGCACCCGCGACACCGCCGTGTTCAAGCCCAGGGCCCGATGCGTCAG‑ATCGAGGCGGCTGTCGAACAGTACCTTGTCCAGGTTTGGCGCACTTCGCAGGTACTGTTGGCGCAGATCCTGGGCATAGC‑CATACA‑GCGCCTTGTCGCTTTGCACGTCATGGCGGTCAGGGTAACGGCGCTGCAGGTATTCACCCAGGCGGTCGCTGTCGATCATCTGCCGCACCTGCGCCTGCAGGTGCGGGGGGTAGGCTTGCAA > NC_002947/5648713‑5649008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |