New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5718150 = | 68 (1.310) | 5 (0.100) | 4/248 | NT | 7.8% | coding (849/1917 nt) | PP_5020 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
? | NC_002947 | 5718206 = | 55 (1.130) | coding (905/1917 nt) | PP_5020 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
GCTACCGCGATGCGGTCACCCAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAG > NC_002947/5718002‑5718297 | cgatgcatgctggcctgcaattggcccagttcgtcgcggcgttgtacctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccag > 8:287398‑M1/149‑149 (MQ=255) cgatgcatgctggcctgcaattggcccagttcgtcgcggcgttgtacctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccag < 6:290995‑M1/1‑1 (MQ=255) gatgcatgctggcctgcaattggcccagttcgtcgcggcgttgtacctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccag < 7:290408‑M1/1‑1 (MQ=255) cTACCGCGATGCGGTCACCCAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCcgcg > 2:60871/1‑148 (MQ=255) tACCGCGATGCGGCCACCCAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCcgcg > 7:228375/1‑147 (MQ=255) atgcatgctggcctgcaattggcccagttcgtcgcggcgttgtacctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccag < 5:174631‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcatgctggcctgcaattggcccagttcgtcgcggcgttgtacctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccagcag > 7:132435‑M1/146‑149 (MQ=255) catgctggcctgcaattggcccagttcgtcgcggcgttgtacctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccaGCAGGc < 6:155946‑M1/6‑1 (MQ=255) ggTCACCCAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCAGCGCAGGCCAAAacac > 8:75766/1‑149 (MQ=255) aCCCAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCt > 7:305766/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCa > 1:37927/1‑149 (MQ=255) cGGCAATGCCCATCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCATCGCATGGTTGAACAATGCACGTTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGTTGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGGCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGATCACGGtt < 8:206771/148‑1 (MQ=255) gCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGcc > 2:161667/1‑149 (MQ=255) aaaagCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGATGAACAAGGCACGGTACTGCAGCAGGCCAGCCAGATGATGACCTCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCa > 2:278501/5‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGc > 4:163237/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGc < 6:191334/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCt > 5:231904/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCt > 7:116645/1‑149 (MQ=255) gCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTgg > 5:166299/1‑149 (MQ=255) cTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTgg > 8:50212/1‑148 (MQ=255) tCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCaaaa < 8:27867/120‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCa > 8:117291/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCAc < 8:116645/149‑1 (MQ=255) tccATCGAGGAAGCTCTGCAAGGCATGGTTGATCAAGGGACTGTACTGCTGCTGGCCAGCCAGATGATGTCGGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTTCCGGGCAGGCCAAAACACTGCTCACTTTTGCCACCGTGCTGGCACt < 4:100929/148‑1 (MQ=255) cAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACt > 3:100929/1‑147 (MQ=255) cAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTgg > 7:180587/1‑149 (MQ=255) aGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGc > 6:297492/1‑149 (MQ=255) aGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGc > 2:246380/1‑149 (MQ=255) gCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGATCAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGcc > 1:183979/1‑149 (MQ=255) ctgcaggctctgggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccaGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCt < 6:34388‑M1/48‑1 (MQ=255) gCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg < 7:50212/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCCGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg < 1:90139/149‑1 (MQ=255) gCAAGCCCTGCAACGCATGGTTGAACAACGCACCGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCACACCTAGGTGCGCGATGCCGCAGCCGCTCAGGCCCAAACACTGATAACGGTTGGCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTg > 4:284338/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGc < 8:228375/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTGCAACACATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGc > 5:279439/1‑149 (MQ=255) aGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGcc > 3:194154/1‑149 (MQ=255) cTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgct > 3:48873/1‑149 (MQ=255) cTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgct > 7:146978/1‑149 (MQ=255) ggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccaGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgctg > 5:34388‑M1/90‑147 (MQ=255) ggtcaggtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccaGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgc > 6:211775‑M1/90‑149 (MQ=255) cAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgc > 2:164201/1‑149 (MQ=255) cAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgc < 1:246380/149‑1 (MQ=255) gCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGgccgcc > 1:128156/1‑149 (MQ=255) gtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccaGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgctg > 4:29606‑M1/84‑141 (MQ=255) gtctccactggccacacgctctgcggcgcgcagtgtttggcgcagcggaatgatgatctgccgggtaatggcccaggcggccaGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCctgctg < 3:29606‑M1/58‑1 (MQ=255) tGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTgg < 8:224083/149‑1 (MQ=255) gTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTggg < 2:148987/148‑1 (MQ=255) cACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTAGGCCATTACCCGGc < 8:180587/149‑1 (MQ=255) aCGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCgg > 7:139867/1‑147 (MQ=255) gTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGa > 6:187988/1‑148 (MQ=255) gctgcAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGAtcatca > 7:240460/1‑149 (MQ=255) ctgcAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGAtcatca < 3:163237/148‑1 (MQ=255) ctgcAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATcatcat > 4:118827/1‑149 (MQ=255) tgcAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAACCCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGATGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCAtt > 2:67661/1‑149 (MQ=255) cAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTc < 4:194154/148‑1 (MQ=255) aGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCg > 8:139389/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGc < 8:305766/149‑1 (MQ=255) gccagccaGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCt > 7:125931/1‑149 (MQ=255) cagccagATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTgc > 7:262615/1‑149 (MQ=255) ccagATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACCGGGCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCAACATTCCGCTgcgc > 8:290408/1‑148 (MQ=255) gatgatGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCaaa < 8:125931/149‑1 (MQ=255) tgaCCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTg < 1:164201/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCGCAAACCGAGGTTCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTTGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTgctc < 1:278501/149‑3 (MQ=255) ccGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCgg > 5:268761/1‑116 (MQ=255) ccGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCgg < 6:268761/116‑1 (MQ=255) ccGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTgcgc < 2:183979/149‑1 (MQ=255) cTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGcgcc > 2:317296/1‑149 (MQ=255) cTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGcgcc < 8:139867/149‑1 (MQ=255) ttCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGcgccg > 7:213005/1‑149 (MQ=255) gCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCa < 8:146978/148‑1 (MQ=255) aaaCCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCagag > 3:25427/1‑149 (MQ=255) aaCCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGc < 1:161667/149‑1 (MQ=255) aaCCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGc < 7:75766/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCgtg > 5:274443/1‑149 (MQ=255) aGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGtgtg < 3:257834/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTgg < 6:166299/149‑1 (MQ=255) cgcgATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAg < 1:60871/149‑1 (MQ=255) cgATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTg < 5:187988/149‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTg > 2:82861/1‑148 (MQ=255) tgccgctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGgag < 6:279439/149‑1 (MQ=255) ccgctgccgcGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGAc < 7:117291/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGc < 1:102194/124‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGc > 2:102194/1‑124 (MQ=255) cgcAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCag > 8:233142/1‑149 (MQ=255) | GCTACCGCGATGCGGTCACCCAGTTCGGCAATGCCCAGCTCGCCAGCGAGCAAGCGCTGCAACGCATGGTTGAACAAGGCACGGTACTGCTGCAGGCCAGCCAGATGATGACCGCTTCGCAAACCGAGGTGCGCGATGCCGCTGCCGCGCAGGCCAAAACACTGCTCACGGTTGCCACCGTGCTGGCACTGGCCCTTGGCCTGCTGGCCGCCTGGGCCATTACCCGGCAGATCATCATTCCGCTGCGCCAAACACTGCGCGCCGCAGAGCGTGTGGCCAGTGGAGACCTGACCCAG > NC_002947/5718002‑5718297 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |