New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3101333 | 37 (0.710) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 10.7% | coding (634/681 nt) | PP_2710 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3101419 | 32 (0.650) | coding (53/807 nt) | PP_2711 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
TCAGCTCGCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGC > NC_002947/3101193‑3101478 | tCAGCTCGCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCcg > 7:10717/1‑149 (MQ=255) gCTCGCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGt > 6:133119/1‑149 (MQ=255) cTCGCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTg < 6:94043/149‑1 (MQ=255) tCGCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGc > 5:253270/1‑149 (MQ=255) gCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCg < 1:115010/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCg > 5:140643/1‑149 (MQ=255) aCGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCTCGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCggg < 5:225042/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGgca < 3:164631/149‑1 (MQ=255) gcTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGgcagc > 5:211688/1‑146 (MQ=255) gcTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAag < 6:319652/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAagag > 5:180144/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGCCGATGCCGGTGCCCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTGCACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGttt > 6:66124/1‑149 (MQ=255) gTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTgg < 6:211688/149‑1 (MQ=255) cTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCt > 2:193767/1‑146 (MQ=255) cTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGa < 1:193767/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCgtg < 5:145781/149‑1 (MQ=255) aCGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCgtg < 6:140643/149‑1 (MQ=255) cGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCgtgg < 6:180144/149‑1 (MQ=255) cgacgaTGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGcctatgcccccactggcgccggtgaggatcaccacggactcagccaaccgcatggtgcacctcttgctgccc > 7:190642‑M1/1‑77 (MQ=255) aTGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTgg > 8:126396/1‑149 (MQ=255) gcagGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctg < 1:45599‑M2/149‑5 (MQ=255) agGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGcctatgcccccactggcgccggtgaggatcaccacggactcagccaaacgcatggtgcacctcttgctgcccggcacgcggcaagccctgga < 8:190642‑M1/149‑93 (MQ=255) ccGTCCTCCCCGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTCCACCGCGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCTTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAAtt < 5:165109/149‑1 (MQ=255) ccGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAAtt < 5:133119/149‑1 (MQ=255) cGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTg < 7:126396/149‑1 (MQ=255) cctccACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGGGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTgg < 6:253270/147‑1 (MQ=255) aaGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTgcg > 1:153862/1‑149 (MQ=255) gtcgtcTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGcctatgcccccactggcgccggtgaggatcaccacggactcagccaaacgcatggtgcacctcttgctgcccggcacgcggcaagccctggaacatc < 1:309590‑M1/131‑98 (MQ=255) gtcgtcTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGcctatgcccccactggcgccggtgaggatcaccacggactcagccaaacgcatggtgcacctcttgctgcccggcacgcggcaagccctggaacatc > 2:309590‑M1/1‑34 (MQ=255) tcTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCgg > 7:69569/1‑149 (MQ=255) tACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACCGCTCTGCGCTGCCGGTg > 8:40707/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGcc > 6:170421/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGcc > 4:119196/1‑149 (MQ=255) tACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGgtgt < 2:45599/149‑1 (MQ=255) ccGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGCTCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGATGTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGc > 6:323092/1‑149 (MQ=255) cGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAAc < 4:171609/117‑1 (MQ=255) cGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAAc > 3:171609/1‑117 (MQ=255) cGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGcc > 6:15724/1‑149 (MQ=255) agaTGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGt < 8:10717/149‑1 (MQ=255) gaTGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgac > 2:309590‑M2/1‑97 (MQ=255) gaTGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgac < 1:309590‑M2/131‑35 (MQ=255) ttCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTc > 2:133472/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTc < 5:170421/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgaccttggccgcgtggaggacggcct < 8:190642‑M2/149‑58 (MQ=255) tCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTc < 3:119196/148‑1 (MQ=255) cAGGcctatgcccccactggcgccggtgaggatcaccacggactcagccaaacgcatggtgcacctcttgctgcccggcacgcggcaagccctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgaccttggccgcgtggaggacggcctgc < 1:45599‑M1/149‑146 (MQ=255) | TCAGCTCGCACGGTGCGCTCGACCAGGAGCACATGGTGACCTACAAACGGTTGATGGATCGCCTCGACGATGCCGGTGACCAGCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGC > NC_002947/3101193‑3101478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |