| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3799827 = | 70 (0.980) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 6.4% | coding (162/1125 nt) | PP_3360 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | 3799911 = | 51 (0.760) | coding (246/1125 nt) | PP_3360 | membrane protein | |||||
TCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTG > NC_002947/3799763‑3800058 | cgcgaccacgaaccacaggctgctgaccctggtcagccagcgctcgggcaggtcgagcatgctcAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTg > 4:99152‑M1/65‑149 (MQ=255) cgtGGTCGGCCGGGCCGCCATCAGTTGCCTGTTGCGCCGGGTACTGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACAGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGa < 8:150464/147‑1 (MQ=255) cTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAg > 1:159764/1‑149 (MQ=255) gaccacgaaccacaggctgctgaccctggtcagccagcgctcgggcaggtcgagcatgctcAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGc > 7:289988‑M1/62‑149 (MQ=255) gTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGc < 2:327495/147‑1 (MQ=255) gTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCa < 3:341924/148‑1 (MQ=255) tCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATg < 3:237979/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTAAGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTCTTGCTGGCCTCCTTGATGGTGAGCCTGAGCATGc > 3:31257/1‑148 (MQ=255) gccGTGCCGCCTTGACTTTCGTTCTGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATACTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCT‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGGCTCCTTGCTGGTGCGCCTGAGCATGCTc < 2:337200/148‑1 (MQ=255) gggccgccATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑c < 2:177037/147‑1 (MQ=255) gTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑c < 5:81692/149‑1 (MQ=255) cggccATGTGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCGCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGAGCCTGAGCATGCTCGA‑CCt < 4:31257/146‑1 (MQ=255) aTCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGccc > 1:67155/1‑147 (MQ=255) cAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAgc < 4:261549/149‑1 (MQ=255) tttCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCgct > 4:171776/1‑149 (MQ=255) tCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCGGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCgctgg > 1:248730/1‑149 (MQ=255) tCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCgctg < 5:156917/148‑1 (MQ=255) cTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCgctggc < 5:377561/148‑1 (MQ=255) tGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCgctggct > 4:226927/1‑148 (MQ=255) aTGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGAc < 4:136648/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGAc > 7:224434/1‑149 (MQ=255) gcCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAgg < 2:67155/149‑1 (MQ=255) cGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGt > 7:60602/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGcc < 7:197025/149‑1 (MQ=255) cTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACGTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGCCCCTGGTcagccagc > 5:369049/1‑142 (MQ=255) tGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCtgtg < 2:231656/149‑1 (MQ=255) gTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCtgtg < 1:200771/147‑1 (MQ=255) gTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGt > 2:119253/1‑149 (MQ=255) cGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCg < 8:60602/149‑1 (MQ=255) cGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCg > 3:20933/1‑149 (MQ=255) gAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGt > 3:354481/1‑149 (MQ=255) aaCACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg > 3:251233/1‑149 (MQ=255) aaCACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg > 1:287692/1‑149 (MQ=255) acacGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTgg > 8:154771/1‑149 (MQ=255) gctcaggcccaccagcaaggaggccagcaacaacagaaagttgctggtgccggaaagcaccttggccattatctggctcagtgggcctGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTc > 7:289988‑M2/89‑149 (MQ=255) gAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTcgc > 3:348969/1‑149 (MQ=255) caggcccaccagcaaggaggccagcaacaacagaaagttgctggtgccggaaagcaccttggccattatctggctcagtgggcctGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTcgcg > 4:99152‑M2/86‑149 (MQ=255) cccaccagcaaggaggccagcaacaacagaaagttgctggtgccggaaagcaccttggccattatctggctcagtgggcctGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCt < 8:289988‑M2/68‑1 (MQ=255) CCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCtt > 1:225767‑M1/1‑149 (MQ=255) CCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCtt < 1:263050‑M1/149‑1 (MQ=255) ACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc > 2:287692‑M1/1‑149 (MQ=255) ACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc > 4:251233‑M1/1‑149 (MQ=255) ACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc > 2:159764‑M1/1‑149 (MQ=255) accagcaaggaggccagcaacaacagaaagttgctggtgccggaaagcaccttggccattatctggctcagtgggcctGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGc < 3:99152‑M2/71‑1 (MQ=255) aGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca < 8:100845/119‑3 (MQ=255) aGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCCTGGTcagcca > 7:100845/1‑117 (MQ=255) gCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg > 2:66150/1‑131 (MQ=255) gCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTg < 1:66150/131‑1 (MQ=255) ccAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCAGCCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGC‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCCGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGAtt > 1:253429/1‑149 (MQ=255) ccAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGCGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTg < 1:119253/149‑1 (MQ=255) ccAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTg > 7:249972/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCtgtg < 8:224434/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAAc > 2:426083/1‑149 (MQ=255) tttCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCgcgc > 5:401265/1‑148 (MQ=255) tttCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTAGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGACAACCgcgc > 4:154645/1‑148 (MQ=255) ccAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctg < 4:354481/149‑1 (MQ=255) aGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctggg > 4:7220/1‑149 (MQ=255) gCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggc < 7:154771/149‑1 (MQ=255) aaCTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGCTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCggcctgggcct > 3:312962/1‑149 (MQ=255) tCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAg < 4:348969/147‑1 (MQ=255) gaaagttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGt < 6:201708/145‑1 (MQ=255) gttgttGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGAGCCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGt > 1:83756/1‑149 (MQ=255) ttgttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCg < 3:130751/146‑1 (MQ=255) ttgttgCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTa > 2:258143/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTcg > 2:160234/1‑149 (MQ=255) ctTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCAc < 3:171776/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCg < 2:263050/147‑1 (MQ=255) gAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGc < 2:205676/79‑1 (MQ=255) gAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGc > 1:205676/1‑79 (MQ=255) gAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTg > 3:212824/1‑148 (MQ=255) | TCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCA‑CCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGA‑CCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCGGCCTGGGCCTGAGCCGTTACTTCGCCCGCCACCGTACCGACGGCCTG > NC_002947/3799763‑3800058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |