New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5789214 | 55 (0.770) | 4 (0.060) | 4/254 | NT | 7.8% | coding (371/1278 nt) | ynfM | efflux transporter |
? | NC_002947 | = 5789242 | 42 (0.620) | coding (399/1278 nt) | ynfM | efflux transporter |
CGCGGCACAGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATTGGCCTGGCCATGGGCCTGTAC > NC_002947/5789068‑5789356 | cgcgGCACAGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAgcg < 6:397429/149‑1 (MQ=255) gcgGCACAGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAgcgc < 3:95258/149‑1 (MQ=255) gCACAGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGt > 2:383216/1‑149 (MQ=255) cacaGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGt > 1:81183/1‑148 (MQ=255) acaGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGtaccagct > 6:98912‑M1/1‑141 (MQ=255) caGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGAt < 2:6214/149‑1 (MQ=255) cagcCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCa > 4:186536/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCt > 8:190320/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCt > 7:68224/1‑149 (MQ=255) gTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGa < 6:256519/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGc < 8:264660/148‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTAGGACTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGc < 8:7896/148‑1 (MQ=255) tGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCt > 2:305942/1‑148 (MQ=255) tGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTg > 4:11257/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCt < 1:305942/146‑1 (MQ=255) tCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTgg < 4:203027/148‑1 (MQ=255) tCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTg < 6:237226/147‑1 (MQ=255) cACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTActggcca < 6:396377‑M2/149‑8 (MQ=255) cACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTActggcca < 4:22994‑M2/149‑8 (MQ=255) aCCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCAc > 8:266903/1‑149 (MQ=255) aCCGACATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATg < 2:75875/123‑1 (MQ=255) aCCGACATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATg > 1:75875/1‑123 (MQ=255) ccGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGtaccagctcccagctgggcatcactgcgctggccaag < 6:110476‑M1/149‑38 (MQ=255) cGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGtaccagctcccagctgggcatcactgcgctggccaagg < 5:98912‑M1/149‑39 (MQ=255) gCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGtaccagctcccagctgggcatcactgcgctggccaaggt < 5:380166‑M1/149‑40 (MQ=255) ctgATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCt < 2:288837/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGc < 4:84535/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGc < 8:296427/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCgg < 7:190320/149‑1 (MQ=255) ggCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCt > 4:13142/1‑149 (MQ=255) ccATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTggcg > 3:27454/1‑149 (MQ=255) cATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTggcgg < 1:383216/149‑1 (MQ=255) aCCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTg < 1:76358/146‑1 (MQ=255) tCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACt > 1:390497/1‑149 (MQ=255) ggACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTa > 6:367609/1‑149 (MQ=255) gACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTAc < 7:266903/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGa < 3:11257/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGa < 5:396377/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCcg < 3:324637/92‑1 (MQ=255) aaGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCcg > 4:324637/1‑92 (MQ=255) aaGCCAGAGATGCTGTTCGCGCTCGACAGCGCCGCCCTGTCCACCTAGGCCAGCCCAGTCATGCCCAGCTGTGAGCTGGTACTGCCCACACGCGCATTTGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTCGCGATGACTTACCTGAg > 8:326213/1‑149 (MQ=255) gCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCg < 3:22994/149‑1 (MQ=255) cccGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAACAGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCg > 1:354790/1‑148 (MQ=255) ccGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCg > 4:388625/1‑147 (MQ=255) ccGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGaa < 5:317986/149‑1 (MQ=255) ccGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGaa < 4:27454/149‑1 (MQ=255) ccGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGaa < 2:390497/149‑1 (MQ=255) cGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAag < 3:186536/149‑1 (MQ=255) gTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGc < 1:387743/70‑1 (MQ=255) gTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGc > 2:387743/1‑70 (MQ=255) gATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTgg < 1:415592/125‑1 (MQ=255) gATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTgg > 2:415592/1‑125 (MQ=255) gtgtTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGa < 5:358914/124‑1 (MQ=255) gtgtTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGa > 6:358914/1‑124 (MQ=255) gtgtTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCa > 2:188439/1‑149 (MQ=255) gtTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCAcc > 5:406001/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGc < 2:81183/148‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATtgg > 3:132111/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATtggc > 1:116372/1‑149 (MQ=255) cgccgcCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATtggcc > 2:394722/1‑149 (MQ=255) ccgccCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATtggcctg < 3:13142/149‑1 (MQ=255) cccTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATtggcctggc > 6:270877/1‑148 (MQ=255) tCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATTGGCCTGGCCATggg < 8:68224/149‑1 (MQ=255) aCCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTActggccaaggtggacagggcggcgcagaccagcgcgaacaccatcacgggcttgcgtccgatgcggtcagaaatggggccggtgatcagcaggccgaacgccagcatggc < 5:380166‑M2/149‑111 (MQ=255) ccTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTActggccaaggtggacagggcggcgcagaccagcgcgaacaccatcacgggcttgcgtccgatgcggtcagaaatggggccggtgatcagcaggccgaacgccagcatggcg < 5:98912‑M2/149‑112 (MQ=255) cTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTActggccaaggtggacagggcggcgcagaccagcgcgaacaccatcacgggcttgcgtccgatgcggtcagaaatggggccggtgatcagcaggccgaacgccagcatggcgg < 6:110476‑M2/149‑113 (MQ=255) tGGCCAGtaccagctcccagctgggcatcactgcgctggccaaggtggacagggcggcgcagaccagcgcgaacaccatcacgggcttgcgtccgatgcggtcagaaatggggccggtgatcagcaggccgaacgccagcatggcggtg < 6:396377‑M1/149‑143 (MQ=255) tGGCCAGtaccagctcccagctgggcatcactgcgctggccaaggtggacagggcggcgcagaccagcgcgaacaccatcacgggcttgcgtccgatgcggtcagaaatggggccggtgatcagcaggccgaacgccagcatggcggtg < 4:22994‑M1/149‑143 (MQ=255) | CGCGGCACAGAGCAGCCTGGTGCTGTCGGTGTCCACCGCCATGCTGGCGTTCGGCCTGCTGATCACCGGCCCCATTTCTGACCGCATCGGACGCAAGCCCGTGATGGTGTTCGCGCTGGTCTGCGCCGCCCTGTCCACCTTGGCCAGCGCAGTGATGCCCAGCTGGGAGCTGGTACTGGCCACCCGCGCATTGGTCGGCCTGTCGCTGAGCGGCCTGGCGGCAGTGGCGATGACTTACCTGAGCGAAGAGATCCACCCGCAACACATTGGCCTGGCCATGGGCCTGTAC > NC_002947/5789068‑5789356 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |