New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4329440 = | 55 (0.770) | 3 (0.040) | 3/258 | NT | 5.3% | coding (371/570 nt) | PP_3800 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4329476 = | 54 (0.780) | coding (407/570 nt) | PP_3800 | hypothetical protein |
CGTAAAGGCCCTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTACGACGCCGGTGTTACCC > NC_002947/4329330‑4329622 | cGTAAAGGCCCTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGa < 1:63349/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCt < 2:190821/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGc < 6:394884/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGc > 6:307090/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGAGTCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCAc < 6:18363/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCAccc < 5:307090/147‑1 (MQ=255) agaagGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGca < 1:222771/149‑1 (MQ=255) gaagGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGca > 5:222243/1‑148 (MQ=255) aagGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGcaca < 8:326329/149‑1 (MQ=255) gCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGc > 6:100330/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGcc > 5:391802/1‑148 (MQ=255) tGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCCCCCGACAGCACAGGcc > 6:329793/1‑147 (MQ=255) ccgccgTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGc > 8:210860/1‑149 (MQ=255) cgaggtcgtccgggatcacggcggcgctgtcgcggcgcagccagacatcggcttggcctgtgctgtcgggtggcaggatcaGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCctgctgct > 7:42479‑M1/82‑118 (MQ=255) cgaggtcgtccgggatcacggcggcgctgtcgcggcgcagccagacatcggcttggcctgtgctgtcgggtggcaggatcaGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCctgctgct < 8:42479‑M1/37‑1 (MQ=255) cgTTCGTGGTTGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGAt < 3:6743/149‑1 (MQ=255) gTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCt < 8:3601/148‑1 (MQ=255) tGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTgg < 7:32643/149‑1 (MQ=255) cGATGCCGGCAGCCAGAGTCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTgc > 3:280792/1‑149 (MQ=255) gATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTgcg > 8:85397/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGcgccgc < 6:391802/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACCGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGa > 7:174550/1‑149 (MQ=255) gCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGAc < 1:19405/149‑1 (MQ=255) cAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACa < 6:336767/149‑1 (MQ=255) cAGAGCCGTGCCGGCCCCCACTGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAgcgc < 4:257766/149‑1 (MQ=255) cggggcggcCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAACTTCCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGt < 3:181338/146‑1 (MQ=255) tGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGa > 5:47779/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGa < 5:197463/149‑1 (MQ=255) gcggcCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATc > 3:59696/1‑149 (MQ=255) accaATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGgac > 7:99749/1‑149 (MQ=255) caATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATc < 8:395471/141‑1 (MQ=255) caATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATc > 7:395471/1‑141 (MQ=255) gTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCg < 1:327589/149‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGCCTCCCTCAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTc < 1:364400/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGc < 2:110093/148‑1 (MQ=255) ggCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAg > 8:230855/1‑149 (MQ=255) gCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGTCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAg < 5:128583/148‑1 (MQ=255) gCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAgg < 6:47779/149‑1 (MQ=255) tGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCCCCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGgcc > 5:226894/1‑149 (MQ=255) tGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGgcc > 2:358371/1‑149 (MQ=255) aaTCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGgccgcc < 6:157197/149‑1 (MQ=255) ccTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGAt < 3:163905/145‑1 (MQ=255) ccTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGAt > 4:163905/1‑145 (MQ=255) ccTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCgct < 6:222243/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCgctggctg < 4:59696/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCgctggct < 5:100330/148‑1 (MQ=255) ccGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGctggctgg > 2:437662/1‑148 (MQ=255) GCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGgcag < 4:270649‑M1/149‑1 (MQ=255) agcagcaggctgccggcaacttccggggcctggctgcTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCg < 8:42479‑M2/81‑1 (MQ=255) agcagcaggctgccggcaacttccggggcctggctgcTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCg > 7:42479‑M2/38‑118 (MQ=255) AGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGgcagca > 8:99749‑M1/1‑149 (MQ=255) cagcaggctgccggcaacttccggggcctggctgcTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGgcag > 3:285762‑M2/36‑148 (MQ=255) cAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAggt < 7:85397/149‑1 (MQ=255) aGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATTCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAggtg > 7:114984/1‑149 (MQ=255) ggC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAggtgg < 7:232348/149‑1 (MQ=255) cccGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAggtggt > 5:106475/1‑147 (MQ=255) ccGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAg > 2:410787/1‑149 (MQ=255) cGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGc > 4:210385/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTac < 7:230855/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTac > 2:139389/1‑148 (MQ=255) gCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTacga > 2:433030/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGTAGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTACGACGCCg < 1:358371/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTACGACGCCGgtg > 1:233591/1‑149 (MQ=255) tgctgctgATCCTGCAACCCGACAGCACAGTCCAAGACGATGTCTGGCTGCGCCGAGACAGCGCCGAAGTGATACCGGACGAACTCGGACAGGAATCCCTGATCGCCTCTGGATGGCAGCAGGTAGTCAGCCACTACGACGCCGgtgt > 6:200184/1‑148 (MQ=255) gcTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTACGACGCCGGTGTTAccc > 6:242222‑M2/3‑149 (MQ=255) | CGTAAAGGCCCTGGCCGAAGAAGGCCTGCCGCCGTTCGTGGTCGATGCCGGCAGCCAGAGCCGTGGCGGCCACCAATGGTCATGGCTGGAATCTGGCGCCTACCTGGGCCGCAGCCAGGC‑‑CCCGGAAGTTGCCGGCAGCCTGCTGCTGATCCTGCCACCCGACAGCACAGGCCAAGCCGATGTCTGGCTGCGCCGCGACAGCGCCGCCGTGATCCCGGACGACCTCGGCCAGGCCGCCCTGATCGCCGCTGGCTGGCAGCAGGTGGTCAGCCACTACGACGCCGGTGTTACCC > NC_002947/4329330‑4329622 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |