New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3101333 | 37 (0.710) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 10.7% | coding (634/681 nt) | PP_2710 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3101419 | 32 (0.650) | coding (53/807 nt) | PP_2711 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
GCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAGGGCGC > NC_002947/3101275‑3101564 | gcagGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctg < 1:45599‑M2/149‑5 (MQ=255) ccGTCCTCCCCGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTCCACCGCGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCTTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAAtt < 5:165109/149‑1 (MQ=255) ccGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAAtt < 5:133119/149‑1 (MQ=255) cGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTg < 7:126396/149‑1 (MQ=255) cctccACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGGGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTgg < 6:253270/147‑1 (MQ=255) aaGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTgcg > 1:153862/1‑149 (MQ=255) tcTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCgg > 7:69569/1‑149 (MQ=255) tACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACCGCTCTGCGCTGCCGGTg > 8:40707/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGcc > 6:170421/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGcc > 4:119196/1‑149 (MQ=255) tACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGgtgt < 2:45599/149‑1 (MQ=255) ccGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGCTCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGATGTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGc > 6:323092/1‑149 (MQ=255) cGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAAc > 3:171609/1‑117 (MQ=255) cGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAAc < 4:171609/117‑1 (MQ=255) cGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGcc > 6:15724/1‑149 (MQ=255) agaTGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGt < 8:10717/149‑1 (MQ=255) gaTGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgac > 2:309590‑M2/1‑97 (MQ=255) gaTGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgac < 1:309590‑M2/131‑35 (MQ=255) ttCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTc > 2:133472/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTc < 5:170421/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgaccttggccgcgtggaggacggcct < 8:190642‑M2/149‑58 (MQ=255) tCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTc < 3:119196/148‑1 (MQ=255) ccGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGc < 1:133472/148‑1 (MQ=255) gggCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAgctggctg < 8:69569/149‑1 (MQ=255) gggCAGCAAGAGGTGCACCATGCGGTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGcctggaacatctcggtgtacaagcggtagacgaccttggccgcgtggaggacggcctgctggtcaccggcatcgtcg > 7:190642‑M2/1‑72 (MQ=255) gcagcaAGAGGTTCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCtggctggc < 7:155595/149‑1 (MQ=255) caAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCtga > 1:176522/1‑149 (MQ=255) gTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTg < 2:287250/106‑1 (MQ=255) gTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTg > 1:287250/1‑106 (MQ=255) tGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCg < 2:153862/149‑1 (MQ=255) cACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGACTGATGAACCgg > 1:322610/1‑148 (MQ=255) aTGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTAccc > 6:26624/1‑149 (MQ=255) tttGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATc < 5:66124/149‑1 (MQ=255) ggCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTAGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTc > 5:195393/1‑149 (MQ=255) gCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAg > 4:90305/1‑63 (MQ=255) gCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAg < 3:90305/63‑1 (MQ=255) gATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGAGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCaggagg > 7:290346/1‑149 (MQ=255) aCCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGAc < 5:15724/147‑1 (MQ=255) aCCGGCGCCAGGGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGACCAGCTCTGCGCTGCCGGTTCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCt < 5:323092/149‑1 (MQ=255) ggCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAgg > 5:41080/1‑149 (MQ=255) cATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAGGgc > 5:165520/1‑149 (MQ=255) tAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAGGgcgc < 6:165520/149‑1 (MQ=255) tAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAGGgcgc < 2:176522/149‑1 (MQ=255) tAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGAGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAGGgcgc < 8:290346/149‑1 (MQ=255) | GCAGGCCGTCCTCCACGCGGCCAAGGTCGTCTACCGCTTGTACACCGAGATGTTCCAGGGCTTGCCGCGTGCCGGGCAGCAAGAGGTGCACCATGCGTTTGGCTGAGTCCGTGGTGATCCTCACCGGCGCCAGTGGGGGCATAGGCCTGGAATTGGCTGAACAGCTCTGCGCTGCCGGTGCCCAGGTGTTGGCCGTCAGTCGGCATATGGGCAAGCTGGCTGGCCTGATGAACCGGTACCCTGATCGTCTGCGCTGGCAGGAGGCCGACCTGCGCAGCCCGTCAGGGCGC > NC_002947/3101275‑3101564 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |