New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5942862 | 47 (0.900) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 7.7% | coding (248/978 nt) | PP_5210 | alcohol dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 5942894 | 51 (1.030) | coding (280/978 nt) | PP_5210 | alcohol dehydrogenase |
AAGCTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGCACCTCGATGCACGCCCTGC > NC_002947/5942718‑5943008 | aaGCTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACTCCTTGATCCTCGAAGGCAAGTACCAGTTCCACCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTTGGTGCCTACGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGAGACCgg < 1:237632/149‑1 (MQ=255) aaGCTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCgg > 5:25252/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGt > 5:62209/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGAacgcacc > 3:171071‑M1/1‑142 (MQ=255) cTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTc < 8:65443/149‑1 (MQ=255) cGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGTGACCGGGTCATgg < 7:113848/149‑1 (MQ=255) aCTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCAcc < 7:42185/149‑1 (MQ=255) ccGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTg‑g < 2:98860/149‑1 (MQ=255) ctacaacatcGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCCTTCTATCCACGTGGCGAGGCAGCGGGCCTCCTGGCCGCCCTCGGCGAAAAGTCCGGCGCGTTCAAGCTCGGCTACCACATCATGGCCCTCACCGGCTG‑TGGAGCGt > 4:266681/7‑149 (MQ=255) cTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGt > 3:235169/1‑149 (MQ=255) tcGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAg < 2:297991/149‑1 (MQ=255) gAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGAacgcaccccagccggtgagcgccatgacccggtcgccgacc < 4:171071‑M1/148‑42 (MQ=255) aaGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGAGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGGTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGc > 6:83724/1‑147 (MQ=255) aGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCg < 2:162024/149‑1 (MQ=255) gTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTg‑gg > 6:230980/1‑125 (MQ=255) gTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTg‑gg < 5:230980/125‑1 (MQ=255) tACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCAc > 6:164781/1‑116 (MQ=255) tACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCAc < 5:164781/116‑1 (MQ=255) ccAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTg < 5:30345/148‑1 (MQ=255) aGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTGCGGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTg < 1:184876/147‑1 (MQ=255) aGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTg > 2:184876/1‑146 (MQ=255) ttCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGtt > 2:16651/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGtt < 6:25252/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCta < 5:271977/149‑1 (MQ=255) gccgccGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCtat > 1:113706/1‑148 (MQ=255) ccGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGc < 4:235169/148‑1 (MQ=255) ccGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGc < 8:75672/148‑1 (MQ=255) ttCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGAt > 8:213553/1‑149 (MQ=255) tctctcCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATc > 3:89126/1‑149 (MQ=255) tctcCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGGTCAAGGTCGGCGACCGGGTCTTGGCGCTCAGCGGCTG‑GGGGGCGTTCGCCGTGCAAGTGGCGGGGCCGTTGTATAACGTGCTGCCGATccc > 8:293819/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGc > 2:19251/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGa < 4:89126/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCAt < 3:195383/149‑1 (MQ=255) gCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGAacgcaccccagccggtgagcgccatgac < 1:191001‑M1/89‑29 (MQ=255) gCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGAacgcaccccagccggtgagcgccatgac > 2:191001‑M1/1‑61 (MQ=255) gCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATg < 6:62209/149‑1 (MQ=255) gAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGa > 4:313238/1‑149 (MQ=255) aGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTca > 3:293271/1‑149 (MQ=255) aGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTca < 3:194669/149‑1 (MQ=255) gccgccGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCg < 1:99260/147‑1 (MQ=255) gccgccGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCg > 2:99260/1‑147 (MQ=255) cgccgTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCt > 5:212521/1‑149 (MQ=255) ggCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCAt > 2:107642/1‑149 (MQ=255) gCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCAt > 2:293007/1‑148 (MQ=255) gCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCAt > 1:154274/1‑148 (MQ=255) aaGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTa > 4:273362/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCCTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTACACCACCGCAGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACgg > 1:259981/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGc < 1:90624/147‑1 (MQ=255) ggCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGc > 2:90624/1‑147 (MQ=255) gcgTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGCACCTc < 1:293007/149‑1 (MQ=255) cgTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGCACCTCg < 4:293271/149‑1 (MQ=255) tCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGc > 3:82704/1‑128 (MQ=255) tCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGc < 4:82704/128‑1 (MQ=255) ggTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTtcgccgaccttgaacgcgccggccttttcgccgacggcggccaccacgcccgctgcctcgccacctggagagaacggcagcggcggctggaactggtacttgccttc < 4:171071‑M2/148‑108 (MQ=255) cGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGCACCTCGATGCACGCCCTgc < 3:49570/149‑1 (MQ=255) gACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGATCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATGCACCTACGGCACCTCGATGCACGCCCTgc < 1:19251/149‑1 (MQ=255) | AAGCTGCCGGGGTCAACTTCCCCGACACCTTGATCATCGAAGGCAAGTACCAGTTCCAGCCGCCGCTGCCGTTCTCTCCAGGTGGCGAGGCAGCGGGCGTGGTGGCCGCCGTCGGCGAAAAGGCCGGCGCGTTCAAGGTCGGCGACCGGGTCATGGCGCTCACCGGCTG‑GGGTGCGTTCGCCGAGCAAGTGGCGGTGCCGTTCTATAACGTTCTGCCGATCCCGGCGAGCATGGACTTCACCACCGCTGCGGCCTTCGGCATG‑ACCTACGGCACCTCGATGCACGCCCTGC > NC_002947/5942718‑5943008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |