New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1098363 | 44 (0.900) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 7.9% | coding (216/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
? | NC_002947 | = 1098419 | 51 (1.080) | coding (160/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
GCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGTGA > NC_002947/1098219‑1098511 | gCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGc < 2:128612/149‑1 (MQ=255) cGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCg > 2:118183/1‑149 (MQ=255) aggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTgcg > 4:105474/1‑149 (MQ=255) cgtcgCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTc < 6:257489/127‑1 (MQ=255) cgtcgCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTc > 5:257489/1‑127 (MQ=255) gtcgCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGc > 5:282769/1‑149 (MQ=255) gCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggt < 3:247665/149‑1 (MQ=255) cACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtgg > 3:195435/1‑149 (MQ=255) gATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACg > 7:203635/1‑149 (MQ=255) cATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGcc > 6:201780/1‑149 (MQ=255) aGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg < 3:156394‑M2/149‑2 (MQ=255) aGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg < 5:71540‑M2/149‑2 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg > 3:83903‑M2/1‑147 (MQ=255) ccAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAg > 8:160252/1‑148 (MQ=255) aGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCAt < 6:282769/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTg < 1:118183/148‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGa < 7:160252/149‑1 (MQ=255) gCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGAt > 4:251499/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTc < 7:409/121‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTc > 8:409/1‑121 (MQ=255) cAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCt > 8:83259/1‑149 (MQ=255) ggCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTgg > 7:251426/1‑149 (MQ=255) ggCCATCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTgg > 2:133409/1‑149 (MQ=255) gTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgg > 2:103559‑M1/1‑64 (MQ=255) gTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgg < 1:103559‑M1/121‑58 (MQ=255) gCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAgg < 3:251499/149‑1 (MQ=255) caccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTAt > 7:178871/1‑149 (MQ=255) caccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTAt > 3:249359/1‑149 (MQ=255) accaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAgg > 8:37743/1‑144 (MQ=255) accaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAgg < 7:37743/144‑1 (MQ=255) tcctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt < 8:203635/149‑1 (MQ=255) tcctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCt < 3:105474/148‑1 (MQ=255) ctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTg > 4:263299/1‑148 (MQ=255) ctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGa < 3:263299/149‑1 (MQ=255) tccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAg < 8:143707/131‑1 (MQ=255) tccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGAATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGaa > 6:258199/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGaa < 1:133409/147‑1 (MQ=255) cGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGa > 7:261641/1‑95 (MQ=255) cGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGa < 8:261641/95‑1 (MQ=255) cGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTc > 3:39256/1‑149 (MQ=255) ggTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggcc > 2:237273‑M1/1‑32 (MQ=255) ggTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggcc < 1:237273‑M1/92‑61 (MQ=255) gTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTc < 8:70747/133‑1 (MQ=255) gTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTc > 7:70747/1‑133 (MQ=255) agGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCt < 5:201780/149‑1 (MQ=255) agGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTc > 8:50045/1‑149 (MQ=255) gTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTc > 6:258054/1‑147 (MQ=255) gTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGa < 7:83259/149‑1 (MQ=255) gggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGaa < 4:195435/149‑1 (MQ=255) ggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAg < 6:71540/149‑1 (MQ=255) ggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAg < 4:156394/149‑1 (MQ=255) aCCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTa > 2:36249/1‑147 (MQ=255) gAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGgc < 5:258199/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctacc > 2:237273‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctacc < 1:237273‑M2/92‑33 (MQ=255) gCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCg < 4:249359/147‑1 (MQ=255) gCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGt < 8:251426/149‑1 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagct < 5:71540‑M1/149‑149 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagct < 3:156394‑M1/149‑149 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc > 3:83903‑M1/1‑1 (MQ=255) ccGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgac < 1:103559‑M2/121‑65 (MQ=255) ccGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgac > 2:103559‑M2/1‑57 (MQ=255) ccGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGt > 6:277253/1‑147 (MQ=255) ccGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGTGa < 1:36249/149‑1 (MQ=255) | GCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCAC‑GGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGTGA > NC_002947/1098219‑1098511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |