| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5510220 | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.1% | coding (419/1488 nt) | urtB | urea ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 5510250 | 77 (1.120) | coding (449/1488 nt) | urtB | urea ABC transporter permease | |||||
TACAGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCG > NC_002947/5510103‑5510393 | tACAGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTg < 4:7672‑M2/149‑2 (MQ=255)tACAGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTg < 6:336485‑M2/149‑2 (MQ=255) aCAGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTgc < 7:214615‑M2/149‑3 (MQ=255) cAGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTgc > 3:260029‑M2/1‑146 (MQ=255) aGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTgcgc < 7:202200‑M2/149‑5 (MQ=255) aaGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCctgc < 2:217770/149‑1 (MQ=255) aGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCctgct < 3:57950/149‑1 (MQ=255) cgcACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCTTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTgg < 4:303510/149‑1 (MQ=255) cgcACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTgg > 1:257889/1‑149 (MQ=255) gcACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTgga < 5:50546/149‑2 (MQ=255) cacaACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGt < 8:266385/149‑1 (MQ=255) caACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGa < 7:151713/149‑1 (MQ=255) cgcgCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCg > 7:214405/1‑149 (MQ=255) cgcAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGc < 3:7672/149‑1 (MQ=255) cgcAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGc < 6:85002/149‑1 (MQ=255) cAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGa < 5:329888/149‑1 (MQ=255) cTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTgg > 1:377385/1‑149 (MQ=255) ccTCGCCCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGc < 8:357454/147‑1 (MQ=255) 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cgccgAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGccc < 3:29549/149‑1 (MQ=255) aGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCctgctg < 1:198640/149‑1 (MQ=255) gCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCtgctgc < 2:257889/149‑1 (MQ=255) ccGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGTACCCGCCTCGAAGCCctgctg > 1:246160/1‑147 (MQ=255) cGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAg < 6:174374/149‑1 (MQ=255) 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aGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAg < 8:353095/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAgc > 7:290466/1‑149 (MQ=255) cTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAgcg > 8:233909/1‑148 (MQ=255) tGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAgcgc > 8:290484/1‑148 (MQ=255) aCGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCGAGGTCAAg < 1:226075/139‑1 (MQ=255) aCGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCAGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCCTGCGCACAGCCTCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAg > 2:226075/1‑139 (MQ=255) cGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAActgct < 2:377385/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACtgctgc > 5:141957/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACtgctgc > 7:23474/1‑147 (MQ=255) gccgccGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAg < 6:179094/148‑1 (MQ=255) ccgccgTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGCAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTCCGGCTAGGc > 8:240253/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGc > 8:330059/1‑149 (MQ=255) cgccgTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCg < 6:299725/149‑1 (MQ=255) gccgTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCg > 6:101450/1‑148 (MQ=255) | TACAGAAAAGCGCACAACCCGCGCAAATGGCCTTCCTCGACCGGCGCTTCGCCGCCGAGCCGGACGCCGCCGTACAGGCCGCCCTCGGTCTGGCCCTGGCCAACCTGCAGCTGGGCGCCAGCGAGCCTGCGGTACGCCTGGCCGCCGTGCGCCTGCTGGGTGAAACCGGCGACCCGCTGGCCCGCACCCGCCTCGAAGCCCTGCTGCAGCCCGATGCAGAACTAGACCCGGGCGTGCGCACAGCCGCCGAAACGAGCCTGGCCCAGGTCAAGCGCAAACTGCTGCTAGGCG > NC_002947/5510103‑5510393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |