New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4093560 = | 53 (0.740) | 4 (0.060) | 4/262 | NT | 6.3% | coding (557/1581 nt) | PP_3602 | 2,5‑dioxovalerate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 4093624 = | 67 (0.960) | coding (621/1581 nt) | PP_3602 | 2,5‑dioxovalerate dehydrogenase |
CAGCAACTTCCCGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATGGCCGCTGAGCGCCC > NC_002947/4093477‑4093770 | cAGCAACTTCCCGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGCGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGa > 8:71538/1‑149 (MQ=255) aGCAACTTCCCGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAATGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGAc < 6:101405/149‑1 (MQ=255) gCAACTTCCCGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGAcc > 6:233174/1‑149 (MQ=255) ttCCCGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCAt > 3:272077/1‑149 (MQ=255) cccGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGc > 3:168339/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGc < 7:119236/148‑1 (MQ=255) ccGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGc < 2:272131/148‑1 (MQ=255) gCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAggg > 8:8073/1‑149 (MQ=255) gCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAgg < 5:334561/148‑1 (MQ=255) gCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAg < 5:30112/147‑1 (MQ=255) gCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAg > 6:30112/1‑147 (MQ=255) cACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTc > 1:19799/1‑148 (MQ=255) cACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTc > 1:406359/1‑148 (MQ=255) aCCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGGTCaa > 3:255166/1‑149 (MQ=255) ccgccgGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAAc < 5:428504/149‑1 (MQ=255) cgccgGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACa > 3:148562/1‑149 (MQ=255) ggTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCgtg < 3:157813/135‑1 (MQ=255) ggTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCgtg > 4:157813/1‑135 (MQ=255) gTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGCGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTAttt < 7:71538/149‑1 (MQ=255) tGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAACGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTtg < 7:359898/149‑1 (MQ=255) aTACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTtggt < 3:365313/149‑1 (MQ=255) tACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTtggtg < 8:200583/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTtggtgg > 7:204583/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTc > 6:38661/1‑131 (MQ=255) ccgccgccgCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTc < 5:38661/131‑1 (MQ=255) cgccgccgcCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTggcg > 8:79619/1‑149 (MQ=255) cgccgccgcCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGAGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGGTCAACATGGTATTTGGTggcg > 6:363607/1‑149 (MQ=255) gccgccgccCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTggcgg > 7:369383/1‑149 (MQ=255) ccgccCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTg < 2:406359/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGc < 8:204583/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGc > 6:258998/1‑147 (MQ=255) cTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGc > 2:313065/1‑147 (MQ=255) gCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTg > 4:310494/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCGGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCACCATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGc > 4:258878/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTc < 7:8073/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCa < 8:369383/149‑1 (MQ=255) tGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCaa < 4:168339/149‑1 (MQ=255) cccGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCTCATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCaa < 7:74926/147‑1 (MQ=255) cGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCAc > 7:318252/1‑149 (MQ=255) gtggtATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCAccc > 1:311272/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCAt > 5:143311/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATc > 5:190585/1‑147 (MQ=255) ggCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCTgg < 7:79619/149‑1 (MQ=255) gctcagcggcgcgcacgatggcgcaggcgaccaggtcggccgtggccatgtggccgctgtgcgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCgg > 4:192585‑M2/64‑149 (MQ=255) ctcagcggcgcgcacgatggcgcaggcgaccaggtcggccgtggccatgtggccgctgtgcgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGt > 6:60525‑M2/63‑149 (MQ=255) acaGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGtt > 2:25243/1‑149 (MQ=255) aGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTgg < 2:419242/149‑1 (MQ=255) gCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGtt > 8:20511/1‑143 (MQ=255) gCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGtt < 7:20511/143‑1 (MQ=255) gCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTc < 6:93042/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCAc < 8:318252/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCAc < 4:148562/149‑1 (MQ=255) acaTGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGt > 4:175410/1‑108 (MQ=255) aTGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCg > 4:108165/1‑148 (MQ=255) gCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTc > 1:350110/1‑149 (MQ=255) atggcgcaggcgaccaggtcggccgtggccatgtggccgctgtgcgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCg < 3:192585‑M2/103‑1 (MQ=255) ggCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGa < 3:310494/149‑1 (MQ=255) gcaggcgaccaggtcggccgtggccatgtggccgctgtgcgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGaa < 5:60525‑M2/108‑1 (MQ=255) cGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGCGCGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGa > 1:39893/1‑147 (MQ=255) gTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGt < 7:258728/147‑1 (MQ=255) gTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGt < 2:39893/147‑1 (MQ=255) tagCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCTGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGAt < 6:111327/147‑1 (MQ=255) ccTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGcc < 3:65422/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGcac > 3:71521/1‑147 (MQ=255) gcCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTg > 3:181713/1‑149 (MQ=255) ccATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGGGGCGGCGGGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGc < 3:258878/149‑1 (MQ=255) cATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCg < 6:56689/119‑1 (MQ=255) cATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCg > 5:56689/1‑119 (MQ=255) cATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGcc > 4:368674/1‑149 (MQ=255) gTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTgg > 4:49247/1‑107 (MQ=255) gTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTgg < 3:49247/107‑1 (MQ=255) tGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATg < 4:272077/149‑1 (MQ=255) cggtc‑cgcTCAGCGGCGCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATGGc > 8:231538/5‑149 (MQ=255) c‑cgcTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATGGCCGCt < 6:190585/149‑1 (MQ=255) aGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATGGCCGCTGAgc < 1:313065/147‑1 (MQ=255) cgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGc > 8:177420‑M2/3‑132 (MQ=255) cgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGc < 7:177420‑M2/130‑1 (MQ=255) cgGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATGGCCGCTGAGCGccc < 3:108165‑M2/147‑1 (MQ=255) | CAGCAACTTCCCGCTTGCCTTCTCCACCGCCGGGGGTGATACCGCCGCCGCCCTGGCCGCAGGCTGCCCGGTGGTATTCAAGGCGCACAGCGGCCACATGGCCACGGCCGACCTGGTCGCCTGCGCCATCGTGCGCGC‑CGCTGAGCGGACCGGCATGCCCAAGGGCGTGTTCAACATGGTATTTGGTGGCGGCGTGGGCGAGTGGCTGGTCAAGCACCCGGCCATCCAGGCGGTTGGCTTCACCGGCTCGCTGAAAGGCGGTGATGCCCTTTGCCGCATGGCCGCTGAGCGCCC > NC_002947/4093477‑4093770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |