New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3528142 | 40 (0.770) | 5 (0.100) | 4/252 | NT | 11.6% | coding (1353/1419 nt) | imuB | DNA repair DNA linked protein |
? | NC_002947 | = 3528169 | 38 (0.770) | coding (1380/1419 nt) | imuB | DNA repair DNA linked protein |
ACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTGCGCGCGAGCAGGGCTAC > NC_002947/3528036‑3528312 | aCGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCtt < 1:9289/149‑1 (MQ=255) gccgccTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTg > 6:32732/1‑149 (MQ=255) ccTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGTGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTg > 1:150989/1‑149 (MQ=255) aGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGAGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGggt > 6:18675/1‑149 (MQ=255) cAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGTTGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACGCGTGACGGCGTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGggttggtt < 7:206528/149‑1 (MQ=255) cAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGggttggtt < 3:102570/149‑1 (MQ=255) gCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCa < 5:32732/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCAt < 2:305860/149‑1 (MQ=255) cGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAacac < 4:250572/149‑1 (MQ=255) gAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACAcc > 5:220701/1‑149 (MQ=255) gCATCGAATGCGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCgg < 2:203036/149‑1 (MQ=255) aTCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGTGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGt < 2:150989/149‑1 (MQ=255) tCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGt > 2:265041/1‑148 (MQ=255) aTCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATg < 5:37053/148‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATg > 6:37053/1‑148 (MQ=255) aTCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGc > 5:179340/1‑149 (MQ=255) ggTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAg < 5:142292/149‑1 (MQ=255) gTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGggttgg > 3:43554/1‑119 (MQ=255) gTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGggttgg < 4:43554/119‑1 (MQ=255) gTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATAGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGAGACCTGAGCCACGCCGGTCCGCTTTGGATGCAGGGTTGCTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGc > 4:35001/1‑149 (MQ=255) ggcgATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGTGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTcc < 5:18675/149‑1 (MQ=255) cGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGc > 5:119614/1‑149 (MQ=255) gTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCt > 1:233912/1‑149 (MQ=255) ctacCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAgcgc < 6:104840/147‑1 (MQ=255) ctacCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGcgcg < 2:171138/148‑1 (MQ=255) tacCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGt > 2:126292/1‑149 (MQ=255) ccGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGc > 7:156861/1‑149 (MQ=255) ccGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCAAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGc > 1:70645/1‑149 (MQ=255) cGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCg > 1:132263/1‑149 (MQ=255) gTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCcaggccgtcacgggtttcgatgcggtagtagtcgcgacgcacatcgccgccatcccaccaacctgattcgatgcgttcggcatagccctgcacctggtaggcggcgtcatc < 2:325133‑M2/149‑112 (MQ=255) gTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCcaggccgtcacgggtttcgatgcggtagtagtcgcgacgcacatcgccgccatcccaccaacctgattcgatgcgttcggcatagccctgcacctggtaggcggcgtcatc < 6:117479‑M2/149‑112 (MQ=255) tGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCcaggccgtcacgggtttcgatgcggtagtagtcgcgacgcacatcgccgccatcccaccaacctgattcgatgcgttcggcatagccctgcacctggtaggcggcgtcatc < 4:231572‑M2/148‑112 (MQ=255) ggCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCcaggccgtcacgggtttcgatgcggtagtagtcgcgacgcacatcgccgccatcccaccaacctgattcgatgcgttcggcatagccctgcacctggtaggcggcgtcatccagcg < 5:207078‑M2/149‑117 (MQ=255) ggCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGt < 2:206915/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCcaggccgtcacgggtttcgatgcggtagtagtcgcgacgcacatcgccgccatcccaccaacctgattcgatgcgttcggcatagccctgcacctggtaggcggcgtcatccagcgcgatcggtgc > 1:325133‑M2/1‑23 (MQ=255) gCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTg < 6:119614/149‑1 (MQ=255) gggCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGGCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTgcgc > 8:91114/1‑149 (MQ=255) ggCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGCCTGCAGCGTGGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGGATCCAGCGCGGTCCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTACGGCGTccgcg > 8:239676/1‑149 (MQ=255) ccTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTgcgcgc > 6:34148/1‑148 (MQ=255) ccTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTGcgcgcg > 7:251774/1‑149 (MQ=255) cgcgACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTGCGCGCGAGCAg > 2:281642/1‑149 (MQ=255) gcgACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTGCGCGCGAGCAgg < 6:220701/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCAGGCCGGTCCGCGTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTGCGCGCGAGCAGGGCTAc < 6:179340/149‑1 (MQ=255) | ACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTGCGCGGCTGGGCCTACCGCGACCTGAGCCAGGCCGGTCCGCTTTGGCTGCAGGGTTGGTTCGCATGAACACCCCGGGTTATGCCGAGCTGCATTGCCTTTCCAACTTCAGCTTCCAGCGCGGTGCGTCGAGCGCCGACGAGCTGTTCCGGCGTGCGCGCGAGCAGGGCTAC > NC_002947/3528036‑3528312 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |