New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3870425 | 61 (0.850) | 4 (0.060) | 3/256 | NT | 6.2% | coding (494/1428 nt) | PP_3419 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator/response regulator |
? | NC_002947 | = 3870443 | 63 (0.920) | coding (476/1428 nt) | PP_3419 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator/response regulator |
ACTCGATGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAGTTTGA > NC_002947/3870303‑3870590 | aCTCGATGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAATTGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCGTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAgg < 4:294879/149‑1 (MQ=255) aCTCGATGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAgg < 3:65960/149‑1 (MQ=255) cTCGATGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTTGCGCAggg < 2:106705/149‑1 (MQ=255) aTGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGtgtg > 8:99268/1‑149 (MQ=255) tGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGc < 1:70191/149‑1 (MQ=255) aGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCtt > 7:61660/1‑147 (MQ=255) ggCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAg < 2:110923/149‑1 (MQ=255) gCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTTGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAgg < 2:365181/149‑1 (MQ=255) gCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGACACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAgg > 4:268905/1‑149 (MQ=255) tACTGCGCGATCCATCGAAATTCAGGGCACGGGGCAGCTGTTCCTTGCCAGTACCTGTCTCGCCTTCGATCATCACAGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGAGACGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGTTGTGCTTGAGGGGGAg < 6:143778/148‑1 (MQ=255) tACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGa < 8:61660/147‑1 (MQ=255) aCTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGc < 1:115462/148‑1 (MQ=255) cgcgAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCAc > 7:215418/1‑149 (MQ=255) cgcgAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTAACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCAc > 8:335460/1‑149 (MQ=255) cATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGa < 5:231091/129‑1 (MQ=255) cATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGa > 6:231091/1‑129 (MQ=255) gAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGGCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGc < 8:342893/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGAt > 5:8374/1‑149 (MQ=255) aGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCa > 3:226643/1‑148 (MQ=255) gggCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGt > 3:323797/1‑121 (MQ=255) gggCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGt < 4:323797/121‑1 (MQ=255) gggCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCa > 1:42532/1‑147 (MQ=255) ggCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGc < 3:352375/140‑1 (MQ=255) ggCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGc > 4:352375/1‑140 (MQ=255) aCGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCt < 2:343105/149‑1 (MQ=255) caccaGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAAcc > 3:349063/1‑149 (MQ=255) caccaGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAAcc > 4:32387/1‑149 (MQ=255) caGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCg > 8:377592/1‑148 (MQ=255) caGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCg > 3:106401/1‑148 (MQ=255) gTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGAc < 5:403340/149‑1 (MQ=255) gCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTgc < 7:59597/148‑1 (MQ=255) gTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGCCTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTc > 4:371424/1‑149 (MQ=255) tctcGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTcc < 3:268905/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCt < 7:169399/146‑1 (MQ=255) gCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTgg < 7:377592/148‑1 (MQ=255) gCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTg < 7:99268/147‑1 (MQ=255) cTTCGGTCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTgg > 7:393923/1‑146 (MQ=255) cTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAg < 6:319063/149‑1 (MQ=255) ttCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTc < 3:93226/135‑1 (MQ=255) ttCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTc > 4:93226/1‑135 (MQ=255) ttCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAg > 8:69302/1‑148 (MQ=255) gATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAAc > 7:53137/1‑148 (MQ=255) gATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAAc > 2:205271/1‑148 (MQ=255) gATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAAc > 2:211774/1‑148 (MQ=255) tCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAGCGa > 6:429308/1‑148 (MQ=255) cACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCg > 3:361197/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTgc > 7:147419/1‑149 (MQ=255) ggTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATg > 5:120456/1‑149 (MQ=255) ggTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATg < 7:335460/149‑1 (MQ=255) ggTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATg < 7:69302/149‑1 (MQ=255) gtcgtcACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATgc > 3:266175/1‑149 (MQ=255) gtcgtcACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATgc < 8:147419/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCg < 3:32387/148‑1 (MQ=255) tGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTggcgcatggccagtgacgacctgccaccggtgctgatcgaaggcgagaccggtactggcaaggaactggtggcccgtgccctgcatttcgatggttcgcgcagtaaagggcctttcatc < 4:105326‑M2/149‑120 (MQ=255) ccATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTggcgcatggccagtgacgacctgccaccggtgctgatcgaaggcgagaccggtactggcaaggaactggtggcccgtgccctgcatttcgatggttcgcgcagtaaagggcctttcatcgag < 2:176437‑M2/149‑123 (MQ=255) ccATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTggcgcatggccagtgacgacctgccaccggtgctgatcgaaggcgagaccggtactggcaaggaactggtggcccgtgccctgcatttcgat > 1:206963‑M2/1‑27 (MQ=255) ccATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTggcgcatggccagtgacgacctgccaccggtgctgatcgaaggcgagaccggtactggcaaggaactggtggcccgtgccctgcatttcgat < 2:206963‑M2/119‑93 (MQ=255) cATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGc > 2:97787/1‑147 (MQ=255) gcgcCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAggg > 7:88436/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAggg > 7:186394/1‑149 (MQ=255) cgccgcTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAggg < 6:8374/148‑1 (MQ=255) cgccgcTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTGGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGc < 3:371424/149‑1 (MQ=255) gccgcTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGcc < 1:205271/149‑1 (MQ=255) gccgcTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGcc < 4:1684/149‑1 (MQ=255) gccgcTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGcc < 1:211774/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTg > 4:197561/1‑149 (MQ=255) gCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCGACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCGTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAg < 8:215418/149‑1 (MQ=255) gCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAg > 8:363978/1‑149 (MQ=255) cATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAgg < 2:42532/149‑1 (MQ=255) gCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAGt < 4:349063/149‑1 (MQ=255) cACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCa > 6:59364/1‑113 (MQ=255) cACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCa < 5:59364/113‑1 (MQ=255) cACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAg < 4:15083/147‑1 (MQ=255) cACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAg > 3:15083/1‑147 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAGttt < 8:27347/147‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAGttt > 2:201777/1‑147 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAGTTTGa > 7:27347/1‑149 (MQ=255) | ACTCGATGAAAGGCCCTTTACTGCGCGAACCATCGAAATGCAGGGCACGGGCCACCAGTTCCTTGCCAGTACCGGTCTCGCCTTCGATCAGCACCGGTGGCAGGTCGTCACTGGCCATGCGCCGCTCGGCATCGAGCACCTGGCGCAGGGTGTGCTTGAGGGTGAGCATCACCGGCGACTCGCCGATCAAAGCCTGCAACCCGGACTTCTGCGCCTCGCGCTCCTGGTAGAACGACAGCGTGCGCTCCATGCGCTCGGTAGCCAGGGCCTTGTCCAGGGTCAGTTTGA > NC_002947/3870303‑3870590 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |