New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1672445 = | 48 (0.920) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 6.2% | coding (444/1806 nt) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
? | NC_002947 | 1672488 = | 45 (0.900) | coding (401/1806 nt) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
CCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGAC > NC_002947/1672299‑1672591 | ccGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGAt > 5:151265/1‑149 (MQ=255) cacaCCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTg > 1:143845/1‑149 (MQ=255) cacCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGc > 4:49385/1‑149 (MQ=255) ggTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCAcgc < 1:172540/149‑1 (MQ=255) gaGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGc < 4:277429/123‑1 (MQ=255) gaGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCAGGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGc > 3:277429/1‑123 (MQ=255) ctGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGc < 3:102926/127‑1 (MQ=255) ctGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGc > 4:102926/1‑127 (MQ=255) gCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGa > 1:25455/1‑149 (MQ=255) gtcacctggctggtgattgcactggcaacccactggctgctcgggttcgactggccgctggcgattcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacggtGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCAc > 6:93714‑M1/105‑149 (MQ=255) gTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGCAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATTATCCCTTCCCAACGCATGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTgg < 3:31679/149‑1 (MQ=255) cccTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGcc > 3:296161/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGt < 2:150515/147‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGATGACGAAGCTGTAGACCACCCCGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCTCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTc < 4:224294/148‑1 (MQ=255) gCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGt < 3:259203/149‑1 (MQ=255) gatgatGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTc > 8:88692/1‑148 (MQ=255) tgatgaAGCTGTAGACCACCACGGCGATCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCCACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAg < 8:77730/149‑1 (MQ=255) gaAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTg < 3:77479/148‑1 (MQ=255) gaAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGc > 3:172040/1‑149 (MQ=255) tAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGaaaa < 3:49385/148‑1 (MQ=255) tAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGaaa < 7:56129/147‑1 (MQ=255) accaccACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAAt > 7:112918/1‑149 (MQ=255) ccaccaCGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGGCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATc < 7:244737/149‑1 (MQ=255) cacGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAgg < 2:65417/124‑1 (MQ=255) cacGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAgg > 1:65417/1‑124 (MQ=255) cacGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCa < 4:172040/149‑1 (MQ=255) ttcgactggccgctggcgattcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacggtGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCAcc < 3:123085‑M1/46‑1 (MQ=255) ttcgactggccgctggcgattcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacggtGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCAcc > 4:123085‑M1/60‑105 (MQ=255) acGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAg < 6:151265/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCg < 6:117346/149‑1 (MQ=255) gCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCgg < 7:68319/149‑1 (MQ=255) gCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCgg > 6:244944/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGc < 2:25455/149‑1 (MQ=255) agcagcGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGc > 1:196327/1‑147 (MQ=255) cgcCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATTGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAAc < 2:196327/149‑1 (MQ=255) cgcCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAAc < 5:233944/149‑1 (MQ=255) gATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAAccc > 6:252843/1‑147 (MQ=255) tCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGagc < 7:88692/149‑1 (MQ=255) ggTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGagcagc < 4:296161/149‑1 (MQ=255) gTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGagcagc > 5:45419/1‑148 (MQ=255) cATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTggg > 8:10414/1‑149 (MQ=255) tCCCTTCCCAACGCAGCATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGc > 8:8503/1‑148 (MQ=255) cccTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTgg < 4:282232/142‑1 (MQ=255) cccTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTgg > 3:282232/1‑142 (MQ=255) cTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTc > 7:63221/1‑80 (MQ=255) cTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTc < 8:63221/80‑1 (MQ=255) aaCGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATc < 5:117899/149‑1 (MQ=255) cAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCCCCACGCGCAGCATGGGCACGATCCCCGTGGGGCCGGTCCCCAGGTTAACGTTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCAAGTCGAACCAGAGCAGCCAGGGGGGTGACAGGTCAATCAc > 5:314132/1‑147 (MQ=255) ggATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCCCGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCCCCAGGGTCAAGGTGCGGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGCGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCAccagc > 4:291281/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCAccagccag < 6:45419/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCAccagccag < 5:244944/149‑1 (MQ=255) gTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAgg > 3:145522/1‑149 (MQ=255) gcgATCGCTGCCTTTGGCCGCACCAAGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGACGGTCACCAGGGTCAAGGTGCAGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTAGAACCAGAGAAGACAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGAc > 2:245968/1‑149 (MQ=255) cgATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCTGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGAc > 7:89283/1‑148 (MQ=255) GATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGAc < 6:156750‑M1/147‑1 (MQ=255) | CCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGAC > NC_002947/1672299‑1672591 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |