New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6047967 | 57 (0.800) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 6.0% | coding (442/1050 nt) | PP_5300 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 6048039 | 72 (1.050) | coding (514/1050 nt) | PP_5300 | LysR family transcriptional regulator |
CACCGCCCAGGCCTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAAC > NC_002947/6047891‑6048182 | cacCGCCCAGGCCTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCgg > 2:88934/1‑149 (MQ=255) cccAGGCCTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCGCAGCCTGTTGCTGCCGGcactg > 4:307996‑M2/1‑144 (MQ=255) ccAGGCCTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGcactgg > 2:124526‑M2/1‑143 (MQ=255) gCCTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCTGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGTTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGa < 5:772/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGt > 7:295011/1‑149 (MQ=255) ggCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGtt < 3:46433/147‑1 (MQ=255) gCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCAt < 4:140274/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCAt < 3:382908/149‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGCCGAACGTGCGGAGGAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCTGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGTAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCTGCACTGGCCGAGTTCAt < 3:285898/148‑1 (MQ=255) aGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAAc > 6:294777/1‑149 (MQ=255) cGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTAcc > 5:18506/1‑149 (MQ=255) tGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATAGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCt > 7:55241/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCtt > 3:338495/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCtt > 1:298666/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTg > 3:283553/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGCCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTg > 3:210319/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGt < 4:338495/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGCCGCTg < 5:11606/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCCCTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGAt > 2:176022/1‑149 (MQ=255) gAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGc > 3:357544/1‑131 (MQ=255) gAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGc < 4:357544/131‑1 (MQ=255) gcATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCaa > 7:80760/1‑148 (MQ=255) gcATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAac < 8:80760/149‑1 (MQ=255) ccATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCGCCTCCAACACCTTc > 2:233601/1‑149 (MQ=255) aTGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGAt < 2:351646/128‑1 (MQ=255) aTGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGAt > 1:351646/1‑128 (MQ=255) tGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGTACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGcactggtcatggcaatgcgcgctgcttccagcgcctgctcggcac < 6:426637‑M2/126‑46 (MQ=255) tGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGTACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGcactggtcatggcaatgcgcgctgcttccagcgcctgctcggcac > 5:426637‑M2/1‑81 (MQ=255) gACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGcactggtcatggcaatgcgcgctgcttccagcgcctgctcggcacgttcggcctgctcggccaaggcct < 8:360150‑M2/149‑70 (MQ=255) cAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTTGCCAAcc < 8:281215/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCAGGTGGTAAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACACCCTCTTGCTGCCGCCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTAGTCCCTGGAGATGGGCACCTCCACCACCTTCGCCAACCt > 2:377462/1‑148 (MQ=255) gAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTTCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCg < 8:295011/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATgg < 8:286235/118‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATgg > 7:286235/1‑118 (MQ=255) aGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGgcgc < 7:145120/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGgcgc > 8:256700/1‑149 (MQ=255) tggtCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCACCACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGAc > 4:60753/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGcc > 5:100634/1‑149 (MQ=255) aGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGa > 1:418980/1‑149 (MQ=255) aGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGa > 2:179013/1‑149 (MQ=255) gCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGa > 2:419747/1‑148 (MQ=255) gTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCt > 1:391712/1‑149 (MQ=255) gcCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTgcgc < 1:21093/149‑1 (MQ=255) ccTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGcc > 7:304534/1‑149 (MQ=255) ccTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGcc < 1:419747/149‑1 (MQ=255) cTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGcactggtcatggcaatgcgcgctgcttccagcgcctgctcggcacgttcggcctgctcggccaaggcctgggcggtgtcagtcggcagatagccctttcggctctt > 7:360150‑M2/1‑43 (MQ=255) ttACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCt > 8:264018/1‑148 (MQ=255) aCCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGa < 6:18506/148‑1 (MQ=255) tGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCaa > 2:140103/1‑149 (MQ=255) cACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGTGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAac < 8:55241/148‑1 (MQ=255) cACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCaa < 8:304534/147‑1 (MQ=255) aCGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAacac < 3:65497/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGATTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCa < 7:98307/104‑1 (MQ=255) ggCGGTGATGAACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCa > 8:98307/1‑104 (MQ=255) cGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCg < 4:283553/149‑1 (MQ=255) ggTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACCCCTCCg > 7:155845/1‑148 (MQ=255) gATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAg > 4:427626/1‑148 (MQ=255) aTGCAGAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTAGCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGc < 4:210319/148‑1 (MQ=255) aTGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGCCATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCa > 6:361151/1‑149 (MQ=255) tGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAc < 2:280728/149‑1 (MQ=255) tGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGCTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAc < 4:306276/149‑1 (MQ=255) gCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAcc > 1:438235/1‑149 (MQ=255) cacaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGgc > 3:322781/1‑100 (MQ=255) cacaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGgc < 4:322781/100‑1 (MQ=255) cacaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAcc < 1:140103/148‑1 (MQ=255) cacaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAcc < 2:438235/148‑1 (MQ=255) cacaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCt > 3:422337/1‑149 (MQ=255) caGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCGCCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTgg < 1:233601/149‑1 (MQ=255) caGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCg < 5:209587/139‑1 (MQ=255) caGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCg > 6:209587/1‑139 (MQ=255) caGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTgg > 6:427250/1‑149 (MQ=255) gCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGtt < 5:294777/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGtt < 6:100634/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTg > 6:3227/1‑149 (MQ=255) ttGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGcc < 3:20862/148‑1 (MQ=255) ttGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGcc < 2:391712/148‑1 (MQ=255) ttGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGc < 1:179013/147‑1 (MQ=255) ttGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCg > 5:175321/1‑149 (MQ=255) tgcCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAAc > 6:443886/1‑149 (MQ=255) tgcCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAAc > 2:263496/1‑149 (MQ=255) | CACCGCCCAGGCCTTGGCCGAGCAGGCCGAACGTGCCGAGCAGGCGCTGGAAGCAGCGCGCATTGCCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAAC > NC_002947/6047891‑6048182 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |