New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1167535 | 43 (0.880) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.6% | coding (479/729 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
? | NC_002947 | = 1167560 | 44 (0.960) | coding (504/729 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
TGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGC > NC_002947/1167403‑1167683 | tGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAg > 3:117155/1‑147 (MQ=255) tACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAgg > 2:294303/1‑149 (MQ=255) agcagGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAg < 8:213501/144‑1 (MQ=255) agcagGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAg > 7:213501/1‑144 (MQ=255) ggCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACc < 5:26396‑M2/149‑2 (MQ=255) gCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACct > 4:117155‑M2/1‑147 (MQ=255) ggAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTc > 6:239794/1‑122 (MQ=255) ggAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTc < 5:239794/122‑1 (MQ=255) aCCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGgtccaggcctgcttccaggttgggactggcgggg < 3:242758‑M1/149‑35 (MQ=255) aCCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGc < 8:293317/149‑1 (MQ=255) cTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGATGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGcc > 6:125709/1‑148 (MQ=255) tGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGctgcc > 2:38944/1‑149 (MQ=255) gcTCAAAGCTGACCGGGCGTTGGCCGGGGTACCGCCGAGCGCCGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGCCGATGGCCATCCCGCATCGATGTTCCCCGCCAGTCCCACCCTGGACGAAGGCCTGGACCTGGCGGCCCCACGCCGctgcgtgc > 2:226804/1‑149 (MQ=255) gcTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGctgcctgc > 2:128066/1‑149 (MQ=255) gcTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGctgcctgc < 1:147322/149‑1 (MQ=255) gcTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGctgcctgc < 3:201108/149‑1 (MQ=255) aaaGCTGACCTGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGAt > 4:66612/1‑149 (MQ=255) aaGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATg < 4:1456/149‑1 (MQ=255) cTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGgtccaggcctgcttccaggttgggactg > 1:170525‑M1/1‑91 (MQ=255) cTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGgtccaggcctgcttccaggttgggactg < 2:170525‑M1/119‑29 (MQ=255) cTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGc > 3:31373/1‑148 (MQ=255) cTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGc < 4:31373/148‑1 (MQ=255) cTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCg > 8:153918/1‑149 (MQ=255) cGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcgg < 3:282063‑M2/107‑8 (MQ=255) cGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcgg > 4:282063‑M2/1‑100 (MQ=255) cGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCg > 7:151209/1‑148 (MQ=255) ccgccgATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAgcg > 5:35130/1‑149 (MQ=255) cgccgATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAgcgc < 6:26396/149‑1 (MQ=255) gccgATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGcc > 5:195773/1‑149 (MQ=255) gATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGt > 3:203641/1‑149 (MQ=255) gACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGa < 3:66612/148‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCTCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGa < 5:125709/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTTCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGa < 1:226804/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGa < 1:222817/149‑1 (MQ=255) gctggtgctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGAccc > 8:2312/1‑149 (MQ=255) ggtgctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAgcgc < 5:219024/133‑1 (MQ=255) ggtgctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAgcgc > 6:219024/1‑133 (MQ=255) gctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCgc > 2:88477/1‑149 (MQ=255) gtgctgtgCGACGATGGCCATCCCGCCGGGCTGGTCCCCGCCAGTCCCAACCTTGCAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCgctgct < 4:212840/142‑1 (MQ=255) gCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGctgctg < 6:35130/149‑1 (MQ=255) gCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAgc > 3:211457/1‑149 (MQ=255) ggCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCtt > 5:104937/1‑149 (MQ=255) gCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTc < 6:195773/149‑1 (MQ=255) cATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCAt > 4:123622/1‑149 (MQ=255) aTACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATc < 6:104937/149‑1 (MQ=255) tACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATcg < 8:151209/149‑1 (MQ=255) cGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGa > 5:66699/1‑110 (MQ=255) cGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGa < 6:66699/110‑1 (MQ=255) cGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGctgtct > 2:154/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGctgtc < 7:2312/147‑1 (MQ=255) ccccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcggccaaggcctggtcagctttgagcgcagctgcatcaaggt < 3:242758‑M2/149‑116 (MQ=255) cccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAg < 1:294303/148‑1 (MQ=255) cccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAg < 7:153918/148‑1 (MQ=255) ccGCCAGgtccaggcctgcttccaggttgggactggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcg < 3:282063‑M1/107‑101 (MQ=255) ccGCCAGgtccaggcctgcttccaggttgggactggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcg > 4:282063‑M1/1‑7 (MQ=255) cacAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCCGGCCCACGACGGAGCCAGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTGCGCTGCTGGCCCGCGCGGCCTTCATCCCGCTGTCTGTGAAAGGc > 3:181990/3‑147 (MQ=255) ccAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAg > 2:8461/1‑149 (MQ=255) cAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcggccaaggcctggtcag > 1:170525‑M2/1‑28 (MQ=255) cAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcggccaaggcctggtcag < 2:170525‑M2/119‑92 (MQ=255) cAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAgg < 4:154759/149‑1 (MQ=255) aGgtccaggcctgcttccaggttgggactggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcggccaaggcctggtcagctttgagcgcagctgcatcaaggttctccgc > 4:117155‑M1/1‑2 (MQ=255) ggtccaggcctgcttccaggttgggactggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcggccaaggcctggtcagctttgagcgcagctgcatcaaggttctccgcc < 5:26396‑M1/149‑149 (MQ=255) | TGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGC > NC_002947/1167403‑1167683 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |