New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1256376 = | 43 (0.830) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.6% | coding (718/1095 nt) | mrp | ATP‑dependent Fe‑S cluster transferase |
? | NC_002947 | 1256462 = | 45 (0.920) | coding (804/1095 nt) | mrp | ATP‑dependent Fe‑S cluster transferase |
CCCAATGGTGTCTGGCGCGCTGCTGCAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCG > NC_002947/1256228‑1256517 | cccAATGGTGTCTGGCGCGCTGCTGCAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTca < 4:161375/149‑1 (MQ=255) cccAATGGTGTCTGGCGCGCTGCTGCAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTca < 7:295625/149‑1 (MQ=255) ggcctgctcacgtatcagcatcgacaacggcagcgacgccagcaggtcgacgccatactggctggccagcttctcgccgccaccctcaccgaacaggtgttcggcatggccgcaattcgagcagatatgcacggccatgttctcgACCa < 4:282419‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGGTGTCTGGCGAGCTGCTGCAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGCATGACCTGGATTACTTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTTGTCGGTTCGGTGAACGTcaccac > 5:101360/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCTGCAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCt > 3:17560/1‑149 (MQ=255) gcAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCgctgc > 5:22602/1‑149 (MQ=255) cAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCgctgct < 1:10454/149‑1 (MQ=255) aagtGGTCACCCAGACCGCCTTGGATTACCTGGATTACCTGGTGATCGTTATGCCTCCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCATGGCACAAAAGGTACCGTTGGTCGGTTCTGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCgctgct < 6:101360/145‑1 (MQ=255) gTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGc < 1:168886/149‑1 (MQ=255) ccAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCaag > 2:136187/1‑148 (MQ=255) ccAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCaag > 3:243312/1‑148 (MQ=255) cAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCaagaa < 7:248065/149‑1 (MQ=255) cAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCaag > 4:287765/1‑147 (MQ=255) ccGCCTGGGATGACCTGGATTATCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCAAAGAAGGGc > 7:48421/1‑149 (MQ=255) aCCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTg > 6:101728/1‑140 (MQ=255) aCCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTg < 5:101728/140‑1 (MQ=255) ccTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTcc < 1:136187/149‑1 (MQ=255) gATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCaa < 7:216228/149‑1 (MQ=255) tGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTc < 5:226367/134‑1 (MQ=255) tGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTc > 6:226367/1‑134 (MQ=255) agctggatGTCACCGGTACCCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTcc > 6:99873/7‑149 (MQ=255) tCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTcc < 6:22602/148‑1 (MQ=255) cGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAAGATTCCgg > 4:81962/1‑149 (MQ=255) ttctcgccgccaccctcaccgaacaggtgttcggcatggccgcaattcgagcagatatgcacggccatgttctcgACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGt < 3:232483‑M1/74‑1 (MQ=255) tgcacccACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTTGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTg < 1:115954/144‑1 (MQ=255) gatGTCACCGGTACCCGGTGGCATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGc > 3:151671/2‑149 (MQ=255) cACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGc > 5:54479/1‑149 (MQ=255) ccGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGt > 8:97617/1‑149 (MQ=255) gggTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTgg < 6:60726/149‑1 (MQ=255) cctcaccgaacaggtgttcggcatggccgcaattcgagcagatatgcacggccatgttctcgACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTc > 4:232483‑M1/63‑149 (MQ=255) cGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCgaga < 7:97617/149‑1 (MQ=255) aacaggtgttcggcatggccgcaattcgagcagatatgcacggccatgttctcgACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAATGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTgg > 5:62524‑M1/55‑133 (MQ=255) aacaggtgttcggcatggccgcaattcgagcagatatgcacggccatgttctcgACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAATGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTgg < 6:62524‑M1/79‑1 (MQ=255) aCATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACAt < 2:260997/148‑1 (MQ=255) cATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATgg < 4:17560/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGACCCTGCCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGACGCAGGACCTGGCCCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGAGTGGTCGAGAACATGGc > 5:141058/1‑149 (MQ=255) cAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGt < 6:54479/149‑1 (MQ=255) gCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGc < 3:287765/149‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa > 6:257976/1‑149 (MQ=255) cTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa > 1:69597/1‑149 (MQ=255) ccTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa > 3:157606/1‑144 (MQ=255) ccTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa < 4:157606/144‑1 (MQ=255) ccTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGAGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGAGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCt > 5:234020/1‑149 (MQ=255) gCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCt < 2:69597/148‑1 (MQ=255) aaaaGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAAt > 2:57969/1‑149 (MQ=255) ggttcggtGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAaca > 3:11505/1‑149 (MQ=255) ggttcggtGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAac < 4:243312/148‑1 (MQ=255) tcggtGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGGTGGATGCCAACAAGGTCGTGGAAATGTTCCGGAATGTGAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTGGAATTGCGGCCATGCCGAacacg < 6:141058/148‑2 (MQ=255) tGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCga < 7:61128/97‑1 (MQ=255) tGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCga > 8:61128/1‑97 (MQ=255) aTCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCg < 8:48421/148‑1 (MQ=255) | CCCAATGGTGTCTGGCGCGCTGCTGCAACTGGTCACCCAGACCGCCTGGGATGACCTGGATTACCTGGTGATCGATATGCCACCGGGTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCG > NC_002947/1256228‑1256517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |