| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1975475 | 88 (1.230) | 6 (0.090) | 5/258 | NT | 7.3% | coding (407/1104 nt) | pheA | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 1975492 | 67 (0.970) | coding (424/1104 nt) | pheA | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase | |||||
CTGGAAGAGCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGA > NC_002947/1975345‑1975640 | cTGGAAGAGCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑ac > 2:296625/1‑148 (MQ=255) gAAGAGCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aactt > 8:17137‑M2/1‑145 (MQ=255) agagCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCg < 1:255293/149‑1 (MQ=255) agagCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCg < 8:274336/149‑1 (MQ=255) agagCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCg < 3:28/149‑1 (MQ=255) gagCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCGAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCTGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCg < 7:183255/148‑1 (MQ=255) gagCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTGCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCgg < 6:291017/149‑1 (MQ=255) agCCGCTGAAAATCGCCTCCCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCggg < 1:296625/149‑2 (MQ=255) ccGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGgtgt > 3:289066/1‑149 (MQ=255) ccGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACACAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGgtgt > 6:10622/1‑149 (MQ=255) gCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTgtgg < 6:265714/149‑1 (MQ=255) aaaTCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCg < 5:269442/149‑1 (MQ=255) aaaTCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCg < 2:92630/149‑1 (MQ=255) aTCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGt < 2:238499/149‑1 (MQ=255) aTCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGt < 7:313764/149‑1 (MQ=255) tCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTg > 5:235773/1‑149 (MQ=255) cTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTgggcc > 6:187837/1‑146 (MQ=255) cTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTc > 7:191516/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTcc > 3:138441/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTc > 8:121545/1‑148 (MQ=255) ggCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCAc < 5:296527/149‑1 (MQ=255) gCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACt > 5:260735/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGgtgt < 4:244094/123‑1 (MQ=255) tGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGAGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGgtgt > 3:244094/1‑123 (MQ=255) aaGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAg < 8:191516/147‑1 (MQ=255) aaGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGt > 6:341931/1‑149 (MQ=255) ttCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGTCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAg > 3:207889/1‑149 (MQ=255) tCACCCAGGGGGCGGCCATTAAGCACTTCGGCCACGCGGTTATCAGTCGGCCTTTGGCGGCAATCGACGATGTGTTCGGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGgtgt < 4:24569/112‑1 (MQ=255) cACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAg < 5:247934/147‑1 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGt < 1:349950/117‑1 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGt > 2:349950/1‑117 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCcaca < 7:248054/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCcaca > 3:115622/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCcaca > 4:25391/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGAG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGcc > 7:88568/1‑146 (MQ=255) ccAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGAG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGcc < 8:88568/146‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTGTTC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCacac < 1:124842/149‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACAcc < 7:121545/149‑1 (MQ=255) ggcggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACAccc > 5:252433/1‑149 (MQ=255) gcggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCt < 5:28561/149‑1 (MQ=255) cggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGTCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTg < 4:207889/149‑1 (MQ=255) cggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCTGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTg < 8:141164/149‑1 (MQ=255) cggcggcCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTg < 6:260735/149‑1 (MQ=255) gAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGAG‑CCGGGGGGGGCGAATGGCTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTg > 1:358686/1‑149 (MQ=255) aaGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCCGCCGATGGCGCCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGCCCCGAG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CATCGGTCTGGTGCCGCTGGAAAACTCCACTGAACGTGCGGTCAGCCACACCCTGCACAGCTACCt > 4:323377/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCa > 4:80988/1‑149 (MQ=255) gCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGc < 8:303849/119‑1 (MQ=255) gCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGc > 7:303849/1‑119 (MQ=255) ccACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACa > 3:246727/1‑149 (MQ=255) aCGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATg > 2:70278/1‑149 (MQ=255) aCGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATg < 6:261212/149‑1 (MQ=255) ggTGATCAGTCGGCCGATGGCGGGCATCGAGGAAGTGTGCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGa < 8:290751/149‑1 (MQ=255) aTCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATg > 2:322159/1‑141 (MQ=255) aTCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATg < 1:322159/141‑1 (MQ=255) aGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑GC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAATCTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCgg < 5:320174/149‑1 (MQ=255) aGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCg < 5:10622/148‑1 (MQ=255) gTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGt < 3:323377/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGt > 5:25959/1‑148 (MQ=255) cGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATAACATGGTGATTTGCGGTGa < 4:289066/149‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGa < 6:235773/148‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAg > 7:239959/1‑149 (MQ=255) ggCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAg > 7:233593/1‑149 (MQ=255) cGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGAGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTc > 2:246063/1‑149 (MQ=255) ggcCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGc < 8:320448/149‑1 (MQ=255) ggcCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGc < 5:341931/149‑1 (MQ=255) gtcgaTGTGTTGCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑AG‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCGTGTTGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGGCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCTACCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATcca < 2:216175/147‑1 (MQ=255) gacgaAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATcc < 3:25391/148‑1 (MQ=255) acgaAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccac < 8:233593/149‑1 (MQ=255) acgaAGTGTTCCGGTCAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GGC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGGGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccac < 8:239959/149‑1 (MQ=255) aaGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATccaccac < 2:358686/149‑1 (MQ=255) ttCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctgggtgaaggtaccttcagggccgaggtaggcgattttcagcg < 8:148171‑M2/149‑122 (MQ=255) ttCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACct > 4:111519/1‑149 (MQ=255) ttCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACct > 5:194548/1‑149 (MQ=255) ccGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctgggtgaag > 7:219527‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctgggtgaag < 8:219527‑M2/113‑88 (MQ=255) ccGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctggg > 6:434453‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctggg < 5:434453‑M2/108‑83 (MQ=255) cGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACctgct > 2:83437/1‑149 (MQ=255) cGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACctgc > 2:214258/1‑148 (MQ=255) cGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACctgc < 1:214258/148‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑Aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctgggtgaaggtaccttcagggccgaggtaggcgattttcagcggctc < 4:345826‑M2/149‑126 (MQ=255) gAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCtggt < 4:115622/149‑1 (MQ=255) gcggcCGGTT‑CA‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGc < 7:410366/147‑1 (MQ=255) cGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAaca < 3:80988/149‑1 (MQ=255) tG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCa < 2:247262/149‑1 (MQ=255) cc‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAg > 7:24057/1‑149 (MQ=255) gTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAacac < 6:102608/143‑1 (MQ=255) gTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAacac > 5:102608/1‑143 (MQ=255) gTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGAc > 7:50728/1‑149 (MQ=255) gTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGAc < 1:83437/149‑1 (MQ=255) tC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCTCTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCga < 6:202388/136‑1 (MQ=255) tC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACACTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCga > 5:202388/1‑136 (MQ=255) aacttcacggaacacttcgtcgatggccgccatcggccgactgatcaccgcgtggccgaagtgcttcatggccgccgcctgggtgaaggtaccttcagggccgaggtaggcgattttcagcggctcttccagggccaggcacgacgaca > 3:345826‑M2/1‑1 (MQ=255) aa‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGa < 6:25959/149‑1 (MQ=255) | CTGGAAGAGCCGCTGAAAATCGCCTACCTCGGCCCTGAAGGTACCTTCACCCAGGCGGCGGCCATGAAGCACTTCGGCCACGCGGTGATCAGTCGGCCGATGGCGGCCATCGACGAAGTGTTCCGTGAAGTGGCGGCCGGTG‑CC‑‑‑‑‑‑GTC‑AA‑‑‑CTTCGGTGTGGTGCCGGTGGAAAACTCCACTGAAGGTGCGGTCAGCCACACCCTGGACAGCTTCCTCGAGCATGACATGGTGATTTGCGGTGAGGTCGAGCTGCGTATCCACCACCACCTGCTGGTGGGCGAGAACACCAAGACCGA > NC_002947/1975345‑1975640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |