| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5666565 | 64 (1.230) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 4.3% | coding (579/1236 nt) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
| ? | NC_002947 | = 5666609 | 74 (1.490) | coding (623/1236 nt) | nhaP | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCG > NC_002947/5666461‑5666748 | aaaCCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTgg > 1:20544/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGACGCCA‑TTGGcg < 8:47229‑M2/149‑3 (MQ=255) ttAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCggtgtg > 7:83416/1‑149 (MQ=255) ttAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCggtgtg > 5:75461/1‑149 (MQ=255) ttAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCggtgtg > 7:96962/1‑149 (MQ=255) ttAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACAGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCggtgtg > 7:162032/1‑149 (MQ=255) accaccATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGtt < 3:78329/149‑1 (MQ=255) caccaTCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGACAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCg < 5:213008/149‑1 (MQ=255) caTCGTCGGCGAGTCACTGTTAAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTAACCGTGTTGCTGGGAATCCTCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATACTGTTAGCCCGCGAGGCCA‑TTGTCGGTGTTGTGTTCGGTg > 2:156439/1‑149 (MQ=255) tagtcgGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTTGc < 4:46409/147‑1 (MQ=255) tcgGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCt > 5:279313/1‑148 (MQ=255) tgTCAGTGTTCTTCGACGGCACGGCAGTCGGGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGTCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGc < 5:302277/148‑1 (MQ=255) ggTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGc < 5:302278/148‑1 (MQ=255) tCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTa > 5:16271/1‑149 (MQ=255) aCTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACg > 8:145130/1‑149 (MQ=255) aCTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACg > 6:202324/1‑149 (MQ=255) cTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCATCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGc < 3:221572/149‑1 (MQ=255) cTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCATCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGc < 3:217367/149‑1 (MQ=255) ttCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCAc < 7:294576/149‑1 (MQ=255) cAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCAcc > 7:52906/1‑148 (MQ=255) cAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAACTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCAcc > 1:243621/1‑148 (MQ=255) aaCGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTa > 3:229469/1‑149 (MQ=255) acgacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAc > 5:261349/1‑149 (MQ=255) cgacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc > 6:318262/1‑149 (MQ=255) cgacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc < 5:153877/149‑1 (MQ=255) cgacgGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTAcc > 8:166381/1‑149 (MQ=255) acggcacggcAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCTCCTACCGc < 2:20544/149‑1 (MQ=255) cacggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGAGAGGCCA‑TTGTCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGa > 5:100841/1‑149 (MQ=255) ggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGcggtgt > 6:309277‑M2/1‑99 (MQ=255) ggcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGcggtgt < 5:309277‑M2/105‑7 (MQ=255) gcaGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCaa < 8:116190/149‑1 (MQ=255) caGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATc > 5:2129/1‑146 (MQ=255) aGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAaga < 7:145130/149‑1 (MQ=255) gTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTc > 4:52813/1‑147 (MQ=255) aCCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTa > 2:237457/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTg > 2:290762/1‑148 (MQ=255) ggCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAg < 6:75461/147‑1 (MQ=255) gaggctatcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAgg < 8:3777/142‑1 (MQ=255) catcatCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCa < 8:96962/149‑1 (MQ=255) catcatCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCa < 6:300873/149‑1 (MQ=255) tcatcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATg < 7:47229/149‑1 (MQ=255) catcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGc > 5:237773/1‑149 (MQ=255) catcCAGCTGGGGGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTAGGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATg < 8:162032/148‑1 (MQ=255) atcCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGc < 1:156439/148‑1 (MQ=255) ccAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCC‑CCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCa > 8:266207/1‑131 (MQ=255) ccAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCC‑CCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCa < 7:266207/131‑1 (MQ=255) cAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGAc < 6:261349/149‑1 (MQ=255) cAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGAc < 6:279313/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACCCGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCt > 6:314415/1‑149 (MQ=255) ggTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgc > 4:30190/1‑149 (MQ=255) ggTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgc > 3:75355/1‑149 (MQ=255) tGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGgcgc > 7:139447/1‑149 (MQ=255) aaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgacttgccgacgatggtggtttt < 8:33945‑M2/147‑97 (MQ=255) aaCACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTg < 8:139447/148‑1 (MQ=255) acacCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCATTTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCATGAGTGTCGAGCAGTACCTGGTGGAGGTCATGCTGCCCCTGGCGCTgg > 1:234880/1‑149 (MQ=255) acacCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgactcgccgacgatggtggttttaag < 1:190878‑M2/149‑100 (MQ=255) cacCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTc > 7:63866/1‑107 (MQ=255) cacCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTc < 8:63866/107‑1 (MQ=255) acCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTaa > 2:12536/1‑149 (MQ=255) gAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCg < 8:83416/149‑1 (MQ=255) aGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGcggtgtttcacccagctggatgatgcccagcaacacggtgaataccacgactgccgtgccgtcgttgaacagtgacttgccgacgatggtggttttaagcggttt > 7:33945‑M2/1‑44 (MQ=255) gCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCggt < 6:16271/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCggtg < 5:202324/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCggtg < 4:229469/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCggtgg < 4:75355/149‑1 (MQ=255) gCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCTAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTc < 1:51829/149‑1 (MQ=255) gCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTc > 2:261980/1‑149 (MQ=255) gCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTc < 4:253475/149‑1 (MQ=255) ccGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCg > 3:244425/1‑149 (MQ=255) ccGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCg < 6:2129/149‑1 (MQ=255) cacGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCaa < 8:52906/149‑1 (MQ=255) ggCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAAtgt < 5:314415/149‑1 (MQ=255) ggCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAAt < 1:126680/147‑1 (MQ=255) ggCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAAt > 2:126680/1‑147 (MQ=255) tCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTAc < 7:52329/149‑1 (MQ=255) tCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTAc > 2:41888/1‑149 (MQ=255) tCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTAc > 6:222004/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAg > 1:51149/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAg > 7:170335/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCt < 2:243621/149‑1 (MQ=255) ttCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCt < 3:30190/149‑1 (MQ=255) cccGCGCGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCAt < 5:318262/149‑1 (MQ=255) cccGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCAt < 4:244425/149‑1 (MQ=255) gAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTc < 1:290762/149‑1 (MQ=255) aGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCg < 1:237457/149‑1 (MQ=255) | AAACCGCTTAAAACCACCATCGTCGGCGAGTCACTGTTCAACGACGGCACGGCAGTCGTGGTATTCACCGTGTTGCTGGGCATCATCCAGCTGGGTGAAACACCGAGCATGGCCGACACGGCGATCCTGTTCGCCCGCGAGGCCA‑TTGGCGGTGTGGTGTTCGGTGGCCTGATCGGCTACGCCACCTACCGCATGATCAAGAGTGTCGAGCAGTACCAGGTGGAGGTCATGCTGACCCTGGCGCTGGTAATCGGTGGTTCGGCAATGTGCTACGAGCTGCATGTGTCG > NC_002947/5666461‑5666748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |