| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1256376 = | 43 (0.830) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.6% | coding (718/1095 nt) | mrp | ATP‑dependent Fe‑S cluster transferase |
| ? | NC_002947 | 1256462 = | 45 (0.920) | coding (804/1095 nt) | mrp | ATP‑dependent Fe‑S cluster transferase | |||||
GTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATACGTGAGCAGGCCGA > NC_002947/1256314‑1256608 | cctcaccgaacaggtgttcggcatggccgcaattcgagcagatatgcacggccatgttctcgACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTc > 4:232483‑M1/63‑149 (MQ=255) cGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCgaga < 7:97617/149‑1 (MQ=255) aCATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACAt < 2:260997/148‑1 (MQ=255) cATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATgg < 4:17560/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCTGACCCTGCCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGACGCAGGACCTGGCCCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGAGTGGTCGAGAACATGGc > 5:141058/1‑149 (MQ=255) cAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGt < 6:54479/149‑1 (MQ=255) gCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGc < 3:287765/149‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa > 1:69597/1‑149 (MQ=255) cTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa > 6:257976/1‑149 (MQ=255) ccTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa < 4:157606/144‑1 (MQ=255) ccTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCa > 3:157606/1‑144 (MQ=255) ccTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGAGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGAGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCt > 5:234020/1‑149 (MQ=255) gCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCt < 2:69597/148‑1 (MQ=255) aaaaGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAAt > 2:57969/1‑149 (MQ=255) ggttcggtGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAaca > 3:11505/1‑149 (MQ=255) ggttcggtGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAac < 4:243312/148‑1 (MQ=255) tcggtGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGGTGGATGCCAACAAGGTCGTGGAAATGTTCCGGAATGTGAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTGGAATTGCGGCCATGCCGAacacg < 6:141058/148‑2 (MQ=255) tGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCga > 8:61128/1‑97 (MQ=255) tGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCga < 7:61128/97‑1 (MQ=255) aTCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCg < 8:48421/148‑1 (MQ=255) gaccacgcccagcaccggaatgttgaccttgcggaacatttccacgcccttcttggcatccagcagcgccaggtcctgcggcgtggtCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAgg > 4:232483‑M2/88‑149 (MQ=255) CCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTg < 3:201271‑M1/144‑1 (MQ=255) CCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTg > 4:201271‑M1/1‑144 (MQ=255) CACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTg < 6:92957‑M1/149‑1 (MQ=255) ccagcaccggaatgttgaccttgcggaacatttccacgccattcttggcatccagcagcgccaggtcctgcggcgtggtCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGtt < 6:62524‑M2/54‑1 (MQ=255) ccagcaccggaatgttgaccttgcggaacatttccacgccattcttggcatccagcagcgccaggtcctgcggcgtggtCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGtt > 5:62524‑M2/80‑133 (MQ=255) CGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTggcggc < 5:32003‑M1/149‑1 (MQ=255) cAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCga < 3:269874/149‑1 (MQ=255) gACCTGGCTTTGCTGGATGGCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTGTAAATAGCGGTGCTGGGCGTGGTCGTGAACTTGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGGTCGGTGAGGGGGGCGGCgagta < 6:234020/149‑3 (MQ=255) accggaatgttgaccttgcggaacatttccacgcccttcttggcatccagcagcgccaggtcctgcggcgtggtCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGaa < 3:232483‑M2/75‑1 (MQ=255) aCCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAg < 5:99873/149‑1 (MQ=255) gctgGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGa < 6:151657/108‑1 (MQ=255) gctgGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGa > 5:151657/1‑108 (MQ=255) ctgGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACTTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGgccagcca < 1:57969/149‑1 (MQ=255) gATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGccagccag < 4:11505/147‑1 (MQ=255) cAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGt > 4:26879/1‑112 (MQ=255) cAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGt < 3:26879/112‑1 (MQ=255) gaagGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTc > 5:33159/1‑148 (MQ=255) cGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATTGCGTCGACctgc < 6:33159/149‑1 (MQ=255) tGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACctgctg > 2:308630/1‑149 (MQ=255) tGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACctgctg > 5:67801/1‑149 (MQ=255) ttCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGc < 5:257976/148‑1 (MQ=255) cGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGcc > 3:289482/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTg > 4:194089/1‑110 (MQ=255) gCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTg < 3:194089/110‑1 (MQ=255) gCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCg > 7:112238/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGt > 3:282419/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGt > 2:321924/1‑149 (MQ=255) tggTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGtt < 8:13892/147‑1 (MQ=255) gTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCGTATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTc > 7:255287/1‑149 (MQ=255) tCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTc > 8:219010/1‑148 (MQ=255) aaCATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGAt > 1:10062/1‑149 (MQ=255) aaCATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGAt > 4:230048/1‑149 (MQ=255) cATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCGTATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGc < 8:255287/149‑1 (MQ=255) cATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGc < 6:67801/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGAt < 1:321924/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATAc > 5:24210/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGTGTTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATTCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATACGTg < 3:81962/148‑1 (MQ=255) cTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATACGTGa < 5:92957/149‑1 (MQ=255) tggtCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATACGTGAGCAGGcc < 4:282419‑M2/145‑1 (MQ=255) cGAGAACATGGCCGTGCATATCTGGTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATACGTGAGCAGGCCGa > 2:271464/1‑147 (MQ=255) | GTACCGGTGACATCCAGCTGACCCTGGCACAAAAGGTACCGGTGGTCGGTTCGGTGATCGTCACCACGCCGCAGGACCTGGCGCTGCTGGATGCCAAGAAGGGCGTGGAAATGTTCCGCAAGGTCAACATTCCGGTGCTGGGCGTGGTCGAGAACATGGCCGTGCATATCTGCTCGAATTGCGGCCATGCCGAACACCTGTTCGGTGAGGGTGGCGGCGAGAAGCTGGCCAGCCAGTATGGCGTCGACCTGCTGGCGTCGCTGCCGTTGTCGATGCTGATACGTGAGCAGGCCGA > NC_002947/1256314‑1256608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |