New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 115374 | 56 (1.140) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.5% | coding (741/1080 nt) | PP_0109 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 115409 | 51 (1.100) | coding (776/1080 nt) | PP_0109 | membrane protein |
GCCTGCATCGACCTGCCGACCTGCCATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACGTGGTGTTCCA > NC_002947/115231‑115520 | gCCTGCATCGACCTGCCGACCTGCCATGGCCAGTGGTGGCCAGCTTCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCAGATCAGCCACAg < 6:131296/149‑1 (MQ=255) aTCGACCTGCCGACCTGCCATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCCCGTACGGCCCTCCACATCCGCCACAGGCTggg > 2:196625/1‑149 (MQ=255) cctgccgacctgccATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGgcgcgc < 3:166352/149‑1 (MQ=255) tgccgacctgccATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCgctg > 4:192696/1‑149 (MQ=255) cgacctgccATGGCGAGGGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGctgctg < 8:274634/149‑1 (MQ=255) acctgccATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGt < 3:192696/149‑1 (MQ=255) acctgccATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGt < 7:213236/149‑1 (MQ=255) cctgccATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGt > 8:99942/1‑148 (MQ=255) aTGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCAGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTGGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCGGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGc < 1:196625/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGtg > 8:274890/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGt > 2:96319/1‑137 (MQ=255) cAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGt < 1:96319/137‑1 (MQ=255) aGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCACCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGGCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTg > 8:84974‑M2/1‑148 (MQ=255) tggtggCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTgct > 7:99942‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTgctgatg < 5:8929‑M2/149‑8 (MQ=255) gCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGctgctg > 7:98276/1‑127 (MQ=255) gCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGctgctg < 8:98276/127‑1 (MQ=255) ccAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCt < 7:274890/149‑1 (MQ=255) aGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCagcacgcaggtcaccagcagcgcgcccagcctgtggctgatgtgga < 1:268949‑M1/149‑47 (MQ=255) cTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGc > 4:11940/1‑149 (MQ=255) tGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGAACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGCCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCt > 8:229/1‑149 (MQ=255) cGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTg < 3:62627/148‑1 (MQ=255) cGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTg > 1:163946/1‑148 (MQ=255) cAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑Tg > 5:63137/1‑148 (MQ=255) aGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑Tg > 2:216148/1‑147 (MQ=255) aGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑Tg < 1:216148/147‑1 (MQ=255) cAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGa > 7:227640/1‑113 (MQ=255) cAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGa < 8:227640/113‑1 (MQ=255) cTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCtgtg < 6:63137/149‑1 (MQ=255) ttCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCagcacgcaggtcaccagcagcgcgcccagcctgtggctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtc > 5:133302‑M1/1‑81 (MQ=255) ttCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTgg > 2:245865/1‑149 (MQ=255) cACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCagcacgcaggtcaccagcagcgcgcccagcctgtggctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaa < 6:133302‑M1/149‑72 (MQ=255) cACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGtct < 3:159590/149‑1 (MQ=255) cACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGtct > 4:159590/1‑149 (MQ=255) cccAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGc < 1:175927/149‑1 (MQ=255) cccGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTc < 4:177316/147‑1 (MQ=255) gTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTcgcg > 4:167877/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCgg > 1:296208/1‑149 (MQ=255) cGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGc < 3:11940/149‑1 (MQ=255) gCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTg > 6:164187/1‑149 (MQ=255) ccccAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTgg > 8:286226/1‑149 (MQ=255) ccccAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTgg > 6:261818/1‑149 (MQ=255) ccAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGtg > 1:191485/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTgctgct < 3:167877/148‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTgctgg > 1:184917/1‑149 (MQ=255) ggCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACACCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTgctggcgc < 5:261818/148‑1 (MQ=255) aGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTg < 7:229/149‑1 (MQ=255) ttGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTgctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaactgcccgccaaggtaattggggccgacgtgctgggtcaggtg < 6:133302‑M2/149‑79 (MQ=255) gACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTgctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaactgcccgccaaggtaattggggccgacgtgctgggtcaggtggaa > 5:133302‑M2/1‑68 (MQ=255) tGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCTGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGcc > 7:264374/1‑149 (MQ=255) tGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGcc > 4:195647/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAACTCTTGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGc < 1:245865/148‑1 (MQ=255) aTGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTg > 8:149434/1‑149 (MQ=255) tGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTgg < 5:42084/149‑1 (MQ=255) tACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCa < 7:286226/149‑1 (MQ=255) ggCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGc > 4:186915/1‑148 (MQ=255) cATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTg > 8:188372/1‑136 (MQ=255) cATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTg < 7:188372/136‑1 (MQ=255) tCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTgctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaactgcccgccaaggtaattggggccgacgtgctgggtcaggtggaagccgttgctgaagtccgcagct < 1:268949‑M2/149‑104 (MQ=255) tCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACgtg < 5:164187/149‑1 (MQ=255) cacaTCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGtgct < 5:63199/44‑1 (MQ=255) cacaTCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGtgct > 6:63199/1‑44 (MQ=255) acaTCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACgtggtg < 2:184917/149‑1 (MQ=255) caTCAGCagcacgcaggtcaccagcagcgcgcccagcctgtggctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaactgcccgccaaggtaattggggccgacgtgctgggtcaggtggaagccgttgctgaagtccgcagctggcc < 5:8929‑M1/149‑143 (MQ=255) caTCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACGTGgtgt < 2:191485/149‑1 (MQ=255) caTCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACGTGgtgt > 4:95594/1‑149 (MQ=255) aTCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACGTGGTGtt < 2:163946/149‑1 (MQ=255) agcagcacgcaggtcaccagcagcgcgcccagcctgtggctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaactgcccgccaaggtaattggggccgacgtgctgggtcaggtggaagccgttgctgaagtccgcagctggccacca > 7:99942‑M1/1‑3 (MQ=255) cagcacgcaggtcaccagcagcgcgcccagcctgtggctgatgtggatggccgtacgcgcatcactgtccaactgcccgccaaggtaattggggccgccgtgctgggtcaggtggaagccgttggtgaagtccgcagctggccaccact > 8:84974‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCCTGCATCGACCTGCCGACCTGCCATGGCCAGTGGTGGCCAGCTGCGGACTTCAGCAACGGCTTCCACCTGACCCAGCACGTCGGCCCCAATTACCTTGGCGGGCAGTTGGACAGTGATGCGCGTACGGCCATCCACATCAGCCACAGGCTGGGCGCGCTGCTGGTGACCTGCGTGCTGCTGATGCTCAGCTGGAA‑GC‑TGCACCGCTGTGGTCTCCCCGGCCTGTCGCGGCTGGTGCTGCTGGCGCTGGCCTTGCAAGTGGGCCTGGGCATCAGCAACGTGGTGTTCCA > NC_002947/115231‑115520 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |