New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2440084 | 52 (1.000) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (825/1176 nt) | pcaF‑II | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase subunit beta |
? | NC_002947 | = 2440124 | 61 (1.260) | coding (865/1176 nt) | pcaF‑II | beta‑ketoadipyl‑CoA thiolase subunit beta |
AAGCCTGCGTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGCCCGTGCTGAAA > NC_002947/2439938‑2440231 | aaGCCTGCGTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCA < 1:120352‑M1/147‑1 (MQ=255) aaGCCTGCGTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCA < 4:114991‑M1/147‑1 (MQ=255) aaGCCTGCGTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCA > 2:120352‑M1/1‑147 (MQ=255) aGCCTGCGTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGGCATGTACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCTGTTCGATGGCAGTg < 6:130281/149‑1 (MQ=255) gTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGgtg < 5:153004/149‑1 (MQ=255) ttCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGgtgt > 6:66522/1‑149 (MQ=255) aaCCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACTTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGgtgt < 1:76082/146‑1 (MQ=255) aaCCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGa > 8:82405/1‑149 (MQ=255) aCCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAGCCCCATCCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCg < 1:109144/149‑1 (MQ=255) cGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCg > 1:292105/1‑149 (MQ=255) gccgttcGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑CTCA‑CCGACGGCGCGTCGTGCATGGACGTCATGTCCGGGCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCAGTCGCGGTGATCCGTTCGATGGACGTGGACGGTGTCGACCCGGCAAt > 8:211540/7‑148 (MQ=255) gCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATACAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAAt > 3:135504/1‑148 (MQ=255) gTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTTATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATg < 1:61945/149‑1 (MQ=255) gTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATg < 4:137086/149‑1 (MQ=255) tACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATgg < 7:82405/149‑1 (MQ=255) gTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTa > 4:10904/1‑149 (MQ=255) tCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTAc > 5:34815/1‑149 (MQ=255) cGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGc > 1:198025/1‑149 (MQ=255) gTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtg > 8:163417‑M2/1‑147 (MQ=255) aCCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgc < 6:307617‑M2/148‑4 (MQ=255) ccTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgcc > 5:307617‑M2/1‑144 (MQ=255) cTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgaccccggccactgccat < 7:273657‑M1/149‑47 (MQ=255) cTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccat > 7:90081‑M1/1‑103 (MQ=255) cTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgccat > 6:34815‑M2/1‑143 (MQ=255) tcgtcgCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATc > 8:161236/1‑126 (MQ=255) tcgtcgCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATc < 7:161236/126‑1 (MQ=255) gtcgCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgccatc > 8:295396‑M2/1‑140 (MQ=255) tcgCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGAc < 2:292105/149‑1 (MQ=255) tcgCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTACATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGAc < 5:50249/149‑1 (MQ=255) gCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCTTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccatcgaac < 8:90081‑M1/148‑52 (MQ=255) a‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGc > 4:96690/1‑149 (MQ=255) ggCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCaa < 7:187447/149‑1 (MQ=255) cATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCt < 3:96690/149‑1 (MQ=255) tCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGAc > 4:316665/1‑148 (MQ=255) tCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGAc > 4:311715/1‑148 (MQ=255) tCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATg > 6:85346/1‑149 (MQ=255) aTGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGc > 1:99996/1‑149 (MQ=255) gTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGcc > 3:103144/1‑148 (MQ=255) cGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCATTCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGat < 2:99996/148‑1 (MQ=255) ggTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGatat > 6:117686/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCg < 3:10904/149‑1 (MQ=255) cAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGa < 8:141531/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATc < 1:69756/146‑1 (MQ=255) aGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATc > 2:69756/1‑146 (MQ=255) aGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGAc < 4:135504/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGAc > 1:146572/1‑149 (MQ=255) gTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACtt > 5:241453/1‑148 (MQ=255) cATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATc > 7:76955/1‑148 (MQ=255) aTGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATc > 6:320812/1‑147 (MQ=255) aTGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGa < 6:154269/149‑1 (MQ=255) ccTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTc > 7:158792/1‑148 (MQ=255) cTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCaa > 3:259905/1‑149 (MQ=255) cTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCaa > 3:255529/1‑149 (MQ=255) cGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAAc > 2:108239/1‑148 (MQ=255) gTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGaa < 8:158792/149‑1 (MQ=255) cAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCtt > 4:79790/1‑149 (MQ=255) cAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCtt > 2:131383/1‑149 (MQ=255) aGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTc > 7:184577/1‑149 (MQ=255) cgggtaTCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGGCGACCCGGGAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGGGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAg < 7:211540/144‑1 (MQ=255) ggTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAgg > 2:91557/1‑149 (MQ=255) gTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcaagaggcgccgtcggtgatctgc < 8:90081‑M2/148‑98 (MQ=255) gTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGccc > 2:234070/1‑149 (MQ=255) gTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGccc > 1:133660/1‑149 (MQ=255) gTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGccc > 5:202585/1‑149 (MQ=255) gATGGCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgac > 8:295396‑M1/1‑7 (MQ=255) aTGGCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgacgag > 6:34815‑M1/1‑6 (MQ=255) aTGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgacgag > 7:90081‑M2/1‑46 (MQ=255) aTGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGCCCGTGCt < 3:79790/149‑1 (MQ=255) aTGGCAGTGGCCGGGGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGtgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgacgag < 7:273657‑M2/149‑104 (MQ=255) ggCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgacgagg > 5:307617‑M1/1‑4 (MQ=255) ggCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGCCCGTGCTg > 6:111182/1‑148 (MQ=255) gCAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgacgaggt < 6:307617‑M1/148‑146 (MQ=255) cAccgggccgtagcccatgattgccgggtcgacaccggccactgccatcgaacggatcaccgccaatggctggataccgaggtccatggcacgctgaccggacatgacgatcatgcacgaggcgccgtcggtgatctgcgacgaggtac > 8:163417‑M1/1‑2 (MQ=255) cAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTCCGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCCAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGCCCGTGCTGaa < 7:268330/148‑1 (MQ=255) | AAGCCTGCGTTCAACCCGAAAGGCGGTACGGTCACGGCCGGTACCTCGTCGCAG‑ATCA‑CCGACGGCGCCTCGTGCATGATCGTCATGTCCGGTCAGCGTGCCATGGACCTCGGTATCCAGCCATTGGCGGTGATCCGTTCGATGGCAGTGGCCGGTGTCGACCCGGCAATCATGGGCTACGGCCCGGTGCCATCGACCCAGAAAGCCCTCAAGCGTGCGGGCTTGACCATGGCCGATATCGACTTCATCGAGCTCAACGAAGCCTTCGCTGCGCAGGCCCTGCCCGTGCTGAAA > NC_002947/2439938‑2440231 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |