| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6117733 | 66 (0.920) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 6.0% | coding (42/471 nt) | PP_5367 | transketolase domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | = 6117802 | 62 (0.900) | intergenic (‑28/+68) | PP_5367/PP_5368 | transketolase domain‑containing protein/MFS transporter | |||||
CCGCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCTCCGACGTTTCATGACAACCT > NC_002947/6117587‑6117881 | ccGCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCTGCAATCGACTACATGGTCTCATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTG < 2:220119‑M1/147‑1 (MQ=255)ccGCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCt > 7:4999/1‑149 (MQ=255) cGCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCtt < 6:178844/149‑1 (MQ=255) gCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCttt > 2:153015/1‑149 (MQ=255) gCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCttt < 6:153429/149‑1 (MQ=255) gCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCttt > 6:330304/1‑149 (MQ=255) cAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCtttt < 3:261481/149‑1 (MQ=255) gCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGt > 2:336133/1‑149 (MQ=255) ttGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTTAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATTGTCCCTGGGTTTGCTCTTGTTa > 5:323213/1‑149 (MQ=255) ttGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTTATTTTGTTa > 3:96934/1‑149 (MQ=255) gTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTa < 4:180770/147‑1 (MQ=255) gTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTAt < 5:330304/148‑1 (MQ=255) tCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATggg > 4:178802/1‑149 (MQ=255) cGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATggg > 2:197594/1‑148 (MQ=255) cGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATggg > 2:419907/1‑148 (MQ=255) ggACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGt < 2:385564/148‑1 (MQ=255) cccTTCGAACAAATCCGGGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGCTCGCTGGCTTTCGCAGACGTCGGCATAGTCTTTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAggg < 1:255831/149‑1 (MQ=255) ccTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGt < 3:178802/149‑1 (MQ=255) cTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTg < 3:318340/149‑1 (MQ=255) cTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTg < 1:274353/149‑1 (MQ=255) cTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTg > 4:118487/1‑149 (MQ=255) cTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTAGCTCTTGTTATGGGTAGGGTg > 1:394896/1‑149 (MQ=255) gAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGt > 1:220143/1‑149 (MQ=255) aaaTCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACTTGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGc > 1:152992/1‑147 (MQ=255) aaaTCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGc > 8:39530/1‑147 (MQ=255) aaaTCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCa < 6:107290/149‑1 (MQ=255) aTCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAgg < 7:81445/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAggg < 7:44857/135‑1 (MQ=255) ccGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAggg > 8:44857/1‑135 (MQ=255) cgcgCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGAGCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGTGa < 7:274788/148‑1 (MQ=255) gcgcCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGCGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTTCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGaca < 1:204439/149‑1 (MQ=255) gcgcCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGaca > 3:49397/1‑149 (MQ=255) gcgcCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGaca > 2:398470/1‑149 (MQ=255) cacCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCt > 4:327734/1‑149 (MQ=255) acCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAgg > 7:39265/1‑134 (MQ=255) acCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAgg < 8:39265/134‑1 (MQ=255) cGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacc > 6:141481‑M1/1‑96 (MQ=255) acaacaTGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTTTAGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATaga > 1:146262/1‑147 (MQ=255) acaacaTGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCtt < 8:98122/138‑1 (MQ=255) acaacaTGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCtt > 7:98122/1‑138 (MQ=255) 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aTGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGc > 5:30657/1‑149 (MQ=255) cGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggacc < 1:250163‑M1/147‑78 (MQ=255) cGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggacc > 2:250163‑M1/1‑70 (MQ=255) gAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCaa < 5:407594/148‑1 (MQ=255) gCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGTGAAAACAGGGCTCAATTGa < 2:220143/149‑1 (MQ=255) 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aTTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTTGGCTCCGACGtt > 6:316382/1‑149 (MQ=255) ttATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCTCCGACGttt > 2:355688/1‑149 (MQ=255) tGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCTCCGACGTTTCAt < 3:327734/149‑1 (MQ=255) tgtaccTGCTTTTGCTTTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGTACACTTCACCGCTTAACCATATAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCTGACATCAAATGTAGTTAGGCGGACATATCCCTTGGCTCCGACGTTTCAt < 4:96934/144‑1 (MQ=255) tgTCACTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCTCTTAACCATTCTGATCGAAATCAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGTCATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCGCTGGGCTCCGACGTTTCAt < 1:315602/147‑1 (MQ=255) ggTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAAcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcg > 2:250163‑M2/1‑77 (MQ=255) ggTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAAcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcg < 1:250163‑M2/147‑71 (MQ=255) tCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAAcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcgacat < 5:141481‑M2/149‑75 (MQ=255) tCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGAAATATCCCTGGGCTCCGACGTTTCATGa > 1:28943/1‑148 (MQ=255) cccTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcgacatg > 1:398470‑M1/1‑5 (MQ=255) cccTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagt < 1:398437‑M1/35‑31 (MQ=255) cccTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagt > 2:398437‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcgacatgt > 2:152992‑M1/1‑4 (MQ=255) ccTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcgacatgt < 3:414578‑M1/149‑146 (MQ=255) ccTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCTCCGACGTTTCATGACaa > 2:434894/1‑149 (MQ=255) cTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcgacatgtg < 7:173482‑M1/149‑147 (MQ=255) cTGttttcgctctctatggttaagcggtgaagtgtccctggcactgcaccctacccataacaagagcaaaagcagggaccataatgactatgacgacgtctgggaaagccagcgatcagttggctcagggattcaagcctcgacatgt > 1:153015‑M1/1‑3 (MQ=255) tGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCCCCGACGTTTc > 7:293595/1‑140 (MQ=255) tGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCCCCGACGTTTc < 8:293595/140‑1 (MQ=255) gCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCTCCGACGTTTCATGACAACCt > 7:141078/1‑149 (MQ=255) | CCGCAGCGATCGCTTGTTCGGACCCTACGAACAAATCCGCGCCGATCACACCGGCAATCGACAACATGGTCACATGTCGAGGCTTGAATCCCTGAGCCAACTGATCGCTGGCTTTCCCAGACGTCGTCATAGTCATTATGGTCCCTGCTTTTGCTCTTGTTATGGGTAGGGTGCAGTGCCAGGGACACTTCACCGCTTAACCATAGAGAGCGAAAACAGGGCTCAATTGACTGGTTCGGACATCAAATGGAGTGAGGCGGACATATCCCTGGGCTCCGACGTTTCATGACAACCT > NC_002947/6117587‑6117881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |