New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3864770 = | 59 (0.820) | 5 (0.070) | 5/256 | NT | 8.0% | coding (875/1320 nt) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
? | NC_002947 | 3864808 = | 59 (0.860) | coding (837/1320 nt) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
CCCGAATGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTC > NC_002947/3864660‑3864945 | gcaagggccgcctgtgcaaagtggtcaagtttgccagcgacatcacccatcaggtctgcacccagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCa > 8:26852‑M1/111‑149 (MQ=255) ccGAATGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCAt > 3:189527/1‑149 (MQ=255) cGAATGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATc > 4:390162/1‑149 (MQ=255) gAATGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCg < 4:192842/149‑1 (MQ=255) agggccgcctgtgcaaagtggtcaagtttgccagcgacatcacccatcaggtctgcacccagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCg > 1:425002‑M1/108‑149 (MQ=255) aTGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGt < 5:293197/149‑1 (MQ=255) tGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTc < 7:246363/149‑1 (MQ=255) gTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCt < 6:276337/148‑1 (MQ=255) tCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTg > 5:112817/1‑148 (MQ=255) tCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTg > 5:91354/1‑148 (MQ=255) tCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTg > 6:215919/1‑148 (MQ=255) gCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCAcc < 3:224075/149‑1 (MQ=255) cacaATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCA‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCAcc > 7:90208/1‑148 (MQ=255) caATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAg < 4:189527/149‑1 (MQ=255) tggtcaagtttgccagcgacatcacccatcaggtctgcacccagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcgattacctgcaccGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggca > 1:190414‑M1/90‑149 (MQ=255) gCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggca > 1:431632/1‑149 (MQ=255) tCCGACTGCCTGTTTACTGAGTCGATACTGCGCGAAGCGTCGTTAAGCTACTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatg < 8:195898/149‑1 (MQ=255) ccGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatgg > 7:208790/1‑149 (MQ=255) aCTGCCTGTTTACCGCGTAGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGgcatgggcggcatgggcg < 2:431632/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatgggc > 8:114875/1‑145 (MQ=255) gCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatgggc < 7:114875/145‑1 (MQ=255) ccTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGgcggcg > 4:379634/1‑148 (MQ=255) tttACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTg > 5:346060/1‑149 (MQ=255) aCCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCt < 5:215919/148‑1 (MQ=255) ccGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCGCCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTg < 5:19956/148‑1 (MQ=255) cgcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatg < 6:22650/132‑1 (MQ=255) cgcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatg > 5:22650/1‑132 (MQ=255) tCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCa < 6:346060/149‑1 (MQ=255) gATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCCTTGCTGGGTGCAg < 3:379634/148‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGAt > 7:214016/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg < 6:367889/149‑1 (MQ=255) aGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGa > 1:170833/1‑149 (MQ=255) gtTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGc < 8:208790/149‑1 (MQ=255) tAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAg > 2:191685/1‑128 (MQ=255) tAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAg < 1:191685/128‑1 (MQ=255) aaGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCG‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTg < 6:91354/148‑1 (MQ=255) gCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGc > 1:105496/1‑148 (MQ=255) ccTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAAc > 8:146189/1‑149 (MQ=255) cTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg < 3:89658/130‑1 (MQ=255) cTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACt > 7:309906/1‑149 (MQ=255) ggAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGa > 7:210925/1‑149 (MQ=255) tgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcGGTGCAGGTAATCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCa > 1:190414‑M2/61‑149 (MQ=255) cTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCAGCGAGCTGGCATGGGGGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACGTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACt < 8:90208/145‑1 (MQ=255) cTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACttt < 6:112817/147‑1 (MQ=255) aTTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAg > 8:374989/1‑149 (MQ=255) ccTGTACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACTggcgg > 4:24169/1‑149 (MQ=255) ccTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCCTCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTgg > 1:46551/1‑67 (MQ=255) ccTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTgg < 2:46551/66‑1 (MQ=255) cTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg > 3:413654/1‑109 (MQ=255) cTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg < 4:413654/109‑1 (MQ=255) cTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc > 6:27993/1‑149 (MQ=255) cgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCt > 1:425002‑M2/43‑149 (MQ=255) ccGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTg > 2:180640/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTg > 3:349336/1‑149 (MQ=255) tgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGc > 8:26852‑M2/40‑149 (MQ=255) CCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCaaa < 6:59876‑M1/118‑1 (MQ=255) CCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCaaa > 5:59876‑M1/1‑118 (MQ=255) CCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTg < 5:119434‑M1/149‑1 (MQ=255) cctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCACGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGTCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTg > 8:94944‑M2/38‑149 (MQ=255) caccacTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTg > 2:209501/1‑106 (MQ=255) caccacTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTg < 1:209501/106‑1 (MQ=255) caccacTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGaa < 5:119625/147‑1 (MQ=255) cacTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCg > 5:130207/1‑142 (MQ=255) acTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCgg < 7:146189/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCggg < 4:96448/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCggg < 8:214016/149‑1 (MQ=255) ggggaccgaagtggtgcagcaggcATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGt < 2:425002‑M2/125‑1 (MQ=255) cGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGtt < 3:390162/148‑1 (MQ=255) tCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTgg > 8:133240/1‑68 (MQ=255) tCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTgg < 7:133240/68‑1 (MQ=255) cc‑cTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTagga < 8:309906/149‑1 (MQ=255) c‑cTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTaggag > 1:67800/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTaggagg > 4:111991/1‑149 (MQ=255) gcgcgcAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGCCCGCATGGGCGGCCCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGAGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGAGGCCATTGCTGTAGAAGATCGGGTTGTAGGAGGACTc > 4:272597/1‑148 (MQ=255) | CCCGAATGGTCAGCACAATCTGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCTGCACCACTTCGGTCCC‑CTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTC > NC_002947/3864660‑3864945 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |