New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4763752 | 46 (0.880) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 9.4% | coding (150/1659 nt) | pvdE | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
? | NC_002947 | = 4763793 | 34 (0.690) | coding (191/1659 nt) | pvdE | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
CTGCTCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGACCAGATCGAACGCTACCGCAGC > NC_002947/4763645‑4763938 | cttcTCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGCAGGTTTCGCTCATCCTGGGCATGGTCGGGGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCgg < 4:211416/146‑1 (MQ=255) cTCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgc > 5:40380‑M2/1‑146 (MQ=255) cTCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGg > 2:202323‑M2/1‑146 (MQ=255) tCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctg < 2:59025‑M2/149‑5 (MQ=255) tCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGCTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCACCTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctg < 3:182574‑M2/149‑5 (MQ=255) aaaCCCTGCTGGCCCCTGGGGACGGTTTCGATCAACCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGCCGCTCCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgt > 4:173061‑M2/1‑143 (MQ=255) aaCCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTTGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGCCGTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgtg > 1:169449‑M2/1‑143 (MQ=255) cccTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCct > 5:253804/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgt > 5:300848‑M2/1‑137 (MQ=255) ttCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgt < 6:300848‑M2/142‑6 (MQ=255) ttCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCctgct > 6:131537/1‑149 (MQ=255) tGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGtt > 5:261804/1‑148 (MQ=255) tGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGtt > 3:6668/1‑148 (MQ=255) tGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTc > 8:124712/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGa > 2:171956/1‑149 (MQ=255) tttCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATc > 8:286984/1‑149 (MQ=255) atcatcCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTc < 6:81338/149‑1 (MQ=255) ggCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATg < 4:6668/147‑1 (MQ=255) gCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATggg > 5:185113/1‑148 (MQ=255) gCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGc < 2:319337/149‑1 (MQ=255) cATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCa > 7:42401/1‑149 (MQ=255) aGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGc < 1:59025/147‑1 (MQ=255) aGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGc < 4:99392/147‑1 (MQ=255) cccTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACatcatc < 6:134444/149‑1 (MQ=255) ggCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCaa < 2:155570/120‑1 (MQ=255) ggCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCaa > 1:155570/1‑120 (MQ=255) gACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGCCACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCGCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCCGCACATCATCGCGCGCCTgc > 2:109778/1‑149 (MQ=255) gACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTgc < 5:131537/149‑1 (MQ=255) tCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGt < 7:31617/149‑1 (MQ=255) tCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGt < 4:85766/149‑1 (MQ=255) tCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GCGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGt < 3:64586/149‑1 (MQ=255) cAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGt > 8:168342/1‑148 (MQ=255) aCTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAg < 1:171956/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAg < 6:261804/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgtgcagggccgagttgatggtcgccagcagggcggtgacactgaggccaccgaccatgcccaggatgatcgaaaccgtcaccaggggccag < 4:82189‑M2/148‑95 (MQ=255) gCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTggg < 8:42401/149‑1 (MQ=255) ccTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgtgcagggccgagttgatggtcgccagcagggcggtgacactgaggccaccgaccatgcccaggatgatcgaaaccgtcaccaggg < 1:74995‑M2/140‑90 (MQ=255) ccTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgtgcagggccgagttgatggtcgccagcagggcggtgacactgaggccaccgaccatgcccaggatgatcgaaaccgtcaccaggg > 2:74995‑M2/1‑51 (MQ=255) cacaGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGgctgtgcagggccgagttgatggtcgccagcagggcggtgacactgaggccaccgaccatgcccaggatgatcgaaaccgtcaccaggggccagaagggttt > 3:82189‑M2/1‑47 (MQ=255) cGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGATGTGCCTGCTGGCGCTGTTAAGCTCGATCTGATCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGTCGAGAAGGTGc > 4:122892/1‑149 (MQ=255) ccTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAgcgc < 2:303434/149‑1 (MQ=255) aCTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTgc > 7:176986/1‑112 (MQ=255) aCTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTgc < 8:176986/112‑1 (MQ=255) aaGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGAc < 6:185113/149‑1 (MQ=255) ggC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGACCa < 6:253804/149‑1 (MQ=255) cTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAg > 6:41371/1‑117 (MQ=255) cTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAg < 5:41371/117‑1 (MQ=255) cTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGACCAGATCGAAc < 4:182574/148‑1 (MQ=255) ttttGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGACCAGATCGAACGCTAcc > 4:56587/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAgcgc > 2:297151/1‑121 (MQ=255) gCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAgcgc < 1:297151/121‑1 (MQ=255) cGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGAc > 6:226713/1‑127 (MQ=255) cGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGAc < 5:226713/127‑1 (MQ=255) cGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGATGGCAGCGCCGATCGACCAGATCGAACGCTACCGCAGc > 4:220737/1‑148 (MQ=255) | CTGCTCAAACCCTTCTGGCCCCTGGTGACGGTTTCGATCATCCTGGGCATGGTCGGTGGCCTCAGTGTCACCGCCCTGCTGGCGACCATCAACTCGGCCCTGCACAGCGACACCGGCCTGACTCAAGGC‑GTGGTCCTGGGTTTTGCCGGGCTGTGCCTGCTGGCGCTGTTCAGCTCGATCTGCTCGGACATGGGCACCAACTGGGTCGGCCAGCACATCATCGCGCGCCTGCGCCGTGAGCTGGGCGAGAAGGTGCTGGCAGCGCCGATCGACCAGATCGAACGCTACCGCAGC > NC_002947/4763645‑4763938 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |