New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2130654 = | 60 (0.840) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 6.7% | coding (1545/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
? | NC_002947 | 2130733 = | 54 (0.780) | coding (1466/2496 nt) | fimD | type I pili subunit FimD |
ATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTAACTGGAACCCTGCACCTC > NC_002947/2130585‑2130878 | aTGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGa < 4:142161/149‑1 (MQ=255) tGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGGGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGaa < 4:202201/149‑1 (MQ=255) gctattcgacccaaggctaccgtgacttcgatgaagtggtgcgccagcgcagccaggacactacgttCAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGaa > 3:81041‑M1/68‑148 (MQ=255) cTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAAc < 1:106514/148‑1 (MQ=255) gggTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACg > 5:133329/1‑147 (MQ=255) ttcgacccaaggctaccgtgacttcgatgaagtggtgcgccagcgcagccaggacactacgttCAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGt > 3:310612‑M1/64‑147 (MQ=255) ggTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTa < 1:252149/148‑1 (MQ=255) ggTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTa < 1:258784/148‑1 (MQ=255) ggTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAg > 5:14263/1‑149 (MQ=255) gTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAgt < 8:216301/149‑1 (MQ=255) tATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAgtg > 1:296264/1‑149 (MQ=255) aaGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCt < 3:376346/148‑1 (MQ=255) gAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTg < 1:397520/148‑1 (MQ=255) aaCTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTgcg > 5:173820/1‑149 (MQ=255) tGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTg > 5:394300/1‑149 (MQ=255) gTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGgc > 3:292272/1‑149 (MQ=255) gTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGgc > 1:148518/1‑149 (MQ=255) gTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGgc < 7:218017/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGTCTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACt > 4:238408/1‑149 (MQ=255) ggTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCa < 5:423231/148‑1 (MQ=255) ggTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCa < 6:133329/148‑1 (MQ=255) gCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGaa < 3:273381/149‑1 (MQ=255) ctgcGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACg < 6:171747/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTc > 1:99966/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTc > 3:204262/1‑148 (MQ=255) gTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGaa > 6:245174/1‑149 (MQ=255) gTTCCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGaa < 1:11040/149‑1 (MQ=255) acgttcagcggcagtcgccgcagccgcctggaggcctcggtccaccagagcctgggcaggaccagctcgctgaccctgacgctgAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGaa > 3:310612‑M2/85‑147 (MQ=255) gCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATa < 2:296264/148‑1 (MQ=255) gCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAg > 6:235104/1‑149 (MQ=255) cGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGc < 4:57961/149‑1 (MQ=255) ttcagcggcagtcgccgcagccgcctggaggcctcggtccaccagagcctgggcaggaccagctcgctgaccctgacgctgAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGc > 3:81041‑M2/82‑148 (MQ=255) gACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTGACGGTAGCCTTGGGTCGactcgc > 6:263434/1‑143 (MQ=255) aCAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGcacca < 3:85149/111‑1 (MQ=255) aCAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGcacca > 4:85149/1‑111 (MQ=255) ggTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCa > 2:146613/1‑148 (MQ=255) tCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAg > 4:89896/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCa < 2:430739/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAgc > 6:279124/1‑145 (MQ=255) gAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAgc < 5:279124/145‑1 (MQ=255) ggTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAggttgg < 4:292272/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAggttgg < 5:245174/148‑1 (MQ=255) ctggaggcctcggtccaccagagcctgggcaggaccagctcgctgaccctgacgctgAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAggttggt < 4:81041‑M2/92‑1 (MQ=255) cTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGttt > 1:165529/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAg > 7:263960/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGAGCACCACGTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGGTTGAg > 8:385533/1‑149 (MQ=255) cccAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTTCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGa < 7:85281/147‑1 (MQ=255) ccAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTTGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAgtg > 7:282181/1‑149 (MQ=255) aGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAgtggt < 6:173820/149‑1 (MQ=255) gtggACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGTCTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGcc < 3:238408/148‑1 (MQ=255) gtggACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAgg < 2:148518/146‑1 (MQ=255) gACCGAGGCCTCGAGGTGGCTGCGGCGAGTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGTCGCAGCACTTCATCCAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTg < 5:6511/148‑1 (MQ=255) cGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGGTTGAGTGGTGAAGTCCTTGGCa > 5:189864/1‑148 (MQ=255) ggCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTg < 6:223759/142‑1 (MQ=255) ggCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTg > 5:223759/1‑142 (MQ=255) ccTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTc < 6:14263/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGATGAGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCGTGGGTAGCTTAGCGAGATGCGGCAAAGCGCAGGGTGGTGTTAGGGGGGAAGGCATTGCCAGAGTTcct > 8:284366/1‑147 (MQ=255) cAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAgg < 3:89896/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAgg < 6:394300/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAgg < 8:282181/148‑1 (MQ=255) ggcTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTaa < 2:99966/149‑1 (MQ=255) gcTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTAAc > 8:372585/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTAACt > 5:88641/1‑149 (MQ=255) accctgacgctgAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTAACTGGaa < 4:310612‑M2/135‑1 (MQ=255) ctgAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTAACTGGAACCCTGCACCTc > 1:338603‑M2/4‑149 (MQ=255) | ATGCTGGGTATTGAAGTTGAACTGGTATTGCCGTTGGGTGGCATTGCTGCGCCAGTAGTCCTGTTGCGACAGCGTCAGGGTCAGCGAGCTGGTCCTGCCCAGGCTCTGGTGGACCGAGGCCTCCAGGCGGCTGCGGCGACTGCCGCTGAACGTAGTGTCCTGGCTGCGCTGGCGCACCACTTCATCGAAGTCACGGTAGCCTTGGGTCGAATAGCGATATCCGGCAAAGCGCAGGTTGGTTTGAGTGGTGAAGGCCTTGGCATACTTCAGGGCGTAACTGGAACCCTGCACCTC > NC_002947/2130585‑2130878 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |