New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2505333 | 32 (0.610) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 10.6% | coding (1120/1146 nt) | yliI | aldose sugar dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2505360 | 37 (0.750) | intergenic (+1/‑41) | yliI/PP_2199 | aldose sugar dehydrogenase/hypothetical protein |
GATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCA > NC_002947/2505213‑2505507 | gATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGAc < 5:8480/148‑1 (MQ=255) cACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGGCTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGt > 8:82535/1‑149 (MQ=255) cGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGa < 5:284289/149‑1 (MQ=255) gAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGa > 1:106896/1‑148 (MQ=255) gCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCg < 3:102297/149‑1 (MQ=255) ggTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAAt < 1:296547/147‑1 (MQ=255) aCCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGc < 1:48567/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTc < 4:116986/132‑1 (MQ=255) cTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTc > 3:116986/1‑132 (MQ=255) cTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATg > 2:176347/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATgg < 2:148620/147‑1 (MQ=255) cgcgTATCCGTAATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCg < 6:215815/149‑1 (MQ=255) tCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCt > 4:40473/1‑101 (MQ=255) tgCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCctc < 8:20592/148‑1 (MQ=255) gggTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTAcc < 5:110350/149‑1 (MQ=255) gTTACATGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCa > 5:224027/1‑149 (MQ=255) cTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCgg < 7:67161/149‑1 (MQ=255) gtatgtaCTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCt < 1:155235/137‑1 (MQ=255) gtatgtaCTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCt > 2:155235/1‑137 (MQ=255) tatgtaCTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGc > 1:180814/1‑149 (MQ=255) aCCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGa > 8:215890/1‑129 (MQ=255) aCCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGa < 7:215890/129‑1 (MQ=255) aCCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTg < 8:166036/147‑1 (MQ=255) tGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGAccc > 8:71701/1‑149 (MQ=255) tGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGAccc > 2:188513/1‑149 (MQ=255) cAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTCCCAGCAAGCCCTGAGCCCTCGGGGGTACGTTGCTGACCGTGc > 8:229698/1‑149 (MQ=255) aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccgctcttcgtgcaccac < 4:306510‑M2/149‑110 (MQ=255) aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAAt < 8:140222/75‑1 (MQ=255) ggATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccgctcttcgtgccccacct < 7:9459‑M2/149‑112 (MQ=255) gcgcgcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccgctcttcgtgcaccaccttgtcg < 4:318021‑M2/149‑117 (MQ=255) cgcgcTACTCAAGTTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGATGGTGACAGTCGGGTAGAATGCg < 1:219162/70‑1 (MQ=255) cgcgcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCg > 2:219162/1‑70 (MQ=255) gcgcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCcgc > 7:178422/1‑149 (MQ=255) gagcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGAGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAACCACTCTTCCAGCAAGCCCAGCGCCCTCGCGGGTACGTTGCTGCCCCTGACAAGGCCagc > 1:307750/3‑149 (MQ=255) aCTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTTGATTGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGAc < 1:98592/129‑1 (MQ=255) aCTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGCCCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGCCCCTGCCCAGGCCCGcgtcgt > 8:131381/1‑149 (MQ=255) aCTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGAc > 2:98592/1‑129 (MQ=255) tCAAGGTCGGCATGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCgtcgtc > 4:140014/1‑148 (MQ=255) cAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCgtcgtc > 1:307436/1‑147 (MQ=255) cAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCgtcgtc > 5:249811/1‑147 (MQ=255) aaGGTCGGCCTGGCCGACTGACgcgcgccatccttgtcatcggtcagtacatacaggtaaccatctggccccacccgcacatcacggatacgcgccttcaggtcaccgagcaaccgctcttcgtgcaccaccttgtcgccatccagtt > 3:318021‑M2/1‑22 (MQ=255) cGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCtt > 2:263557/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGc > 7:291943/1‑148 (MQ=255) tGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc > 6:253484/1‑149 (MQ=255) tGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc < 7:71701/149‑1 (MQ=255) aCGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc > 8:191897/1‑147 (MQ=255) aCGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc > 4:290638/1‑147 (MQ=255) aCGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa < 2:106896/149‑1 (MQ=255) | GATGGCGACAAGGTGGTGCACGAAGAGCGGTTGCTCGGTGACCTGAAGGCGCGTATCCGTGATGTGCGGGTGGGGCCAGATGGTTACCTGTATGTACTGACCGATGACAAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCG‑CCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCA > NC_002947/2505213‑2505507 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |