New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1025257 | 37 (0.760) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 9.3% | intergenic (‑111/+118) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 1025369 | 42 (0.880) | intergenic (‑223/+6) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATT > NC_002947/1025118‑1025404 | gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCt > 3:192661/1‑149 (MQ=255) tGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCct < 7:163077/149‑1 (MQ=255) gCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATAACGCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGTCCGTTCTGGcc > 1:102661/1‑148 (MQ=255) tCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATAGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTT > 5:310766‑M1/1‑130 (MQ=255) tCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATAGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTT < 6:310766‑M1/130‑1 (MQ=255) aaGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTcgc < 6:163795/148‑1 (MQ=255) gTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGc > 8:166015/1‑149 (MQ=255) gAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCACTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGc > 4:83614/1‑147 (MQ=255) tttCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGc > 8:220053/1‑149 (MQ=255) tCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGcg > 5:18524/1‑147 (MQ=255) cAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGcga < 6:18524/148‑3 (MQ=255) cAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTcc > 1:288384/1‑149 (MQ=255) gTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCt > 8:184604/1‑147 (MQ=255) aaGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGt < 2:288384/148‑1 (MQ=255) gCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAgg < 3:177764/149‑1 (MQ=255) cccTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTgg < 2:17599/112‑1 (MQ=255) cccTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTAGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTgg > 1:17599/1‑112 (MQ=255) ctttctttTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGgcg > 4:211735/1‑147 (MQ=255) tttcttttctAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAg > 2:108597/1‑149 (MQ=255) ttttctAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTACTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTc > 3:37290/1‑149 (MQ=255) gTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAAc < 7:220053/147‑1 (MQ=255) gTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGGTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAAc < 7:166015/147‑1 (MQ=255) ccggccTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTagccagtaccggcctcttcgcgggcaagcccgctcccacaggatctcgacaggttcggacactgcgccc > 7:105103‑M1/1‑80 (MQ=255) ccTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCt > 6:311419/1‑149 (MQ=255) ttGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGGCCGAACCTGTCGAGATCCtgt > 2:234775/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTagccagtaccggcctcttcgcgggcaagcccgctcccacaggatctcgacaggttcggacactgcgccctacctgagggag > 6:75910‑M1/1‑68 (MQ=255) gCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCGCAGGTAGGGCGGAGTGTGCGAACCTGTCGCGATCCTGTGGgcgc > 7:256642/1‑149 (MQ=39) cGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTagccagtaccggcctcttcgcgggcaagcccgctcccacaggatctcgacaggttcggacactgcgccctacctgagggagcg < 5:75910‑M1/149‑84 (MQ=255) cGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCgg < 1:108597/149‑1 (MQ=255) gggTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCggg < 7:184604/149‑1 (MQ=255) ggTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTagccagtaccggcctcttcgcgggcaagcccgctcccacaggatctcgacaggttcggacactgcgccctacctgagggagcggg < 8:105103‑M1/149‑86 (MQ=255) ggggTGTTGCCAGGGGTGCCGCGTGTTGGC‑CGGGATGATTCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCTCCGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCTAGATCCTGTGGGAGGGGGCTTGCCCGCGa < 8:256642/147‑1 (MQ=255) cGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCTGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGaa < 3:83614/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAag < 2:102661/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAACCCCCACCCACACGTAGGGCGCAGGGTCCGAACCAGTGGAGATACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGGGAAGAGGCCg > 2:111613/1‑149 (MQ=255) cgcgGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGACGCCGGTTCTGGCTaa < 1:167816‑M2/149‑3 (MQ=255) tCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTaa > 3:250989/1‑149 (MQ=255) c‑cGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATc > 3:66220/1‑148 (MQ=255) ggtaGATTCGGGGCTTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCCGGTTGGGCGCAGTGTCCTAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAaca < 4:66220/146‑1 (MQ=38) cAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACt > 7:232734/1‑149 (MQ=255) tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAagag > 2:80673/1‑114 (MQ=255) tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAagag < 1:80673/114‑1 (MQ=255) tCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGAGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCacac > 4:252326/1‑149 (MQ=255) gggCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCg > 8:160025/1‑148 (MQ=255) ttagccagaaccggcgtcttcgcgggcatgcccgctcccacaggatctcgacaggttcggacactgcgccctacctgagggagcgggcttgcccgcgaagaggccagaacggccaacacaacgccccgattctgcccggcgatcccgcg < 1:167816‑M1/149‑148 (MQ=255) | GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGC‑CGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATT > NC_002947/1025118‑1025404 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |