New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3233134 = | 55 (0.770) | 5 (0.070) | 5/254 | NT | 9.7% | coding (322/948 nt) | GbpR | galactose‑binding protein regulator |
? | NC_002947 | 3233196 = | 41 (0.600) | coding (384/948 nt) | GbpR | galactose‑binding protein regulator |
ATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGACAGCCAGGAAC > NC_002947/3233048‑3233338 | gtagcaaggccggcagcaaggtgtcgctggtgcccacctccagcgagatacgcaccttgggctggtcgcgcttgtaggccagcaccGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCg > 7:105376‑M1/87‑149 (MQ=255) tGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCg < 8:25791/148‑1 (MQ=255) gCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTg < 4:410637/149‑1 (MQ=255) gCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCACAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTg < 7:177009/149‑1 (MQ=255) gTGATGATTCGCTATGCGCGAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGc > 2:65854/1‑149 (MQ=255) gTGATGATTCGCTATGCGCGAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGc < 1:65854/149‑1 (MQ=255) atTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACaa < 6:389293/149‑1 (MQ=255) tCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAgc > 8:278412/1‑149 (MQ=255) tGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGAc < 7:317260/148‑1 (MQ=255) gcgcAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGcgcg < 7:203016/145‑1 (MQ=255) gcgcAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGcgcg > 8:203016/1‑145 (MQ=255) aaaaCGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGccc < 2:319262/149‑1 (MQ=255) aaaaCGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGcc > 1:283339/1‑148 (MQ=255) aaaCGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGccc > 4:150156/1‑148 (MQ=255) gCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGTGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGt < 2:379324/149‑1 (MQ=255) gCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGt > 3:72162/1‑149 (MQ=255) ttGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCg < 2:283339/149‑1 (MQ=255) acctccagcgagatacgcaccttgggctggtcgcgcttgtaggccagcaccGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTAc < 6:397048‑M1/75‑1 (MQ=255) acctccagcgagatacgcaccttgggctggtcgcgcttgtaggccagcaccGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTAc > 5:397048‑M1/52‑126 (MQ=255) cATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTAt < 6:21985/149‑1 (MQ=255) gTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGGGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGc < 5:139787/149‑1 (MQ=255) gATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTgg < 1:323058/148‑1 (MQ=255) tCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAgg > 5:2084/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTg < 4:131439/145‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTg > 3:131439/1‑145 (MQ=255) gcgcAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAg > 5:409721/1‑149 (MQ=255) gcgcAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAg > 3:149316/1‑149 (MQ=255) cgcAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGc < 6:418468/149‑1 (MQ=255) cgcAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGGACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGc < 7:389632/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGacac < 2:64612/149‑1 (MQ=255) gtaggccagcaccgccttggtcagcacgcctggtaccgggcccatgacgctgcccacccgcaccaggcccaaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGt > 5:397048‑M2/76‑126 (MQ=255) gtaggccagcaccgccttggtcagcacgcctggtaccgggcccatgacgctgcccacccgcaccaggcccaaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGt < 6:397048‑M2/51‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGcc < 7:278412/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGc > 5:185510/1‑149 (MQ=255) cgcgGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCtt < 3:150156/149‑1 (MQ=255) cgccttggtcagcacgcctggtaccgggcccatgacgctgcccacccgcaccaggcccaaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTAc > 7:105376‑M2/64‑149 (MQ=255) CCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTAcgc > 7:53242‑M1/1‑149 (MQ=255) agcacgcctggtaccgggcccatgacgctgcccacccgcaccaggcgtgctgaccaaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTAcgcg > 1:55804‑M2/61‑149 (MQ=255) ggTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACGTTGCTGCCGGCCTTGCTCCGCGGTGAGTTc > 8:185256/1‑148 (MQ=255) gTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGTGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTc < 5:385812/147‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGa < 6:2084/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGat < 8:42140/149‑1 (MQ=255) gggTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGat > 2:106942/1‑146 (MQ=255) gggTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGat < 1:106942/146‑1 (MQ=255) tGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATAtggtg > 5:80477/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATAtggtggt < 3:171743/149‑1 (MQ=255) cGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGTCTGCCGGAc < 4:323579/149‑1 (MQ=255) cacccgcaccaggcccaaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCaga < 8:105376‑M2/128‑1 (MQ=255) ccAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCagag < 6:80477/149‑1 (MQ=255) aGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGt > 6:430166/1‑148 (MQ=255) aGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTg > 6:424256/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGa < 5:430166/149‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGa < 5:424256/149‑1 (MQ=255) aCCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGACAGCCAgg < 4:118636/148‑1 (MQ=255) caaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGACAGCCAGGAAc < 7:185256‑M2/143‑1 (MQ=255) caaggcGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGACAGCCAGGAAc > 8:333872‑M2/7‑149 (MQ=255) | ATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAGGCGCAAATCGCCGAACTGGCGCGCGGAGCCTTGGGCCTGGTGCGGGTGGGCAGCGTCATGGGCCCGGTACCAGGCGTGCTGACCAAGGCGGTGCTGGCCTACAAGCGCGACCAGCCCAAGGTGCGTATCTCGCTGGAGGTGGGCACCAGCGACACCTTGCTGCCGGCCTTGCTACGCGGTGATTTCGATATGGTGGTGGGGCGCCTGCCGGACCAGAGTGACAGCCAGGAAC > NC_002947/3233048‑3233338 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |