| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 478261 = | 33 (0.630) | 3 (0.070) | 3/206 | NT | 12.9% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | 478356 = | 15 (0.370) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
GCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGA > NC_002947/478114‑478384 | gattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCg > 5:146796‑M1/148‑149 (MQ=255)gattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccgggcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCg > 7:282309‑M1/148‑149 (MQ=255) attacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCgg < 1:158438‑M1/3‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCctc < 4:189712/148‑1 (MQ=255) ctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCctct < 3:14726‑M1/8‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCtt > 7:97679/1‑149 (MQ=255) gcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaatccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggatgaaagcgctcgaggcttaccagccaggttagacctacCGGCCTCTTc < 6:329055‑M1/10‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTcg > 3:182978/1‑149 (MQ=255) ggcgcagcagcggcggagcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccggtctgaccggtcaggcactgggcgaagcacgcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 7:299201‑M1/136‑149 (MQ=255) gcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 2:46696‑M1/135‑148 (MQ=255) gcgcCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCgg < 1:278270/148‑1 (MQ=255) gcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGc < 6:28775‑M1/4‑1 (MQ=255) cGACGTGGTGCATGCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:320890/149‑1 (MQ=255) gACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc > 5:30645/1‑149 (MQ=255) cggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:317394‑M1/126‑149 (MQ=255) ggcggcgcttgcggtggatgttaagcctttggtgcaagcctggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaatgtgaacggctgaaagcgctagaggcttaccagcgctgttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 8:54600‑M1/125‑148 (MQ=255) gTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:233838/148‑1 (MQ=255) cATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac > 5:306294/1‑149 (MQ=255) gcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 4:184527‑M1/29‑1 (MQ=255) tCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCg < 2:264109/119‑1 (MQ=255) tCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCg > 1:264109/1‑119 (MQ=255) cGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacgacg < 4:182978/149‑1 (MQ=255) cGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacgacg < 6:30645/149‑1 (MQ=255) tgGTCAAGTGCATGGCGGAGCTGTGGCTGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGTGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCTCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGa < 7:211447/149‑1 (MQ=39) tgGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGACGGTGGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCGTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCt > 5:172097/1‑147 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGc < 6:306294/149‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctc > 5:159925/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct > 1:70460/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct < 6:159925/149‑1 (MQ=255) gcaagccgggctgaccggtcaggcactggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTAATCGAGGGTaa < 8:284702‑M1/18‑1 (MQ=255) gCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt > 7:203300/1‑149 (MQ=255) gCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt > 2:290522/1‑149 (MQ=255) cggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGc > 5:329055‑M1/77‑149 (MQ=255) tcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:322111‑M1/74‑148 (MQ=255) tcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:322111‑M1/75‑1 (MQ=255) agagCGTTCCGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGATGCCGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCGGAGCCCAACCTCTGATGAGTCCCCCCTGTAGGAGCggg < 6:172097/149‑1 (MQ=38) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCggg < 1:290522/149‑1 (MQ=255) gatcgatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGt < 8:203300/149‑1 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCGACAACGACCGGCGGAGCCCAACCAGAGATGTGTGCCCCCAGTAGGGGCGGGGTTAacc > 4:14726/1‑149 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCGGACTAACACGGGGGGGGCCCAACCGGGGATTTGTGGCCCCGGTTGGGGCGGGTTTAccc > 2:187887/1‑149 (MQ=255) taaGGTACTGGCCCCCGTGGCCTATGAGTGGCGCGGCTTGCAGTTGACGCACGCTTGAGCCTGTATCGCCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACTCCGACCGCCTGAGCCCAACCACTGATGTGTCCCCCCGGGACGAGCGGGTTTAccc > 8:304074/3‑149 (MQ=37) aGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 8:97679/149‑1 (MQ=255) tACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 4:48066/149‑1 (MQ=255) ggCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCAGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg > 8:19840/1‑149 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTAGCGGGTTAACCCGCTGCTAAGCCCGGGGGAGCCCAACCGGGGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTTACCGCGAAGGGGc > 1:225127/1‑149 (MQ=255) ccccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTTAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCg > 3:116440/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 5:122373/1‑148 (MQ=255) gggTTGCAGTTGCCGCCCGCTTGAGCGTGTTTCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCATACCACGGGCTGAGCCCAACCTCTTATGTGTGCCCCCTTTAGGAGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTaa < 6:122373/149‑1 (MQ=255) ttGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGcc > 5:165939/1‑149 (MQ=255) ttGACGCCCGGTTGAGCCTGTATGGGCCTCTTGGCGGTTAACCCCGGTCCTACCACGGGGTTCGCCCAACCTCTTTTGTGGGCCCCCTTTTGGCGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGa < 2:225127/147‑1 (MQ=255) | GCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGA > NC_002947/478114‑478384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |